Basic Information
Symbol
CCT3
RNA Class
mRNA
Alias
chaperonin containing TCP1 subunit 3
Cctg
chaperonin containing TCP1, subunit 3 (gamma)
CCT-gamma
PIG48
TCP-1-gamma
TRIC5
T-complex protein 1 subunit gamma
T-complex protein 1, gamma subunit
TCP1 (t-complex-1) ring complex, polypeptide 5
chaperonin containing T-complex polypeptide 1 subunit 3
hTRiC5
CCTG
Chaperonin containing T-complex polypeptide 1 subunit 3
Location (GRCh38)
1:156308960-156367873
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_005998.5
Sequence length
1977 nt
GC Content
0.5063
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-664.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-700.18 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
540.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001008800.3 | GUAAGCCCUGAGGAGGCAGCGUUUUCUGGGCUUCUGUCUGGUUCUCUCU… | 1863 nt | 0.5094 |
| NM_001008883.1 | GGCCGUUCUUGCGUAGGGGGCGGGACUAAGGCUGUCAAUUGGUCUGUUU… | 2093 nt | 0.5079 |
| NM_005998.5 | GUAAGCCCUGAGGAGGCAGCGUUUUCUGGGCUUCUGUCUGGUUCUCUCU… | 1977 nt | 0.5063 |
Summary
The protein encoded by this gene is a molecular chaperone that is a member of the chaperonin containing TCP1 complex (CCT), also known as the TCP1 ring complex (TRiC). This complex consists of two identical stacked rings, each containing eight different proteins. Unfolded polypeptides enter the central cavity of the complex and are folded in an ATP-dependent manner. The complex folds various proteins, including actin and tubulin. Alternate transcriptional splice variants have been characterized for this gene. In addition, a pseudogene of this gene has been found on chromosome 8. [provided by RefSeq, Aug 2010]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
