Basic Information

Symbol
CD3G
RNA Class
mRNA
Alias
CD3 gamma subunit of T-cell receptor complex CD3-GAMMA CD3GAMMA T-cell surface glycoprotein CD3 gamma chain CD3g antigen, gamma polypeptide (TiT3 complex) CD3g molecule, gamma (CD3-TCR complex) CD3g molecule IMD17 T3G CD3g molecule, epsilon (CD3-TCR complex) T-cell antigen receptor complex, gamma subunit of T3 T-cell receptor T3 gamma chain CD3g antigen
Location (GRCh38)
11:118344344-118355161 UCSC Genome Browser

Secondary Structure

MANE Select
NM_000073.3
Sequence length
2690 nt
GC Content
0.4019

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-701.12 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -757.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 694.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((....(((((((((((.((((((.(.((.((((((........)))))))).)((((((((.((.((((.(((..(((((..(((((......)))))..)))))((((....((((....)))).....))))))))))).))......((((....))))((((((((((((((((.....))))))..((..((((((.(.......)))))))))....((((((....((((((((((((((((.......((((((((.........................)))))))).(((((.((((.(((((((((((((((..(((....(((((((.......((((....((((...))))......((((...((((((.(((((((......)))))))........)))))).))))...((((((.....))))))((((((((((((..((((((((..((((((((.........))))))))..))).....(((((((((....(((((...)))))......)))..)))))).)))))....)))))).))))))((.(((((((...(((.(((...)))......(((((((((((.((((((((((((....((((((...(((......))).))))))((((.(((((((((......)).)))))))..))))....((((((.((((((.((..(((....))).)).))))))((((((..((....((((..........)))).....))..))))))....(((((((.((((.(((((.(((((.(((.((((((((((.((((.((.((.(((((((((((((((((.................((((((..((....)))))))).))))))))))((.((((((((((.(((.........))).)))))))))).)).(((((..........(((....)))...........))))).........))))))).....)).))...)))).))))))...)))).......))).))))).))))).)))).)))))))((((((((.........))))))))...(((((((((.(......))).)))))))..)))))).)))))))))))).......)))).))))))).((((((....))))))...((((..............))))(((((...........)))))...((((((((...)))))))))))...))))))))).......)))).....)))))))...)))((((((((.....)).))))))....((((((((......))))))))...................)))))))))))..))))..)))).)))))...((((......)))).................))))))..))).)))))))...)))))).....))))))))))(((((((((((.((((......))))..((((......))))...((((((((((...((((....(((((((......)))))))..((((........))).)((((((((.((((..((..(((...........)))))..)))).....(((((((.....))))))))))))))).........)))).))))))))))((((.......))))....................)))))))))))))))))))........(((((.......))))).....))))))...)))...((((.((((((((...............................................))))))))))))...(((((.((.((((((((.(((((((((((((.((.......))))))))))..)))))...))))))))))))))).......)))..)))))....))))))).)))))...(((....))).....((((((((((...((((((((((((((((....((((((((.....(((((.........((((((......)).))))((.((((.(((...)))...)))).))(((((((.......)))).)))..(((((......))))).....((((((......))))))(((((.(((((((((((....(((((.....))))).....))))))))....)))...))))).....)))))....)))))))).....))))))))).....(((((((((...........((((((....(((((((((((((..((((((((((((((((.(..((((..(((..........)))..))))..).)))...((.((((((...)))))).)).(((((..((((((...(((.(((((.((...((((......))))...)).))))).))).))))))..))))).))))))))))))).........)))))))))))))...............((((((..(((((((..................)))))))..))))))....(((((........))))).............(((.((((..(....)..)))).)))......))))))..........)))))))))............))))))).....)))...))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((....(((((((({(({(((,((({{(,{((((((,,...,..||,,,})},.((((({((,((.(((,.(((..(((((,.(((((......))))),.))))){|||,,,.||||,,,,.,)),.,,,))))))))))}.||....{,(({(.,,,)))}((((((((((((((((.....)))))),.((..((((((.(.......)))))))))....((((((....((((((((((((((((..,,...((((((({......,,{.............,,,)))))))).(((((.((((.(((((((((((((((.,({(....(((((((.,,.....,........(((((..(((..,.{(({,{{{(,,.,..(((((((......)))))))....}}},}}}|||,.{((((((((((.....((((...((((((((((((,,,.,((((,,,...,,,,,({{((.(({{((((((((.((..(((,{,....}}.)))..)).))))))))},})},,)),}}))),,,,.,)))}}}.)))))).))))))..))))..,,.,,{{...,{,,..||,,....|,,,(((((((...((((,(.(((((......))))).,).)))))))))))....,{||,{((((((({......)).))))))|,.|||},.})))))))))},,,,.||,,{{,....},}.|,..,})}}.}||}},,,,}))..))))).,,...(((((.(((((((({...{((,((((((.(((((........................))))).)))))).)).||....||(({.{{{(({((,{,((((({(((({{,{(((((..((....)))))))},{{{{{....,||||||{{{{{{{.{{|,,,,,,,,,}}}.,}}))))))},}|||{(((........,,{{(|...||,...........}}},}.,,,.||,...})}}|{{{{{{{,,,,,.,,..{(((((......))}}}},,.,,..,,,,,,,,,,.........,||||(((..,.{,,,||,,((((((({.({..(((((((((.(......))).)))))))...)).)}},.,})))).,,,}}}},,.,,}||{{{..,..((((((....))))))...,}))},............|||||{{|{.....,.....}}))},},)})))))}))))))))).)))))...}}((((..,.......))))....)))))))...}}}((((((((.....}).))))))....{{((((,{...,,,),}},||(((......)))}}...,,.)))))))))))..))))..)))).))))),,.((((......)))).}}....,,.,,,....))))))..))))))}))))...)))))).....,)))))))))((({(((((({{(((..{{{{{{,||..((({......)))}..,((((((((((...,,{{,,..,{{({{{..,||,|,,|,,,...{{{......,,}}},}{{||{{{{.({((,,{(,.({,..,,,....,,)},}}..)))).....(((((((.....)))))))}}}}}}}}..........,,..})))))))))|,}}})))...)))).,,,..,},,,,........})))}))))))|||}}}}),}..,,..{((((.......))))}..,,.))))))...,},....||}}}}..{(({.....,,,...........................................}}||.{((({{..(((.((.((((((((.(((((((((((((.((.......))))))))))..)))))...)))))))}))))))))))},,.)))..)))))....))))))),}))))...(((....))).....(((((((((({({((((((({..((((.(((((((((,{(((((....}))),.||.,(((((((({.....,,,,,,.((((.(((((((({{{,...((((...(((((((.......))))},))..(((((......)))))...))))|},}})..)))).))).)))).{{{{(((({{....|}}}}|((((..,|}}}...|}||}}}||,,,,||,,,.(((((,..,(((((((((...((((((((,,,{{,,.{{{,,......,.,|,{{,....,,|||.{(((((((((...{,{||||,{((((((((......(((((.{..((((..(((..........)))..))))..}.)))))..,,.,,|..}}})))))}..,..,}))}.)))))))))}..,|((({.{,...{{((,.....)))),..,,.}}}},...))))))))...)))))))))))))))..,,,...||{{||{{...{{|.{{........}}.,}}.{,||||}}|{(((((..................)))))}}..,)))))}},..}}}.....})))))))),,....,,,,...{{{{({,(,,(,.{{{..,,,,..))}.,}}}}}|}},......,.)))))))))))))..}.......))))))).})}.)))...))))))).

Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000073.3 AGUCUAGCUGCUGCACAGGCUGGCUGGCUGGCUGGCUGCUAAGGGCUGC… 2690 nt 0.4019
Summary

The protein encoded by this gene is the CD3-gamma polypeptide, which together with CD3-epsilon, -delta and -zeta, and the T-cell receptor alpha/beta and gamma/delta heterodimers, forms the T-cell receptor-CD3 complex. This complex plays an important role in coupling antigen recognition to several intracellular signal-transduction pathways. The genes encoding the epsilon, gamma and delta polypeptides are located in the same cluster on chromosome 11. Defects in this gene are associated with T cell immunodeficiency. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image