Basic Information

Symbol
CDON
RNA Class
mRNA
Alias
cell adhesion associated, oncogene regulated ORCAM CDO CDON1 Ihog cell adhesion molecule-related/down-regulated by oncogenes Cdon homolog (mouse) HPE11 Cdon homolog surface glycoprotein, Ig superfamily member Cell adhesion molecule-related/down-regulated by oncogenes

Secondary Structure

MANE Select
NM_001378964.1
Sequence length
8265 nt
GC Content
0.4680

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2629.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -2782.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2279.8
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001378964.1 GACUCCGCCCCUCAGCUCCCCUCCCCUGAGCCCGGGAGCCCGGCUCGCG… 8265 nt 0.4680
NM_016952.5 GUCUCUCCAAGGGAAUGAAAGGUGAGGGGAGCGUGAGUGCAGGCAUGAU… 8044 nt 0.4574
Summary

This gene encodes a cell surface receptor that is a member of the immunoglobulin superfamily. The encoded protein contains three fibronectin type III domains and five immunoglobulin-like C2-type domains. This protein is a member of a cell-surface receptor complex that mediates cell-cell interactions between muscle precursor cells and positively regulates myogenesis. [provided by RefSeq, Aug 2011]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image