Basic Information

Symbol
CDK20
RNA Class
mRNA
Alias
cyclin dependent kinase 20 p42 PNQALRE cell cycle related kinase CCRK CDCH cyclin-dependent kinase 20 CAK-kinase p42 CDK-activating kinase p42 cell cycle-related kinase cell division protein kinase 20 cyclin-dependent protein kinase H cyclin-kinase-activating kinase p42 Cyclin-dependent kinase 20 Cell cycle-related kinase Cell division protein kinase 20 Cyclin-dependent protein kinase H Cyclin-kinase-activating kinase p42 EC 2.7.11.22 EC 2.7.11
Location (GRCh38)
9:87964906-87974764 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001039803.3
BLAST PRIMER
NM_001170639.2
BLAST PRIMER
NM_001170640.2
BLAST PRIMER
NM_012119.5
BLAST PRIMER
NM_178432.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001039803.3
Sequence length
2149 nt
GC Content
0.5463

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-811.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -852.2 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 587.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001039803.3 GUGCGAGCUCAGAUCAGCGUGGGGUGGAGGAGAAGUGGAGUUUGGAAGU… 2149 nt 0.5463
NM_001170639.2 GUGCGAGCUCAGAUCAGCGUGGGGUGGAGGAGAAGUGGAGUUUGGAAGU… 2058 nt 0.5437
NM_001170640.2 GUGCGAGCUCAGAUCAGCGUGGGGUGGAGGAGAAGUGGAGUUUGGAAGU… 1962 nt 0.5418
NM_012119.5 GUGCGAGCUCAGAUCAGCGUGGGGUGGAGGAGAAGUGGAGUUUGGAAGU… 2086 nt 0.5431
NM_178432.4 GUGCGAGCUCAGAUCAGCGUGGGGUGGAGGAGAAGUGGAGUUUGGAAGU… 2125 nt 0.5449
Summary

The protein encoded by this gene contains a kinase domain most closely related to the cyclin-dependent protein kinases. The encoded kinase may activate cyclin-dependent kinase 2 and is involved in cell growth. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been reported. [provided by RefSeq, Dec 2009]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image