Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000494.4
Sequence Length
5612 nt
GC Content
0.5609
AACAUUUUUGAAAGAUCACUCAGCUUUAACACACCUUGGCUGGGUCUGGAUAAAAAAAAAGUGAGCACUGCAAAUUUCUAGAAGAAAACAUCAGGAGAAGAAAGAGAGAGGGGGAUUUAUUCAAAGUUGUUUCCAAUUCCUUCAAAACCUCAAACCAGGUGGCUAUGGUAUGGAUGUAACCAAGAAAAACAAACGAGAUGGAACUGAAGUCACUGAGAGAAUUGUCACUGAAACAGUAACCACAAGACUUACAUCCUUACCACCAAAAGGCGGGACCAGCAAUGGCUAUGCUAAAACAGCCUCUCUUGGUGGAGGGAGCCGGCUGGAGAAACAAAGCCUGACUCAUGGCAGCAGCGGCUACAUAAACUCAACUGGAAGCACACGAGGCCAUGCCUCCACCUCUAGUUACAGGAGGGCUCACUCACCUGCCUCCACUCUGCCCAACUCCCCAGGCUCAACCUUUGAAAGGAAAACUCACGUUACCCGCCAUGCGUAUGAAGGGAGCUCCAGUGGCAACUCUUCUCCGGAGUACCCUCGGAAGGAAUUUGCAUCUUCUUCAACCAGAGGACGGAGUCAAACACGAGAGAGUGAAAUUCGAGUUCGACUGCAGAGUGCGUCCCCAUCCACCCGAUGGACAGAAUUGGAUGAUGUUAAGCGUUUGCUCAAGGGGAGUCGAUCGGCAAGUGUGAGCCCCACCCGGAAUUCCUCCAACACACUCCCCAUCCCCAAGAAAGGCACUGUGGAGACCAAAAUUGUGACAGCGAGCUCCCAGUCGGUGUCAGGCACCUACGAUGCAACGAUCCUGGAUGCCAACCUUCCCUCCCAUGUGUGGUCCUCCACCCUGCCCGCGGGGUCCUCCAUGGGGACCUAUCACAACAACAUGACAACCCAGAGCUCAUCCCUCCUCAACACCAAUGCCUACUCUGCGGGAUCAGUCUUCGGAGUUCCAAACAACAUGGCGUCCUGCUCACCCACUUUGCACCCUGGACUCAGCACAUCCUCCUCAGUGUUUGGCAUGCAGAACAAUCUGGCCCCCAGCUUGACCACCCUGUCCCAUGGCACCACCACCACUUCCACAGCAUAUGGGGUGAAGAAAAACAUGCCCCAGAGUCCUGCGGCUGUGAACACUGGCGUUUCCACCUCCGCCGCCUGCACCACAAGUGUGCAGAGCGAUGACCUUUUGCACAAGGACUGCAAGUUCCUGAUCCUAGAGAAAGACAACACACCUGCCAAGAAGGAGAUGGAGCUGCUCAUCAUGACCAAGGACAGCGGGAAGGUCUUUACAGCCUCCCCUGCCAGCAUCGCUGCAACUUCUUUUUCAGAAGACACCCUAAAAAAAGAAAAGCAAGCUGCCUACAAUGCUGACUCAGGCCUAAAAGCCGAAGCUAAUGGAGACCUGAAGACUGUGUCCACAAAGGGCAAGACCACCACUGCAGAUAUCCACAGCUACGGCAGCAGUGGUGGUGGUGGCAGUGGAGGAGGUGGCGGUGUUGGUGGCGCUGGCGGCGGCCCUUGGGGACCAGCGCCAGCCUGGUGCCCCUGCGGCUCCUGCUGCAGCUGGUGGAAGUGGCUGCUGGGCCUGCUGCUCACCUGGCUGCUACUCCUGGGGCUGCUCUUCGGCCUCAUUGCUCUGGCGGAGGAGGUGAGGAAGCUGAAGGCGCGUGUGGAUGAGCUGGAGAGGAUCAGGAGGAGCAUACUGCCCUAUGGGGACAGCAUGGAUAGAAUAGAAAAGGACCGCCUCCAGGGCAUGGCACCCGCGGCGGGAGCAGACCUGGACAAAAUUGGGCUGCACAGUGACAGCCAGGAGGAGCUCUGGAUGUUCGUGAGGAAGAAGCUAAUGAUGGAACAGGAAAAUGGAAAUCUCCGAGGAAGCCCUGGCCCUAAAGGUGACAUGGGAAGUCCAGGCCCUAAAGGAGAUCGAGGGUUCCCUGGGACUCCAGGUAUCCCUGGGCCCUUGGGCCACCCAGGUCCACAAGGACCAAAGGGUCAAAAAGGCAGCGUGGGAGAUCCUGGCAUGGAAGGCCCCAUGGGCCAGAGAGGGCGAGAAGGCCCCAUGGGACCUCGUGGUGAGGCAGGGCCUCCUGGAUCUGGAGAGAAAGGGGAAAGAGGGGCUGCUGGUGAACCAGGUCCUCAUGGCCCACCUGGUGUCCCAGGUUCUGUGGGUCCCAAAGGUUCCAGCGGCUCUCCUGGCCCACAGGGCCCUCCAGGUCCUGUAGGUCUCCAAGGGCUCCGAGGUGAAGUAGGACUUCCUGGUGUCAAAGGUGACAAAGGACCAAUGGGACCACCAGGACCCAAAGGUGACCAGGGUGAGAAAGGACCUCGAGGCCUCACAGGCGAGCCUGGCAUGAGAGGUUUGCCUGGUGCUGUUGGUGAGCCCGGGGCUAAAGGAGCAAUGGGUCCUGCUGGCCCAGACGGACACCAAGGCCCAAGAGGUGAACAAGGUCUUACUGGGAUGCCUGGAAUCCGUGGCCCACCAGGACCUUCUGGAGACCCAGGAAAGCCAGGUCUCACAGGACCCCAGGGACCUCAGGGACUUCCCGGUACCCCUGGCCGACCAGGAAUAAAAGGUGAACCAGGAGCUCCAGGCAAGAUCGUGACUUCGGAGGGGUCAUCGAUGCUCACUGUCCCAGGCCCCCCAGGACCUCCUGGAGCCAUGGGACCCCCAGGACCUCCAGGUGCCCCAGGCCCUGCCGGCCCAGCUGGUCUCCCAGGACAUCAAGAAGUUCUUAAUUUACAAGGUCCCCCAGGCCCACCCGGCCCACGCGGGCCACCAGGGCCUUCCAUUCCAGGCCCACCAGGACCCCGAGGCCCACCAGGGGAGGGUUUGCCAGGCCCACCAGGCCCACCAGGAUCGUUCCUGUCCAACUCAGAAACCUUCCUCUCCGGCCCCCCAGGCCCACCUGGCCCCCCAGGUCCCAAGGGAGACCAAGGUCCCCCAGGCCCCAGAGGACACCAAGGCGAGCAAGGCCUCCCAGGUUUCUCAACCUCAGGGUCCAGUUCUUUCGGACUCAACCUUCAGGGACCACCAGGCCCACCUGGCCCCCAGGGACCCAAAGGUGACAAAGGUGAUCCAGGUGUUCCAGGGGCUCUUGGCAUUCCUAGUGGUCCUUCUGAAGGGGGAUCAUCAAGUACCAUGUACGUGUCAGGCCCGCCAGGGCCCCCUGGGCCCCCUGGGCCUCCGGGCUCUAUCAGCAGCUCUGGCCAGGAGAUUCAGCAGUACAUCUCUGAGUACAUGCAGAGUGACAGUAUUAGAUCUUACCUAUCCGGAGUUCAGGGUCCCCCAGGCCCACCUGGUCCCCCAGGACCUGUCACCACCAUCACAGGCGAGACUUUCGACUACUCAGAGCUGGCAAGCCACGUUGUGAGCUACUUACGGACUUCGGGGUACGGUGUCAGCUUGUUCUCGUCCUCCAUCUCUUCUGAAGACAUUCUGGCUGUGCUGCAGCGGGAUGACGUGCGUCAGUACCUACGUCAGUACUUGAUGGGCCCUCGGGGUCCGCCAGGGCCACCAGGAGCCAGUGGAGAUGGGUCCCUCCUGUCUUUGGACUAUGCAGAGCUGAGUAGUCGCAUUCUCAGCUACAUGUCGAGUUCUGGGAUCAGCAUUGGGCUUCCUGGUCCCCCGGGGCCCCCUGGCUUGCCGGGAACCUCCUAUGAGGAGCUCCUCUCCUUGCUGCGAGGGUCUGAAUUCAGAGGCAUCGUUGGACCCCCAGGUCCCCCGGGUCCACCAGGGAUCCCAGGCAAUGUGUGGUCCAGCAUCAGCGUGGAGGACCUCUCGUCUUACUUACAUACUGCCGGCUUGUCAUUCAUCCCAGGCCCUCCAGGACCUCCUGGUCCCCCAGGGCCUCGAGGGCCCCCGGGUGUCUCAGGAGCCCUGGCAACCUAUGCAGCUGAAAACAGCGACAGCUUCCGGAGCGAGCUGAUCAGCUACCUCACAAGUCCUGAUGUGCGCAGCUUCAUUGUUGGCCCCCCAGGCCCUCCUGGGCCGCAGGGACCCCCUGGGGACAGCCGCCUCCUGUCCACGGAUGCCUCCCACAGUCGGGGUAGCAGCUCCUCCUCACACAGCUCAUCUGUCAGGCGGGGCAGCUCCUACAGCUCUUCCAUGAGCACAGGAGGAGGUGGUGCAGGCUCCCUGGGUGCAGGCGGUGCCUUUGGUGAAGCUGCAGGAGACAGGGGUCCCUAUGGCACUGACAUCGGCCCAGGCGGAGGCUAUGGGGCAGCAGCAGAAGGCGGCAUGUAUGCUGGCAAUGGCGGACUAUUGGGAGCUGACUUUGCUGGAGAUCUGGAUUACAAUGAGCUGGCUGUGAGGGUGUCAGAGAGCAUGCAGCGUCAGGGCCUACUGCAAGGGAUGGCCUACACUGUCCAGGGCCCACCAGGCCAGCCUGGGCCACAGGGGCCACCCGGCAUCAGCAAGGUCUUCUCUGCCUACAGCAACGUGACUGCGGACCUCAUGGACUUCUUCCAAACUUAUGGAGCCAUUCAAGGACCCCCUGGGCAAAAAGGAGAGAUGGGCACUCCAGGACCCAAAGGUGACAGGGGCCCUGCUGGGCCACCAGGUCAUCCUGGGCCACCUGGCCCUCGAGGACACAAGGGAGAAAAAGGAGACAAAGGUGACCAAGUCUAUGCUGGGCGGAGAAGGAGAAGAAGUAUUGCUGUCAAGCCGUGAGCUAGCCAUGGCAGGACAGCUCCUGGACCAGGUCUCAUAAUGCAUGUGGCACUUAGGUCCAAGGUCUCCAGAGGGUGAAAGCUGGAGUCUGUCAAUGUCCUACUGAGACAGCACAGCCAACCUAGCUAGCAACAUUUGUUUUAGUCUGAACAAUAUAUACUUAUAGAAUUCAGUCAAAGAUACACAAUCUGAAACAGCUUCAUGGGGUGGACUCUAACAGUAGUUGCAAUGUUUUAGAAUGAGACUUACUUCUCUGCUAUCUAGAUCUGAACUCCUUGGCUUCUUUACUUAGUUCAAGCCCCAGCCUAGGAAAGCCAGUUACAUAAAAGUUGGCUCA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2242.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2330.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 1381.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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