Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000517.6
Sequence Length
576 nt
GC Content
0.6441
ACUCUUCUGGUCCCCACAGACUCAGAGAGAACCCACCAUGGUGCUGUCUCCUGCCGACAAGACCAACGUCAAGGCCGCCUGGGGUAAGGUCGGCGCGCACGCUGGCGAGUAUGGUGCGGAGGCCCUGGAGAGGAUGUUCCUGUCCUUCCCCACCACCAAGACCUACUUCCCGCACUUCGACCUGAGCCACGGCUCUGCCCAGGUUAAGGGCCACGGCAAGAAGGUGGCCGACGCGCUGACCAACGCCGUGGCGCACGUGGACGACAUGCCCAACGCGCUGUCCGCCCUGAGCGACCUGCACGCGCACAAGCUUCGGGUGGACCCGGUCAACUUCAAGCUCCUAAGCCACUGCCUGCUGGUGACCCUGGCCGCCCACCUCCCCGCCGAGUUCACCCCUGCGGUGCACGCCUCCCUGGACAAGUUCCUGGCUUCUGUGAGCACCGUGCUGACCUCCAAAUACCGUUAAGCUGGAGCCUCGGUAGCCGUUCCUCCUGCCCGCUGGGCCUCCCAACGGGCCCUCCUCCCCUCCUUGCACCGGCCCUUCCUGGUCUUUGAAUAAAGUCUGAGUGGGCAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-219.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -228.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 124.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((......))).))))((((...(((....)))...))))(((((.((.((((.....(((((((((((((((...(((((((.(.((.....((.((((((((((.(..((....(((.((((...)))).)))...))..)))))).....))))).)))).).)))))))((((....))))..))))))).(((((((...(((((.(((.((((.(((.((........))))))))((.(((((.(.....).)).))).)).((((((((.((((....(((....)))...)))).))))))))..(((((.(.....(((((.((((((.(((((((.(((((.(.((((.............)))).).)))))...)))).))).........(((.....)))))))))..).)))).....).)))))..................((((...(((...)))...)))).(((((.((((...)))).))))).......)))).)))))...)))))))...)).)))))).....))))..)).)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{{.(((((((......))).))))|||,,,{{{,...}))}...}}},(((((.((.((((.....(((((((((((((((,,.(((((((.(.({..,..((.((((((((((.((.((....(((.((((...)))).)))..,))).,))))).....))))).)))).}.}))))))((((....)))),,))))))).{((((((...(((((.(((.(({{{{((.({|,..,...||||}||}((.{((((.,....,),)),,)).)).((((((((.((((....(((....)))...)))).))))))))..(((((.{.....(((((.((((((.(((((((.(((((.(.((((.,...........)))).).)))))...)))).))).,,,.....||{.....}}}))))))..).)))).....}.))))),,.............,,,||||...|||,,,))),..)}}).(((((.((((...)))).)))))......,,))).)))))...))))))}...))))))})).....))))..)).)))))..
Back