Basic Information

Symbol
ACSL1
RNA Class
mRNA
Alias
acyl-CoA synthetase long chain family member 1 LACS2 LACS ACS1 LACS1 FACL1 lignoceroyl-CoA synthase long-chain fatty-acid-coenzyme A ligase 1 fatty-acid-Coenzyme A ligase, long-chain 2 FACL2 long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1 LACS 1 LACS 2 acyl-CoA synthetase 1 arachidonate--CoA ligase fatty-acid-Coenzyme A ligase, long-chain 1 long-chain acyl-CoA synthetase 1 long-chain acyl-CoA synthetase 2 long-chain fatty acid-CoA ligase 2 palmitoyl-CoA ligase 1 palmitoyl-CoA ligase 2 paltimoyl-CoA ligase 1 phytanate--CoA ligase Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1 Acyl-CoA synthetase 1 Arachidonate--CoA ligase Long-chain acyl-CoA synthetase 1 Long-chain acyl-CoA synthetase 2 Long-chain fatty acid-CoA ligase 2 Palmitoyl-CoA ligase 1 Palmitoyl-CoA ligase 2 Phytanate--CoA ligase EC 6.2.1.3 EC 6.2.1.15 EC 6.2.1.24 EC 6.2.1
Location (GRCh38)
4:184755501-184826853 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001286708.2
BLAST PRIMER
NM_001286710.2
BLAST PRIMER
NM_001286711.2
BLAST PRIMER
NM_001286712.1
BLAST PRIMER
NM_001381877.1
BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
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BLAST PRIMER
NM_001381889.1
BLAST PRIMER
NM_001381890.1
BLAST PRIMER
NM_001995.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001995.5
Sequence length
3712 nt
GC Content
0.4518

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1122.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1193.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 922.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
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NM_001381884.1 AGGGAGUGGGCUGCAGUGACAGCCGGCGGCGGAGCGGCCGGUCCACGGA… 3712 nt 0.4512
NM_001381885.1 AGGGAGUGGGCUGCAGUGACAGCCGGCGGCGGAGCGGCCGGUCCACGGA… 3777 nt 0.4533
NM_001381886.1 AGCAUCUUGCCAGCUUGGGUUGCUGCGUUAAGGAAAGAUGUCAGGCUUU… 3899 nt 0.4452
NM_001381887.1 AGUAGUCAGCUGUUGGUGGCACAGAUGGUGAGUGGUUUUGUUAAGUGCU… 3773 nt 0.4471
NM_001381888.1 AGCAUCUUGCCAGCUUGGGUUGCUGCGUUAAGGAAAGAUGUCAGGCUUU… 4008 nt 0.4491
NM_001381889.1 AGUAGUCAGCUGUUGGUGGCACAGAUGGUGAGUGGUUUUGUUAAGUGCU… 3882 nt 0.4511
NM_001381890.1 AGUAGUCAGCUGUUGGUGGCACAGAUGGUGAGUGGUUUUGUUAAGUGCU… 3546 nt 0.4419
NM_001995.5 AGGGAGUGGGCUGCAGUGACAGCCGGCGGCGGAGCGGCCGGUCCACGGA… 3712 nt 0.4518
Showing 11 to 19 of 19 entries
Summary

The protein encoded by this gene is an isozyme of the long-chain fatty-acid-coenzyme A ligase family. Although differing in substrate specificity, subcellular localization, and tissue distribution, all isozymes of this family convert free long-chain fatty acids into fatty acyl-CoA esters, and thereby play a key role in lipid biosynthesis and fatty acid degradation. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2013]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image