Basic Information
Symbol
CHAC1
RNA Class
mRNA
Alias
ChaC glutathione specific gamma-glutamylcyclotransferase 1
MGC4504
gamma-GCT acting on glutathione homolog 1
ChaC, cation transport regulator homolog 1 (E. coli)
glutathione-specific gamma-glutamylcyclotransferase 1
ChaC, cation transport regulator homolog 1
ChaC, cation transport regulator-like 1
blocks Notch protein
botch
gamma-GCG 1
BOTCH
Glutathione-specific gamma-glutamylcyclotransferase 1
Gamma-GCG 1
Blocks Notch protein
Botch
Cation transport regulator-like protein 1
EC 4.3.2.7
Location (GRCh38)
15:40952962-40956512
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_024111.6
Sequence length
1520 nt
GC Content
0.6125
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-627.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-652.37 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
529.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001142776.4 | AGCUGGAGCUACCGAGCGGUGCCAGGCCAGGUGUGUGCGUCCGUCGGUC… | 1385 nt | 0.6181 |
| NM_024111.6 | AGCUGGAGCUACCGAGCGGUGCCAGGCCAGGUGUGUGCGUCCGUCGGUC… | 1520 nt | 0.6125 |
Summary
This gene encodes a member of the gamma-glutamylcyclotransferase family of proteins. The encoded protein has been shown to promote neuronal differentiation by deglycination of the Notch receptor, which prevents receptor maturation and inhibits Notch signaling. This protein may also play a role in the unfolded protein response, and in regulation of glutathione levels and oxidative balance in the cell. Elevated expression of this gene may indicate increased risk of cancer recurrence among breast and ovarian cancer patients. [provided by RefSeq, Sep 2016]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
