Basic Information
Symbol
CCDC66
RNA Class
mRNA
Alias
coiled-coil domain containing 66
DKFZp686C0433
coiled-coil domain-containing protein 66
Coiled-coil domain-containing protein 66
Location (GRCh38)
3:56557161-56621837
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001141947.3
Sequence length
3134 nt
GC Content
0.3772
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-677.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-736.97 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1000.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001012506.5 | AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… | 3145 nt | 0.3755 |
| NM_001141947.3 | GAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGGGGCUUGAGCGUUCUGUGGA… | 3134 nt | 0.3772 |
| NM_001353147.1 | AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… | 3182 nt | 0.3771 |
| NM_001353148.1 | AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… | 3146 nt | 0.3757 |
| NM_001353149.1 | AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… | 3143 nt | 0.3767 |
| NM_001353150.1 | AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… | 3095 nt | 0.3758 |
| NM_001353151.1 | AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… | 3138 nt | 0.3779 |
| NM_001353152.1 | AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… | 3315 nt | 0.3774 |
| NM_001353153.1 | AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… | 3174 nt | 0.3774 |
| NM_001353154.1 | AAUUGGCGUAGCGCUUGCUGAGCGGCGGCGGCAACCGACGUACACAAGG… | 3035 nt | 0.3740 |
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary
Enables microtubule binding activity. Involved in cilium assembly; microtubule bundle formation; and regulation of protein localization to cilium. Located in several cellular components, including Flemming body; microtubule cytoskeleton; and photoreceptor inner segment. [provided by Alliance of Genome Resources, Nov 2024]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
