Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000427.3
Sequence Length
1245 nt
GC Content
0.6900
ACAUUGCCAGCAUCUUCUCUCCUCACUCACCCUUCCUGGUGCUUUGGGCUCUCCUUCCUUCUCAGACAAGAUGUCUUAUCAGAAAAAGCAGCCCACCCCUCAGCCCCCAGUGGACUGCGUGAAGACCUCUGGCGGCGGUGGCGGUGGCGGCGGCAGCGGCGGUGGUGGCUGCGGCUUCUUCGGCGGCGGCGGCUCAGGGGGCGGUAGCAGCGGUUCUGGCUGCGGCUACUCCGGCGGCGGUGGCUACUCUGGCGGCGGCUGCGGCGGGGGCUCCUCCGGCGGCGGGGGCGGGGGCGGCAUUGGAGGCUGCGGAGGGGGCUCCGGUGGGAGCGUCAAGUACUCCGGAGGCGGCGGCUCCUCCGGCGGGGGCUCUGGCUGUUUCUCCAGCGGUGGGGGCGGCUCCGGCUGCUUCUCCUCCGGUGGCGGCGGCUCCUCCGGGGGCGGCUCCGGCUGCUUCUCCAGCGGUGGGGGCGGCUCCUCCGGGGGCGGCUCCGGCUGCUUCUCCUCCGGCGGCGGCGGCUUCUCGGGCCAGGCGGUCCAGUGCCAGAGCUACGGAGGCGUCUCUAGCGGCGGCUCCUCCGGGGGCGGCUCCGGCUGCUUCUCCAGCGGCGGGGGCGGCGGCUCUGUCUGCGGCUACUCUGGCGGCGGCUCUGGCUGCGGCGGAGGCUCCUCUGGCGGCAGCGGCUCCGGCUACGUCUCCUCGCAGCAGGUCACUCAGACCUCGUGCGCGCCCCAGCCGAGUUACGGAGGGGGGUCGUCCGGCGGCGGCGGCAGCGGCGGAAGCGGCUGCUUCUCCAGCGGCGGGGGCGGCGGGAGCUCCGGCUGCGGCGGCGGCUCCUCCGGGAUUGGCAGCGGCUGCAUCAUCAGUGGCGGGGGCUCCGUCUGCGGAGGUGGUUCCUCUGGAGGCGGCGGCGGCGGCUCCUCCGUGGGUGGCUCCGGGAGUGGCAAGGGCGUCCCGAUCUGCCACCAGACCCAGCAGAAGCAGGCGCCUACCUGGCCGUCCAAAUAGAUCCCCCAGGGUACCACGGAGGCGAAGGAGUUGGAGGUGUUUUCCAGGGGCACCGAUGGGCUUAGAGCUCUCAUGAUGCUACCCGAGGUUUGCAAAUCCUUCAUGUCUUAACCUACCUGGAAGAAGCCAUUGAGCUCUCCGGCUGCAUCUAGUUCUGCUGUUUAGCCUCUUUGGUUUCUGUACAACUACCUCCCAACCCCAGUGCCUCAGUCAAUAAAUUUGCAAAUUCAUGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-625.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -643.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 551.13
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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