Basic Information
Symbol
ACSL1
RNA Class
mRNA
Alias
acyl-CoA synthetase long chain family member 1
LACS2
LACS
ACS1
LACS1
FACL1
lignoceroyl-CoA synthase
long-chain fatty-acid-coenzyme A ligase 1
fatty-acid-Coenzyme A ligase, long-chain 2
FACL2
long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1
LACS 1
LACS 2
acyl-CoA synthetase 1
arachidonate--CoA ligase
fatty-acid-Coenzyme A ligase, long-chain 1
long-chain acyl-CoA synthetase 1
long-chain acyl-CoA synthetase 2
long-chain fatty acid-CoA ligase 2
palmitoyl-CoA ligase 1
palmitoyl-CoA ligase 2
paltimoyl-CoA ligase 1
phytanate--CoA ligase
Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1
Acyl-CoA synthetase 1
Arachidonate--CoA ligase
Long-chain acyl-CoA synthetase 1
Long-chain acyl-CoA synthetase 2
Long-chain fatty acid-CoA ligase 2
Palmitoyl-CoA ligase 1
Palmitoyl-CoA ligase 2
Phytanate--CoA ligase
EC 6.2.1.3
EC 6.2.1.15
EC 6.2.1.24
EC 6.2.1
Location (GRCh38)
4:184755501-184826853
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_001995.5
Sequence length
3712 nt
GC Content
0.4518
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1122.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-1193.36 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
922.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((.((((((((((((((.((...)).)))))).((((((((((..(((((...(((.........(((((((.((..((.(((..(((.((((.((((((((((((((((((((..((((((.(((((((.(((((((....)))))..((((..((((..(((((((.(((((((...(((((((((.(((((((((..(((...((((((.....(((.....((((....((.(((.((....)))))))..)))))))..))))))..))).)))))))(((.(((.(((((...........)))..))...))).)))...((((((((((.((...)).))))))).)))(((((((.(((((....(((((.((((.....)))).))))).....))))))))))))..........((((((.....)))))).....)))))))))))...))))))).)))))))((((((((((((.....((((.........))))..))))))).....((((((((((.((((.....((((....)))).....)))).))))))))))..........((((((..((((((((..............))).))))).))))))..................)))))....((((((((((........))))))))))(((((...((((....))))(((((.............))))).)))))..........))))...))))..((((((.(..((..((.((...)).))..))..).))))))))))))))))))))).)).(((.(.((((((.(.((((.....((.......))...)))).))))))).).))).................(((((((((..(((((((((.((((((((((((((((.....((((.(((((.........))))).((((((....((.((((....)))).)).....)))))).......(((((..((((((....((((((((...((((((((..........)))))).))...)))).))))......))))))))).)).......(((....)))..((.((.(((((((((((..((((.(((((....((((((((((((((((((((..(((.((((......((((((...((..((((((.((((....)))).))))))..(((((((((...((..(.((((((((.....((((((....)))..(((((...)))))(((.(((((((........(((((((((((((...((((((..(((.....)))..))))))((((.((((......)))))))).(((((..(((((((...(((((((..(((.(((.(((((.(((((((((..((((((...))))))........)).)))).)))..))).)).)))))).))))))).))).))))))))).((........)).))))))))..))))).......))))))))))...................(((((............))))))))..)))))))).)..))..)))))).)))...(((((........((((((....)))))))).)))..))....)))))).)))).)))...))))))).)))..((.((((((((((..((((....(((..((....)).)))((((......))))((((...(((......)))...)))).....(((((((((.((((((......((((.......))))....((..((.((((.((.(((((((..(((((.((((((((((((((....))).))))))........)))))...))))).))))).)).)).))))))..))..........(((((.(((((((..(.((((...(((((.((((...((((((.(......).))))))....(((((((((.((.(((((((((.((((((((((...((.(((((.....))))))).....(((((......(((.....)))......)))))((((((.............)))))).....((((((((((((((((......(((((.(((((((.......(((.((((((((........))))).)))..)))...(((((((...((((((.(((((.....((.((((.((((((((......)))((((((...........))))))...)))))))))))(((((((.(((..((....(((....))).....))..))).)))))))((((((...(((((.((((...(((.........))).))))(((((....)))))......((((((..(((.((((((((..........))))((.(((.......)))))(((((......))))).)))).)))..)))))).)))))...))))))...(((((.............)))))...))))).))))))))))))).))))))).))))).......))))))))))(((((.(((((....)))))))).))..(((((((((...)))))))))..................)))))).(((...))).....)))))))))).))))))))).)).).)))).))))..)))))))))...)))).)..))))))).)))))....)))))).).......))))))))))))))))))))))))....)))))))))).)))))))))...))).(((((((.(((((((...((((((((((.......(((((((........))).))))........)))))).)))).......((((...)))).))))).)).))))))).)))))))))).))))))...))))))....)))))............)))))))).)))))).))).))))))))))))...)))))...)))).))).))))))))))..))..))...))))......)))........)))...)))))...))).))))))).((((((((((((((((((.(((((.....)))))..))))))).)))))..........))))))..(((((((((((((...((((((.....((((((((((.....)))))))))).....))))))...))))).(((((((((((((((((........)))))..)))).((.(((((((((........((((......))))..........))))))))).))...))))))))(((((((......)).)))))(((((((((((.....))))))))))).....(((((((.((...((((.((....))))))...)).)))))))((((((..((((......)))))))))).))))))))....(((((((((((((((....(((((.....((((..(((......)))..))))..)))))......((((...)))).........)))))))))))))))((((.((.....))))))....))))))..)).))))......((((.(((((.((.((((..((((...((((((.......))))))))))..))))..))..))))).)))).................))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((((({(((,,.((((((.((...)).)))))).|||,({{{{,..{{|,,...,{{,,....,,..,{({{({{{,{(((((((({((,(({((((.((((((....}))))).)))){{((((....,|||,(((((,,..}||||,,|||||||,.,,{||||||||||||(({,,{({{{{{{{({(,{(({(((..,{|||.({((((..,...,....{,((({..,,({{(((.({....}}}}))}.,))})}))..)))))))}},)})}|||}}|,.,}}}.,}})|}}|}},,,..|||,.}||}||}|,}||}}..((((((((((.((...,,,))))))).))}(((((((.(((((....(((((.((((.....)))),))))).....))))))))))))...,,...{{((,((({{{{{||{{{{.{{{(((({.(({......{(((.(((((({||((.(((((((((((((..((((.........))))..|||||||,,...((((((((((.((((.,...((((....))))...,.)))).)))))))))),{{{{,.,,,{.(((((((,.((((((({{,,.,{(((.{(((...,....((((((.{{.{{{,{{{{.....},}},.,..{(((((((((.,....,.)))))))))|(((((...((((....))))(((((.,,.......}}.))))).))))),....,{,,.,,|{{{,|||.{{{|,,.))))))),}))))))).......)))).))))))))))))))))))))),,.,,.|||,|.((((((.(.((((.....((.......))...)))).))))))).}.})).....{((((.{{{..{(((((((((..(((((((((.((((((((((((((((.....((((.(((((.........))))).((((((....(({((((....}}}),))}}...)))))).......(((({.,((((((....(((({{(({,.((((((({..,....,..}))))).)}.,.)))).))))......))))))))).)).......(((....)))..((.((.(((((((((((..((((.(((((....((((((((((((((((((((..,..,{{{(({{{{.((((((...{{..((((((.((((....)))).))))))..(((((((((...((..(.((((((((.,...((((((....)))..(((((...)))))(({,(((((((........(((((((((((((..,((((((..(((.....)))..))))))((((.((((......)))))))).(((((..(((((((.{,(((((({..(({{(((.(((((.(((((((((,,((((((...))))))........)),}))).)))..))).)).)))))).,)))))),))).))))))))).{{.,....,.)).))))))))..))))).......))))))))))...,{{{{{,...,}}}},|{{((,.,........,},)))))).,)))))))).)..))..)))))).)))...(((((........((((((....)))))))).)))..},....))))))..,))}}))},.))))))).)))..{{.((((((((((..(((,....(((..((....)}.})){(((......}}},((((...{{,......,}}...)))),....(((((({({,{,((((..,...{{({.......}}||,{{{((({,{,(((({{(..,,,{((((.{((.((....)).}}|}))))}}))).,}}))).))))}..|}}||,.{{|{||||,,,.,}},,..,}}}}}))))}|,.......(((({.(((((((..{.((((...(((((.((((...((((((.(......).))))))....(((((((((.((.(((((((((.((((((((((...{(.{({(,...,,|||||||{....(((((,.....(((.....)))....,.)))))((((({,,.,,........)}))}}.....||||{{((((((((((......(((((.(((((((.......(((.((((((((........))))).)))..))}...(((((((,..{(((((.(((((,....,{,((((.((((({((......})}((((((...........))))))...)))))))))),(((((((.(((..((....(((....})),....))..))).))))))),(((((,.,,{,,,{(((,...,||}}...{{|{,||.||,,{.(((((((((((((...,.{.((((.{{{..,,,...,,.....}}}.}))))},.))))))))))))).,..}}.,,.|||},,}},))),,,{,,,,,}},},})))),}})}},}}...{((((,.,..........)))))...))))).))))))))))))).))))))).))))).......)))))))))}(((((.(((((....)))))))).))..(((((((({...}))))))))..............,,,,)))}}|{(({...))).,...)))))))))).))))))))).)).}.)))).))))..)))))))))...)))).}..))))))).})))).,..|||})}.,.,.,,,,)))}}))))))}))))))))))}}....)))))))))).)))))))))...))).(((((((.(((((((...((((((((((.......(((((((........))).))))........)))))).)))).......((({...}))).))))).)).))))))).)))))))))),)}))))...))))))....)))))............)))))))).)))))).))))))))))).}}}.)))))..,,,.,..)))))))))...)))).))))))).))))))}...{((((({{.{{{,,,,..,||||....|}},,},,}}),,|||.(((((((((((((.(((((,...,)))))..))))))).))))))......(((((({,,......,,,,,,,,....,,,|||}}}}.((((((((((.....))))))))}}.,...}}})))}..))},}}}|,}))))))}.{((((........)))))..))).})))},|||.|}}}}}.{{{.,.,,}},,}})}...}||||}},{|||}||}}}|}||..|}}},,||(((((((......)).)))))||{{{{{{{{{,,,,,|||}}}))))),}}..(((((((.{{...((((.((....))))))...}}.))))))){((((|..{{{{......}}}})))))),}}})))))}}.}{|||||||||{{{{|....,,|{{||.}....}}))))),,.....,..})))),})}}.....,,,,.,...))))))}.,)))}.,,,,||||,,,,,..,||}|{.....,,|||....,,,{((((,,({{(({{,(,,.((((.(((((.{(.((((..((((...((((((.......))))))))))..)))}..))..))))).))))}}},,,......,,,..,)})))))))),
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001286708.2 | GUUAAGAACCAAGGGCAUAUAAAGACAGAUGGGAGGAGACCCUGGCCGG… | 3751 nt | 0.4484 |
| NM_001286710.2 | AGUAGUCAGCUGUUGGUGGCACAGAUGAAUUCAGCUUAGAGAACUAUCA… | 3686 nt | 0.4474 |
| NM_001286711.2 | AGGGAGUGGGCUGCAGUGACAGCCGGCGGCGGAGCGGCCGGUCCACGGA… | 3610 nt | 0.4507 |
| NM_001286712.1 | ACAAAGGGGGCGCUUUCAGCCUCUGUAAAUAGCCUAUUGUACAAGGGGA… | 4121 nt | 0.4487 |
| NM_001381877.1 | AGGGAGUGGGCUGCAGUGACAGCCGGCGGCGGAGCGGCCGGUCCACGGA… | 3777 nt | 0.4538 |
| NM_001381878.1 | AGGGAGUGGGCUGCAGUGACAGCCGGCGGCGGAGCGGCCGGUCCACGGA… | 3783 nt | 0.4544 |
| NM_001381879.1 | AGAUUCCUGGAGCACCAGGGCCCUACCUGCCGUGGUUAUCAGAUCUGUC… | 3851 nt | 0.4498 |
| NM_001381880.1 | AGAUUCCUGGAGCACCAGGGCCCUACCUGCCGUGGUUAUCAGAUCUGUC… | 3786 nt | 0.4477 |
| NM_001381881.1 | AGCAUCUUGCCAGCUUGGGUUGCUGCGUUAAGGAAAGAUGUCAGGCUUU… | 3899 nt | 0.4458 |
| NM_001381882.1 | AGUAGUCAGCUGUUGGUGGCACAGAUGAAUUCAGCUUAGAGAACUAUCA… | 3686 nt | 0.4479 |
Showing 1 to 10 of 19 entries
Summary
The protein encoded by this gene is an isozyme of the long-chain fatty-acid-coenzyme A ligase family. Although differing in substrate specificity, subcellular localization, and tissue distribution, all isozymes of this family convert free long-chain fatty acids into fatty acyl-CoA esters, and thereby play a key role in lipid biosynthesis and fatty acid degradation. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2013]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
