Basic Information

Symbol
CFHR2
RNA Class
mRNA
Alias
complement factor H related 2 FHR2 H factor (complement)-like 3 complement factor H-related 2 CFHL2 HFL3 complement factor H-related protein 2 DDESK59 FHR-2 factor H-related gene 2 h factor-like 3 h factor-like protein 2 Complement factor H-related protein 2 H factor-like 3 H factor-like protein 2
Location (GRCh38)
1:196943731-196964115 UCSC Genome Browser
Transcripts
NM_001312672.1
BLAST PRIMER
NM_001410924.1
BLAST PRIMER
NM_005666.4
BLAST PRIMER
External Database
HGNC NCBI Ensembl UniProt OMIM GTEx

Secondary Structure

MANE Select
NM_005666.4
Sequence length
1498 nt
GC Content
0.3491

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-349.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -380.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 427.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC Content
NM_001312672.1 AGUUAGUACACUGAAAUUCAAAGUCAUGCUCAUAACUGUUAAUGAAAGC… 704 nt 0.3395
NM_001410924.1 AUAACUGUUAAUGAAAGCAGAUUCAAAGCAACACCACCACCACUGAAGU… 840 nt 0.3571
NM_005666.4 ACCACAAAGGACUUUACUAAACUAGCUUCCAGUUAGUACACUGAAAUUC… 1498 nt 0.3491
Summary

This gene belongs to a family of complement factor H-related genes (CFHR), which are clustered together with complement factor H gene on chromosome 1, and are involved in regulation of complement. Mutations in CFHR genes have been associated with dense deposit disease and atypical haemolytic-uraemic syndrome. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

No forensic context available.

Genomic Tracks
Track Image