Basic Information

Symbol
CDSN
RNA Class
mRNA
Alias
corneodesmosin D6S586E HTSS HTSS1 HYPT2 PSS PSS1 S protein differentiated keratinocyte S protein Corneodesmosin
Location (GRCh38)
6:31115087-31120446 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001264.5
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_001264.5
Sequence length
2555 nt
GC Content
0.5648

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-883.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -927.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 675.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001264.5 AUCAGUCAGGAGGCCGUGCAGUCCGAGAUGGGCUCGUCUCGGGCACCCU… 2555 nt 0.5648
Summary

This gene encodes a protein found in corneodesmosomes, which localize to human epidermis and other cornified squamous epithelia. The encoded protein undergoes a series of cleavages during corneocyte maturation. This gene is highly polymorphic in human populations, and variation has been associated with skin diseases such as psoriasis, hypotrichosis and peeling skin syndrome. The gene is located in the major histocompatibility complex (MHC) class I region on chromosome 6. [provided by RefSeq, Dec 2014]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image