Basic Information

Symbol
CD93
RNA Class
mRNA
Alias
CD93 molecule C1qRP C1qR(P) dJ737E23.1 CDw93 ECSM3 matrix-remodelling associated 4 complement component 1, q subcomponent, receptor 1 CD93 antigen C1QR1 MXRA4 complement component C1q receptor C1q receptor 1 C1q/MBL/SPA receptor C1qR complement component 1 q subcomponent receptor 1 matrix-remodeling-associated protein 4 Complement component C1q receptor C1qR(p) C1qRp Complement component 1 q subcomponent receptor 1 Matrix-remodeling-associated protein 4
Location (GRCh38)
20:23065139-23086324 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_012072.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_012072.4
Sequence length
6681 nt
GC Content
0.5094

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2405.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2530.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1870.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_012072.4 GUGUCCUUCUCUGCGCCGGAGUGGCUGCAGCUCACCCCUCAGCUCCCCU… 6681 nt 0.5094
Summary

The protein encoded by this gene is a cell-surface glycoprotein and type I membrane protein that was originally identified as a myeloid cell-specific marker. The encoded protein was once thought to be a receptor for C1q, but now is thought to instead be involved in intercellular adhesion and in the clearance of apoptotic cells. The intracellular cytoplasmic tail of this protein has been found to interact with moesin, a protein known to play a role in linking transmembrane proteins to the cytoskeleton and in the remodelling of the cytoskeleton. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image