Basic Information
Symbol
CHD7
RNA Class
mRNA
Alias
chromodomain helicase DNA binding protein 7
KIAA1416
FLJ20357
FLJ20361
CHARGE association
CRG
HH5
IS3
KAL5
chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7
ATP-dependent helicase CHD7
Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7
CHD-7
EC 3.6.4.12
EC 3.6.1
Location (GRCh38)
8:60678740-60868028
UCSC Genome Browser
Transcripts
Secondary Structure
MANE Select
NM_017780.4
Sequence length
11606 nt
GC Content
0.4767
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3593.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-3807.07 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
2947.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC Content |
|---|---|---|---|
| NM_001316690.1 | GACCUAUAUCCAGACUUUGCCUGACACUGCAGGGUCCAAGAGAAUUAAA… | 5124 nt | 0.4692 |
| NM_017780.4 | GCGCAGGCGCUGGCGUGCUGGGGCCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG… | 11606 nt | 0.4767 |
Summary
This gene encodes a protein that contains several helicase family domains. Mutations in this gene have been found in some patients with the CHARGE syndrome. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2015]
Forensic Context
No forensic context available.
Genomic Tracks
