Basic Information
Symbol
CDR1
RNA Class
mRNA
Alias
cerebellar degeneration related 1
CDR62A
CDR34
Cerebellar degeneration-related protein-1 (34kD)
cerebellar degeneration-related protein (34kD)
cerebellar degeneration-related protein 1, 34kDa
CDR
cerebellar degeneration related protein 1
cerebellar degeneration-related antigen 1
Cerebellar degeneration-related antigen 1
Location (GRCh38)
X:140783578-140784366
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_004065.2
Sequence length
1299 nt
GC Content
0.4373
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-350.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-371.96 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
550.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((...((.(((....)))))....))))(((((((.(((...(((((....)))))......(.((((..(.(.((....)).).)..)))).)....((((......)))).....(((..(((....)))..)))(((((..((((((((..(((((((((((((...((((..(((((((((...((((.(((....(((((.(.(.((((((((((...((((..((((....((((......))))....)))))))).....((((....((((......))))....))))(((((...((((....(((((...)))))(((..((((.((((....)))).))))..))).(((((((.((((..((((...((((.((..(.(((((((((..(((((..(((.((((((........)))))).)))..)))))....))))))))))..))))))...))))..))))..))).))))......(((((((((.((((((((((..((((..(((((((((...(((.........(((((.(((((((..(((.((((((..(((((..((((((....(((..(((((((.((..((((((..((..((.((.((((((((..((.(((..(((((..(((((.(((..((.(((((((((((((..((.(.(((((..((((..((((((((..((((....)))).))))))))))))..))))).).))..)).)).))))))))).))..))).)))))..)))))..))).))..))))))))))))..))(((((((((((((.((((((..((((..((.(((..(((.(.((((((..(((..((((((((..((((.((.((..(.((((((........)))))).)..)).)).)).))..)))))))).)))....))))))).)))..))..).))..))))..)))))).).))))))))))))((((((((((..(.....).))))))))))))))))..)).))))))))))....)).)).))..)))))..)))))).)))..)))))))))))).........)))...)))).))))).))))..)).)).)))))).)).)))))))((((((((......(((((....)))))...))))))))..))))...))))).....)))))))).)).).))))))...))).)))).....))))))))))))).....)))))))))))))..)))))))))))))))).))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((...((.(((....)))))....))))(((((((.(((...(((((....)))))......(.((((..(.(.((....)).).)..)))).)....((((......))))....{({{..{{||,|.,,,..},|(((((,.{(((((({..((({(((((((({{,,{(((..((((((((({,,((((.(((....,,|||.||||,.||||||||}|||.,|||{|||.,,,||||},,...|||}....}}}}||{{,{{{{{...,),}}}})),||{,{{{,.,.,),},|||,}}|||||.....(((({...})))),,,..|{||,|||{...{|||,.((((..{({.{.(,(((.((((..(((({..((((.((..(.(((((((((..(((((..(((.((((((........)))))).)))..)))))....))))))))))..))))))...)))),.))))..))).).}}}|,.}}||,.|||||.|||||{||||..||||,.{{|||||||...{((,{{{,....({(((.(((((({,,{{{,{{{{,{..|||||,,|||||{,...(({,,(((((((.{(.,(((((({{{{..{{,(|,((((((((,.{{.{((..(((((,,(((({.(((..{{.((((({((({{{(..{{.{,{{{{{..((((..((((((((,.(({{...,||||.|||}}}|}}}}|..|||||,|,||,.}}.|}.||||||}|},|,..}|}.|||||.,}}||}..|||.||..||||||||}},|..,,||||||||,,|||.||,|||..||||}}||||||..|||.|,{|{{{{..||{.,||||||||,,||{{.{{.{{..|.{{{{{{,|......)))))).),,)).}}.}}.))..)))))))),)}},...))))))}})})}.)).,}.}}..)}}).,))))}).||}}}})}||||||{(((((((({..(,....}.}))))))))}}}}},}.,||{|||||||}||..,.}}.},.))..)))))}})))))).))).,}}}}},,))})},,.|,..|,,|,..||||}.}||||.|||||.|,|}}.||||||.}}}|||||}||,||||{|{|{...((((({,.(.{,{|...,)))),,))))))),,..}}.},})}.)))))})},)}.}.}))))).}}))}.))))..},.)))))))}}))))..,,.))))))))))}))..)))))))})))))))).))).)))).
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_004065.2 | UUGUUGGAAGACAUGAAGAUGCUGGAAGACACAGAGAUGCUGGAAGACG… | 1299 nt | 0.4373 |
Summary
No summary available.
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
