Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000190.4
Sequence Length
1505 nt
GC Content
0.5654
AAGUGACGCGAGGCUCUGCGGAGACCAGGAGUCAGACUGUAGGACGACCUCGGGUCCCACGUGUCCCCGGUACUCGCCGGCCGGAGCCCCCGGCUUCCCGGGGCCGGGGGACCUUAGCGGCACCCACACACAGCCUACUUUCCAAGCGGAGCCAUGUCUGGUAACGGCAAUGCGGCUGCAACGGCGGAAGAAAACAGCCCAAAGAUGAGAGUGAUUCGCGUGGGUACCCGCAAGAGCCAGCUUGCUCGCAUACAGACGGACAGUGUGGUGGCAACAUUGAAAGCCUCGUACCCUGGCCUGCAGUUUGAAAUCAUUGCUAUGUCCACCACAGGGGACAAGAUUCUUGAUACUGCACUCUCUAAGAUUGGAGAGAAAAGCCUGUUUACCAAGGAGCUUGAACAUGCCCUGGAGAAGAAUGAAGUGGACCUGGUUGUUCACUCCUUGAAGGACCUGCCCACUGUGCUUCCUCCUGGCUUCACCAUCGGAGCCAUCUGCAAGCGGGAAAACCCUCAUGAUGCUGUUGUCUUUCACCCAAAAUUUGUUGGGAAGACCCUAGAAACCCUGCCAGAGAAGAGUGUGGUGGGAACCAGCUCCCUGCGAAGAGCAGCCCAGCUGCAGAGAAAGUUCCCGCAUCUGGAGUUCAGGAGUAUUCGGGGAAACCUCAACACCCGGCUUCGGAAGCUGGACGAGCAGCAGGAGUUCAGUGCCAUCAUCCUGGCAACAGCUGGCCUGCAGCGCAUGGGCUGGCACAACCGGGUGGGGCAGAUCCUGCACCCUGAGGAAUGCAUGUAUGCUGUGGGCCAGGGGGCCUUGGGCGUGGAAGUGCGAGCCAAGGACCAGGACAUCUUGGAUCUGGUGGGUGUGCUGCACGAUCCCGAGACUCUGCUUCGCUGCAUCGCUGAAAGGGCCUUCCUGAGGCACCUGGAAGGAGGCUGCAGUGUGCCAGUAGCCGUGCAUACAGCUAUGAAGGAUGGGCAACUGUACCUGACUGGAGGAGUCUGGAGUCUAGACGGCUCAGAUAGCAUACAAGAGACCAUGCAGGCUACCAUCCAUGUCCCUGCCCAGCAUGAAGAUGGCCCUGAGGAUGACCCACAGUUGGUAGGCAUCACUGCUCGUAACAUUCCACGAGGGCCCCAGUUGGCUGCCCAGAACUUGGGCAUCAGCCUGGCCAACUUGUUGCUGAGCAAAGGAGCCAAAAACAUCCUGGAUGUUGCACGGCAGCUUAACGAUGCCCAUUAACUGGUUUGUGGGGCACAGAUGCCUGGGUUGCUGCUGUCCAGUGCCUACAUCCCGGGCCUCAGUGCCCCAUUCUCACUGCUAUCUGGGGAGUGAUUACCCCGGGAGACUGAACUGCAGGGUUCAAGCCUUCCAGGGAUUUGCCUCACCUUGGGGCCUUGAUGACUGCCUUGCCUCCUCAGUAUGUGGGGGCUUCAUCUCUUUAGAGAAGUCCAAGCAACAGCCUUUGAAUGUAACCAAUCCUACUAAUAAACCAGUUCUGAAGGUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-592.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -616.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 457.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.((.(((((((((((.(....))))).((((((((.(((.((..((((.((((.......((((((((....)))))..))).((((((((((....))))))))))......(((((((.(((((.((((((.((((((.((((((((...(((((....((((((.((((((......((((.........(((((..(.((((.....))))).)))))..))))...)))).)))))).))....)))))...((((((.......))))))...(((.....((((((((((((((.((....((((.((.(((((.((...)))))))..((((((((.(((.(((((((((....)))))))................(((.((........)))))(((((((.....(((((.(..((((.((((.....)))).)))).).)))))...))).))))(((((((......))))))).......(((((((....(((.((...(((..(((((...(((((......))))))))))..)))....(((((((.(......).)))))))...(((((..((((.....))))...))))))))))....)))))))...)).)))))))))))...(((((............(((((((...))))))).......((((((......((((.(((.(((((.....((((((((((...))..))))))))....))))))))))))..)))))).))))))).))))....)).)))))))))))))))))((((((((((..(((((.(.(((.((((((((....))))).)))..))).)))))).))))..)))))).....))))))))((...))....((((((((...))))).)))))))))))))))..)))))...)).))))).((((....)))).(((((((....)))).))))))).)))).))))).))))).)))..(((((((((((.....((((.....((((...((((((((((.........)))))..))))).)))).((.....)).((((((((.((((((..(((((((((((.........((((...(((((.((((((.....)))))))))))..))))....)))))).)))))(((..(((...((((((...))))))....)))..)))...)))))).))))))))....(((((((((.((.(((((((.((..((........))...)).))))))).)).)))))))))))))..))))))))))).(((.(((((((.(((((.(((((((....))))).)).))))).)))....((((((...))))))..)))).)))))))))).))))..((.(((..(((((((.(((....))))))))))..))))).((((((((((........................)))).))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,((.({(((((,{{({((.,,||||{.((({((((,{{{{((..((((,((((,,,,{,{((((((((.,,,|,,||{{{{..{{{||||||,..,,)))))))))),}},..(((((((.(((((.((((((.((((((.((((((((,.,(((((....((((((.((((((......((((.........(((((..{.{{{{.....,))}}.)))))..))))..,)))).)))))).))....)))))}}.((((((|....|.})))))...(((.....((((((((((((((.,,..,,(({{.((.(((((.((...))))))),,,{{{{{{{,{({,(,(((((((....)))))))....,,.{,|,,..,,{({.((........)))))(((({((.....(((((.{..((((.((((.....)))).)))).}.))))),,.)))||)))(((((((......)))))))....,,.({(((,,..,,|{{.,{...(((..(((((...(((((......))))))))))..}}}....(((((((.(......).)))))))..,(((({{,{(((,....||||.{{|||||,,}}}....}|||}||.{{||{||||}}||,||.,,,((({...})},.,.,,|||||||,,,)}))})),.{{|{.{{{{{,}}}}..(((({.,,.,,|||},.,,|||||{||||..}))).))))))),....}}}}}}||||||,.,,)))),))),))),)))),}}.},.))))))))))))))}})((((((((((..{((((,,.(((.((((((((....))))).)))..))).)))))).))))..)))))).},,}))))}}},,|...}}....((((((((...))))).)))))))))))))))..)))))...}}.||}||,(,.{,.,}}}},.{((((((,,..}}}}.}}}||||,||||,|||||.}||||.}}}.,(({{{{{|||{.....{||||..,.||||,,.||{||||{||,..,,,.,.}}}}}..}}}||,|}}|.{(.,{.,||.((((((((.((((((.,((((((({{{{....}}|}}((((...(((((.((((((,...})))))))))))..))))..},)}||}},},))}{((,.{{{...,{{{||,,.)}))))}}.,))),,)},...)))))).)))))))),...(((((((((.((.(((((((.((..((........))...)).))))))).)).)))))))))}}}}..}))}}}}}})).,||.,...{((,(((((.(((((((....)))))}}).))))).)))....{{{{{|...))))))}}))}).,)))))}})),))))}},|.(((..(((((((.(((....))))))))))..)))||,{(((((((((,,..........,,..........)))).)))))),,
Back