Basic Information

Symbol
CFH
RNA Class
mRNA
Alias
complement factor H HUS FHL1 ARMS1 ARMD4 beta-1H H factor 2 (complement) age-related maculopathy susceptibility 1 H factor 1 (complement) AHUS1 AMBP1 CFHL3 FH HF HF1 HF2 adrenomedullin binding protein beta-1-H-globulin factor H factor H-like 1 Complement factor H H factor 1
Location (GRCh38)
1:196651754-196752476 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_000186.4
BLAST PRIMER
NM_001014975.3
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_000186.4
Sequence length
3962 nt
GC Content
0.3922

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-991.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1070.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1098.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_000186.4 ACAAUUCUUGGAAGAGGAGAACUGGACGUUGUGAACAGAGUUAGCUGGU… 3962 nt 0.3922
NM_001014975.3 ACAAUUCUUGGAAGAGGAGAACUGGACGUUGUGAACAGAGUUAGCUGGU… 1660 nt 0.4090
Summary

This gene is a member of the Regulator of Complement Activation (RCA) gene cluster and encodes a protein with twenty short consensus repeat (SCR) domains. This protein is secreted into the bloodstream and has an essential role in the regulation of complement activation, restricting this innate defense mechanism to microbial infections. Mutations in this gene have been associated with hemolytic-uremic syndrome (HUS) and chronic hypocomplementemic nephropathy. Alternate transcriptional splice variants, encoding different isoforms, have been characterized. [provided by RefSeq, Oct 2011]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image