Basic Information

Symbol
CCNI
RNA Class
mRNA
Alias
cyclin I CCNI1 CYC1 CYI cyclin-I cyclin ITI Cyclin-I
Location (GRCh38)
4:77047155-77076319 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001348132.2
BLAST PRIMER
NM_001348133.2
BLAST PRIMER
NM_001348134.2
BLAST PRIMER
NM_001348135.2
BLAST PRIMER
NM_001348136.2
BLAST PRIMER
NM_001348137.2
BLAST PRIMER
NM_001348138.2
BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
NM_001348140.2
BLAST PRIMER
NM_006835.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_006835.3
Sequence length
2759 nt
GC Content
0.4484

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-828.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -884.9 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 591.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001348132.2 CUCCCUCCCCAGCCUUCCCCGCGAGCGGACGCGGCAGCGCCUCUGUCUC… 2755 nt 0.4483
NM_001348133.2 AAAUAACUGGAAUUUGAAAGGAGGACAGAGGAGCCUCCGCUGGAGCUAG… 2362 nt 0.3997
NM_001348134.2 CUCCCUCCCCAGCCUUCCCCGCGAGCGGACGCGGCAGCGCCUCUGUCUC… 2602 nt 0.4477
NM_001348135.2 CUCCCUCCCCAGCCUUCCCCGCGAGCGGACGCGGCAGCGCCUCUGUCUC… 2636 nt 0.4518
NM_001348136.2 CUCCCUCCCCAGCCUUCCCCGCGAGCGGACGCGGCAGCGCCUCUGUCUC… 2630 nt 0.4502
NM_001348137.2 CUCCCUCCCCAGCCUUCCCCGCGAGCGGACGCGGCAGCGCCUCUGUCUC… 2543 nt 0.4538
NM_001348138.2 CUCCCUCCCCAGCCUUCCCCGCGAGCGGACGCGGCAGCGCCUCUGUCUC… 2757 nt 0.4483
NM_001348139.2 CUCCCUCCCCAGCCUUCCCCGCGAGCGGACGCGGCAGCGCCUCUGUCUC… 2414 nt 0.4561
NM_001348140.2 CUCCCUCCCCAGCCUUCCCCGCGAGCGGACGCGGCAGCGCCUCUGUCUC… 2680 nt 0.4481
NM_006835.3 CUCCCUCCCCAGCCUUCCCCGCGAGCGGACGCGGCAGCGCCUCUGUCUC… 2759 nt 0.4484
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the highly conserved cyclin family, whose members are characterized by a dramatic periodicity in protein abundance through the cell cycle. Cyclins function as regulators of CDK kinases. Different cyclins exhibit distinct expression and degradation patterns which contribute to the temporal coordination of each mitotic event. This cyclin shows the highest similarity with cyclin G. The transcript of this gene was found to be expressed constantly during cell cycle progression. [provided by RefSeq, Jan 2017]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image