Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_000558.5

Sequence Length

577 nt

GC Content

0.6447

ACUCUUCUGGUCCCCACAGACUCAGAGAGAACCCACCAUGGUGCUGUCUCCUGCCGACAAGACCAACGUCAAGGCCGCCUGGGGUAAGGUCGGCGCGCACGCUGGCGAGUAUGGUGCGGAGGCCCUGGAGAGGAUGUUCCUGUCCUUCCCCACCACCAAGACCUACUUCCCGCACUUCGACCUGAGCCACGGCUCUGCCCAGGUUAAGGGCCACGGCAAGAAGGUGGCCGACGCGCUGACCAACGCCGUGGCGCACGUGGACGACAUGCCCAACGCGCUGUCCGCCCUGAGCGACCUGCACGCGCACAAGCUUCGGGUGGACCCGGUCAACUUCAAGCUCCUAAGCCACUGCCUGCUGGUGACCCUGGCCGCCCACCUCCCCGCCGAGUUCACCCCUGCGGUGCACGCCUCCCUGGACAAGUUCCUGGCUUCUGUGAGCACCGUGCUGACCUCCAAAUACCGUUAAGCUGGAGCCUCGGUGGCCAUGCUUCUUGCCCCUUGGGCCUCCCCCCAGCCCCUCCUCCCCUUCCUGCACCCGUACCCCCGUGGUCUUUGAAUAAAGUCUGAGUGGGCGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-217.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -227.65

Frequency: 0.0000

Diversity: 120.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((((......))).))))((((...(((....)))...))))(((((.((.((((.....((((((((((..((((((....(((.(.(((.(..((.(((...((.((((((((((.(((.((((...)))).)))..........................((.(((.(((((((((....)))).....))))).)))))...(((((((((((((((.......(((((...(((((((.(((.((.....)).))))).))).)).((((((((.((((....(((....)))...)))).))))))))..))))).......(((((.((((((.(((((((.(((((.(.((((.............)))).).)))))...)))).))).........(((.....)))))))))..).)))).....(((((.(((((.............)))))..))))))))))).)))))))))....)))))))).....))))...))).))..).))).)))))))))).)))).)))))).....))))..)).)))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,,,.(((((((......))).))))|||,,,{{{,...}))}...}}}}(((((.((.((((.....((((((((((..((((((....(((.(.(((.(..((.(((...((.({((((((((.(({,((((,..,}}),))),,............,...........((.(((.(((((({((....}}},.}}.}))))).)))))...(((((((((((((((,.{{.(,({{((..,(({((((.(((.((.....)).)))))},)),)).((((((((.((((....(((....)))...)))).))))))))..||}}}.,.....(((((.{(((({.{((((((.(((((.{.((((.,...........)))).).)))))...)))).))}.{{......(({.....}))})))}}..),)})),}}},|{{{{,|{{{,......,....,,))))),.,))}))))))).)))))))))....)))))))).....))}}...))).))..).))).)))))))))).))))))))))).....))))..)).)))))..