Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000032.5

Sequence Length

1940 nt

GC Content

0.5479

ACCUGUCAUUCGUUCGUCCUCAGUGCAGGGCAACAGGACUUUAGGUUCAAGAUGGUGACUGCAGCCAUGCUGCUACAGUGCUGCCCAGUGCUUGCCCGGGGCCCCACAAGCCUCCUAGGCAAGGUGGUUAAGACUCACCAGUUCCUGUUUGGUAUUGGACGCUGUCCCAUCCUGGCUACCCAAGGACCAAACUGUUCUCAAAUCCACCUUAAGGCAACAAAGGCUGGAGGAGAUUCUCCAUCUUGGGCGAAGGGCCACUGUCCCUUCAUGCUGUCGGAACUCCAGGAUGGGAAGAGCAAGAUUGUGCAGAAGGCAGCCCCAGAAGUCCAGGAAGAUGUGAAGGCUUUCAAGACAGAUCUGCCUAGCUCCCUGGUCUCAGUCAGCCUAAGGAAGCCAUUUUCCGGUCCCCAGGAGCAGGAGCAGAUCUCUGGGAAGGUCACACACCUGAUUCAGAACAAUAUGCCUGGAAACUAUGUCUUCAGUUAUGACCAGUUUUUCAGGGACAAGAUCAUGGAGAAGAAACAGGAUCACACCUACCGUGUGUUCAAGACUGUGAACCGCUGGGCUGAUGCAUAUCCCUUUGCCCAACAUUUCUCUGAGGCAUCUGUGGCCUCAAAGGAUGUGUCCGUCUGGUGUAGUAAUGAUUACCUGGGCAUGAGCCGACACCCUCAGGUCUUGCAAGCCACACAGGAGACCCUGCAGCGUCAUGGUGCUGGAGCUGGUGGCACCCGCAACAUCUCAGGCACCAGUAAGUUUCAUGUGGAGCUUGAGCAGGAGCUGGCUGAGCUGCACCAGAAGGACUCAGCCCUGCUCUUCUCCUCCUGCUUUGUUGCCAAUGACUCUACUCUCUUCACCUUGGCCAAGAUCCUGCCAGGGUGCGAGAUUUACUCAGACGCAGGCAACCAUGCUUCCAUGAUCCAAGGUAUCCGUAACAGUGGAGCAGCCAAGUUUGUCUUCAGGCACAAUGACCCUGACCACCUAAAGAAACUUCUAGAGAAGUCUAACCCUAAGAUACCCAAAAUUGUGGCCUUUGAGACUGUCCACUCCAUGGAUGGUGCCAUCUGUCCCCUCGAGGAGUUGUGUGAUGUGUCCCACCAGUAUGGGGCCCUGACCUUCGUGGAUGAGGUCCAUGCUGUAGGACUGUAUGGGUCCCGGGGCGCUGGGAUUGGGGAGCGUGAUGGAAUUAUGCAUAAGAUUGACAUCAUCUCUGGAACUCUUGGCAAGGCCUUUGGCUGUGUGGGCGGCUACAUUGCCAGCACCCGUGACUUGGUGGACAUGGUGCGCUCCUAUGCUGCAGGCUUCAUCUUUACCACUUCUCUGCCCCCCAUGGUGCUCUCUGGAGCUCUAGAAUCUGUGCGGCUGCUCAAGGGAGAGGAGGGCCAAGCCCUGAGGCGAGCCCACCAGCGCAAUGUCAAGCACAUGCGCCAGCUACUCAUGGACAGGGGCCUUCCUGUCAUCCCCUGCCCCAGCCACAUCAUCCCCAUCCGGGUGGGCAAUGCAGCACUCAACAGCAAGCUCUGUGAUCUCCUGCUCUCCAAGCAUGGCAUCUAUGUGCAGGCCAUCAACUACCCAACUGUCCCCCGGGGUGAAGAGCUCCUGCGCUUGGCACCCUCCCCCCACCACAGCCCUCAGAUGAUGGAAGAUUUUGUGGAGAAGCUGCUGCUGGCUUGGACUGCGGUGGGGCUGCCCCUCCAGGAUGUGUCUGUGGCUGCCUGCAAUUUCUGUCGCCGUCCUGUACACUUUGAGCUCAUGAGUGAGUGGGAACGUUCCUACUUCGGGAACAUGGGGCCCCAGUAUGUCACCACCUAUGCCUGAGAAGCCAGCUGCCUAGGAUUCACACCCCACCUGCGCUUCACUUGGGUCCAGGCCUACUCCUGUCUUCUGCUUUGUUGUGUGCCUCUAGCUGAAUUGAGCCUAAAAAUAAAGCACAAACCACAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-700.1 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -735.73

Frequency: 0.0000

Diversity: 618.5

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((.(((..(((((.....((.(((((....((((....(((....((((((..(((((((((((((((......))..((((((((...((((((((((.(((.((((...)))).(((((((((.(..((.(((((.((.....)).)))))..(((.(((((((((((...(((((((..........((((...((((((((.........)))).)))).)))).......))))))).(((((((....).))))))..............)))))))))))..)))...(((((((.((((((((.((((((.(((..(((((.........)))))..))).(((((((((.(((((.(((.........(((...(((((....))))))))..)))))))).)).))))))))))))).((((.....))))..............(.((((((((((..(((.........))).)).)))))))).)...((((((((((.....((((((.(((((.....))))).))....))))(((..((.(((((((.(((........)))...(((((.((.((((((.......)))))).)))))))((((.(((((((((((............(((....))).......((((.((((((((((..((((.(((((..(((.......(((((((.(((.((((((...))))..)).))).)))))))))).))))).))))..))))..)))))).))))....))))))))))).))))))))))).))..))).......((...((((((..(((......((((..(((((((((.........))))))))).)))).....)))......))))))...))))))))))))...(((.((((......))))...)))....))))))))..)))))))))..)))))))))).....(((((((.(((..((((.......))))..........(((((.......((((((((.....))))))))))))).......))).))))))).........((((...(((((((((..(((.(((.....)).).))))))))))))..)))))))..))))))))))))))))))..((((((((((((((.((((........))))..))))))....(((..((...(((.(((.....(((((.((((..(((.(((((((..((((((.((..(((.(((((((((((((......)).)))(((....................)))..)))))..((((....))))..........(((.(((((....((((.((((.((((...(((....)))..)))).)).(((((.(((.....))))))))((........))(((((((....))))))).))))))....))))).)))..))))))))))))))))))))).))).)))))))))..))).)))))..))).)))))))))))))))).......)))))))))))....))).....))))...((((((..((((......))))..))))))............))))))))))))..)))))).((((((((((((.(..(..((((((((((..(((((((...))))..(((((((.....(((((..............))))))))))))..(((((((....)).)))))(((((((....)))))))(((((..((((((.................)))))))))))((((((((.((....((........)))).))).))))))))..))))))))))..)..).).)))))((((((((....(.(((..........))).)....)))))))).....))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,(((,{,{{.{...,,{.,,}}||}})){|.{{{(((,.,(((((...,(.(((((((.(((((...||}}}...{{{{{{.,..|||}|}.,{,.(((((((((...((((...))))..((((((....,,,}}}},((((({{...,|{{|.{{{{(((.(((((((((((...((((((({,......},|||,...((((((((..,....,.)))).)))){|||...}))).,}))))).(((((({....).))))))...,....,,....)))))))))))..))).,,({{(((({(,{((((((({(({,{(((((((..,.,(({..(((((({.,,,.,{{{({{{{,.((((((((({{{{{{,..((({..(({{.{{{,.,,,||||{{||||||||,||,}|||}||||,,.||{((({{||,||||{...}}}.......,.((((((((((..(((.........))).))))))))))).|...((((((((((((((.((((((.(((((.....))))).))....)))).....((.(((((((.(((........)))...((({((((.((((((.......)))))).)))))))((((.(((((((((((..........,.(((....))).,.....{(((.((((((((((..((((.(((((..{((.......(((((({.(((.((((((,..}}))..}}.))).)))))))))}.))))).))))..))))..)))))).))))....))))))))))).))))))))))).)))))))}},....((.,.((((((..((..({{,.((((..(((((((((........,))))))))).)))).......)}}..},))))))...)).,}}))))))...(((,(({,.....{|||},{{|}|..|,||||||||{{||||||},..,}))}}}}},,..,,..{((((,..,}}}}|||.......,}}}.,,......})}}}}}},}}}}|||||||,}}}}.)))}}||}||||{{.}||,.||,,}}))}}}}}}}},,|.((((|{.{((((({{|||{{{.|((.....)).).}))))))))))),.))))}}.}})),)))},))))))))))}}||||||||,{{{{{,,,,,.,.{{{{{{{{|..||||||{{..({,..,,..{((,.{||}...{((((({((((.,(((.(((((((..((((((.((..(((.(({|{((({({((......||.|||(((..........,,........}||..,}}})|,{{{{..,,}))).}}},....,({(.(((((....{(((,{{(({((((,..(((.{{,|}}.,||}}.}}.(((({,(((.....))))))))..,,..,,,..}(,({((|,,..})))})}.,})))),...))))).)}},.}))))}))))))))))))))).))).}}},||||}.,|}}.}}|{|{..||{|{,.,,,.,||||||,..))})))))))),,)))}...,}}....,)),,...((((((..((((......))))..))))))...}}}}..}))))))}}))))))))},.))}}}})))|}}||||},..}},||}}}))})}..{{}||||}}}))||.,|{{|||,..}}}}.}||}}}},}}}..,}}}},}}},)))).)}}|(((({{....}}.))))|(((((((....)))))))}})))))).})))))))).,,..))))))),}}..|||||}((((((((.((....({........)})).))).))))).,,||||},,}})))}}.}))))}.,,.{((((((((.{,.(.{((..........))),,....})))))))).....,}})),.