Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000542.5
Sequence Length
3550 nt
GC Content
0.5330
AGGCUGCAGAGGUGCCAUGGCUGAGUCACACCUGCUGCAGUGGCUGCUGCUGCUGCUGCCCACGCUCUGUGGCCCAGGCACUGCUGCCUGGACCACCUCAUCCUUGGCCUGUGCCCAGGGCCCUGAGUUCUGGUGCCAAAGCCUGGAGCAAGCAUUGCAGUGCAGAGCCCUAGGGCAUUGCCUACAGGAAGUCUGGGGACAUGUGGGAGCCGAUGACCUAUGCCAAGAGUGUGAGGACAUCGUCCACAUCCUUAACAAGAUGGCCAAGGAGGCCAUUUUCCAGGACACGAUGAGGAAGUUCCUGGAGCAGGAGUGCAACGUCCUCCCCUUGAAGCUGCUCAUGCCCCAGUGCAACCAAGUGCUUGACGACUACUUCCCCCUGGUCAUCGACUACUUCCAGAACCAGACUGACUCAAACGGCAUCUGUAUGCACCUGGGCCUGUGCAAAUCCCGGCAGCCAGAGCCAGAGCAGGAGCCAGGGAUGUCAGACCCCCUGCCCAAACCUCUGCGGGACCCUCUGCCAGACCCUCUGCUGGACAAGCUCGUCCUCCCUGUGCUGCCCGGGGCCCUCCAGGCGAGGCCUGGGCCUCACACACAGGAUCUCUCCGAGCAGCAAUUCCCCAUUCCUCUCCCCUAUUGCUGGCUCUGCAGGGCUCUGAUCAAGCGGAUCCAAGCCAUGAUUCCCAAGGGUGCGCUAGCUGUGGCAGUGGCCCAGGUGUGCCGCGUGGUACCUCUGGUGGCGGGCGGCAUCUGCCAGUGCCUGGCUGAGCGCUACUCCGUCAUCCUGCUCGACACGCUGCUGGGCCGCAUGCUGCCCCAGCUGGUCUGCCGCCUCGUCCUCCGGUGCUCCAUGGAUGACAGCGCUGGCCCAAGGUCGCCGACAGGAGAAUGGCUGCCGCGAGACUCUGAGUGCCACCUCUGCAUGUCCGUGACCACCCAGGCCGGGAACAGCAGCGAGCAGGCCAUACCACAGGCAAUGCUCCAGGCCUGUGUUGGCUCCUGGCUGGACAGGGAAAAGUGCAAGCAAUUUGUGGAGCAGCACACGCCCCAGCUGCUGACCCUGGUGCCCAGGGGCUGGGAUGCCCACACCACCUGCCAGGCCCUCGGGGUGUGUGGGACCAUGUCCAGCCCUCUCCAGUGUAUCCACAGCCCCGACCUUUGAUGAGAACUCAGCUGUCCAGCUGCAAAGGAAAAGCCAAGUGAGACGGGCUCUGGGACCAUGGUGACCAGGCUCUUCCCCUGCUCCCUGGCCCUCGCCAGCUGCCAGGCUGAAAAGAAGCCUCAGCUCCCACACCGCCCUCCUCACCGCCCUUCCUCGGCAGUCACUUCCACUGGUGGACCACGGGCCCCCAGCCCUGUGUCGGCCUUGUCUGUCUCAGCUCAACCACAGUCUGACACCAGAGCCCACUUCCAUCCUCUCUGGUGUGAGGCACAGCGAGGGCAGCAUCUGGAGGAGCUCUGCAGCCUCCACACCUACCACGACCUCCCAGGGCUGGGCUCAGGAAAAACCAGCCACUGCUUUACAGGACAGGGGGUUGAAGCUGAGCCCCGCCUCACACCCACCCCCAUGCACUCAAAGAUUGGAUUUUACAGCUACUUGCAAUUCAAAAUUCAGAAGAAUAAAAAAUGGGAACAUACAGAACUCUAAAAGAUAGACAUCAGAAAUUGUUAAGUUAAGCUUUUUCAAAAAAUCAGCAAUUCCCCAGCGUAGUCAAGGGUGGACACUGCACGCUCUGGCAUGAUGGGAUGGCGACCGGGCAAGCUUUCUUCCUCGAGAUGCUCUGCUGCUUGAGAGCUAUUGCUUUGUUAAGAUAUAAAAAGGGGUUUCUUUUUGUCUUUCUGUAAGGUGGACUUCCAGCUUUUGAUUGAAAGUCCUAGGGUGAUUCUAUUUCUGCUGUGAUUUAUCUGCUGAAAGCUCAGCUGGGGUUGUGCAAGCUAGGGACCCAUUCCUGUGUAAUACAAUGUCUGCACCAAUGCUAAUAAAGUCCUAUUCUCUUUUAUGAGAAAGAAAAAGACACCGUCCUUUAAAGUGCUGCAGUAUGGCCAGACGUGGUGGCUCACACCUGCAAUCCCAGCACCUUAGGAGGCCGAGGCAGGAGGAUCCUUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUCGCCAACAUGGUGAAACCCCAUUUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCAAGUGUGGUGGCAUAUGCCUGUAAUCCCAACUACUCAGAAGGCCGAGGCAGGAGAAUUACUUGAACGCAGGAGAAUCACUGCAGCCCAGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUUGCACCACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGCAAGACUCCAUCUCAGUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAAAGCGCUGCAGUAGCUGUGGCCUCACCCUGAAGUCAGCGGGCCCAGGCCUACCUCACUCUCUCCCUUGGCAGAGAAGCAGACGUCCAUAGCUCCUCUCCCUCACAAGCGCUCCCAGCCUGCCCUCCAGCUGCUGCUCUCCCCUCCCAGUCUCUACUCACUGGGAUGAGGUUAGGUCAUGAGGACACCAAAAACCUAAAAAUAAACAAAAAGCCAAACAAGCCUUAGCUUUUCUUAAAGACUGAAAUGCCUGGAAGUGUCCCUUUAUUUAUAAAAUAACUUUUGUCAUAUUUCUUAUACAUGUUUCUUGUAAGAAAUUCAGAAACUACAGACAAAGAGAGUGGAAAUUACCCACUGUCAGGCCUCUGAGCCCAAGCUAAGCCAUCAUAUCCCCUGUGCCCUGCACGUAUACACCCAGAUGGCCUGAAGCAACUGAAGAUCCACAAAAGAAGUGAAAAUAGCCAGUUCCUGCCUUAACUGAUGACAUUCCACCAUUGUGAUUUGUUCCUGCCCCACCCUAACUGAUCAAUUGACCUUGUGACAAUACACCUUCCCCACCCUUGAGAAGGUGCUUUGUAAUAUUCUCCCCACCCACCCCACGCCCGCACCCCCGCACCCUUAAGAAGGUAUUUUGUAAUAUUCUCUCCGCCAUUGAGAAUGUGCUUUGUAAGAUCCACCCCCUGCCCACAAAAAAUUGCUCCUAACUCCACCGCCUAUCCCAAACCUACAAGAACUAAUGAUAAUCCCACCACCCUUUGCUGACUCUUUUUGGACUCAGCCCACCUGCACCCAGGUGAUUAAAAAGCUUUAUUGUUCACACAAAGCCUGUUUGGUAGUCUCUUCACAGGGAAGCAUGUGACACCCACAAUCCCACCUAGCCCAGGAGAGAGCUACGGCAGGGUGUGUGUUUUGACACUGAGCUUGGGGCUUUUUCCAUCUUCUCCCCACAGCCUCUGGCUCCACACCUCCACCGUUCAAGCGCCAGAAAGAGCUGUCUAUGCAGCCUGCUCUUGGGCCUGGGGAUGAGACACACAAUUCAUUGGCUCCUGGAUUUUAAGUAGACAUUUGUAAAUCUAUAGCUAACUACUGUCCUUAAAGCCAUUGUUUCCAUUACAAAAUCCAACUCUCUGAGAGAAAAGGGUGUUUUAAAUUUAAAAAAAUAAAAACAAAAAAGUUUGAUUGAGACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1209.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1269.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 962.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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