Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000600.5
Sequence Length
1127 nt
GC Content
0.4250
AUUCUGCCCUCGAGCCCACCGGGAACGAAAGAGAAGCUCUAUCUCCCCUCCAGGAGCCCAGCUAUGAACUCCUUCUCCACAAGCGCCUUCGGUCCAGUUGCCUUCUCCCUGGGGCUGCUCCUGGUGUUGCCUGCUGCCUUCCCUGCCCCAGUACCCCCAGGAGAAGAUUCCAAAGAUGUAGCCGCCCCACACAGACAGCCACUCACCUCUUCAGAACGAAUUGACAAACAAAUUCGGUACAUCCUCGACGGCAUCUCAGCCCUGAGAAAGGAGACAUGUAACAAGAGUAACAUGUGUGAAAGCAGCAAAGAGGCACUGGCAGAAAACAACCUGAACCUUCCAAAGAUGGCUGAAAAAGAUGGAUGCUUCCAAUCUGGAUUCAAUGAGGAGACUUGCCUGGUGAAAAUCAUCACUGGUCUUUUGGAGUUUGAGGUAUACCUAGAGUACCUCCAGAACAGAUUUGAGAGUAGUGAGGAACAAGCCAGAGCUGUGCAGAUGAGUACAAAAGUCCUGAUCCAGUUCCUGCAGAAAAAGGCAAAGAAUCUAGAUGCAAUAACCACCCCUGACCCAACCACAAAUGCCAGCCUGCUGACGAAGCUGCAGGCACAGAACCAGUGGCUGCAGGACAUGACAACUCAUCUCAUUCUGCGCAGCUUUAAGGAGUUCCUGCAGUCCAGCCUGAGGGCUCUUCGGCAAAUGUAGCAUGGGCACCUCAGAUUGUUGUUGUUAAUGGGCAUUCCUUCUUCUGGUCAGAAACCUGUCCACUGGGCACAGAACUUAUGUUGUUCUCUAUGGAGAACUAAAAGUAUGAGCGUUAGGACACUAUUUUAAUUAUUUUUAAUUUAUUAAUAUUUAAAUAUGUGAAGCUGAGUUAAUUUAUGUAAGUCAUAUUUAUAUUUUUAAGAAGUACCACUUGAAACAUUUUAUGUAUUAGUUUUGAAAUAAUAAUGGAAAGUGGCUAUGCAGUUUGAAUAUCCUUUGUUUCAGAGCCAGAUCAUUUCUUGGAAAGUGUAGGCUUACCUCAAAUAAAUGGCUAACUUAUACAUAUUUUUAAAGAAAUAUUUAUAUUGUAUUUAUAUAAUGUAUAAAUGGUUUUUAUACCAAUAAAUGGCAUUUUAAAAAAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-305.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -325.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 221.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((....((((....((((..((.((((...)))).))))))(((((((((.((((..((((.....(((.((((((((.((((....(((((.(((((....(((.(((((...((((((..((..(((((((((((((............)))).))))...........))))).))..))).))).)))))..(((((((((.....((((((........)))))).......((((..(((......))).))))..)))))((((((.((....)).))))))))))...)))....))))))))))(((........)))..((.((....)).)).((((..(((((((....))).))))...))))..)))).).))))..))).)))..))))..)))).)))))))))(((((((((..((((.(.(...(((((((..(((((((((((((((.((......))(((((((((((((((((.......(((.((.......((((((((......(((...........)))....................((((........((((((..........)))))).........)))))))))))))).))).......)))).)))))))))))))(((((((.(((((((..((((((((((((((....((.......))..)))).))))))...))))))))....))).)))))))....(((.(((....))).)))((((((.((..((((.....((((((....))))))...)))).)).)).))))..)))))))))(((((....))))).........(((((.(((((((..(((.(((.......))).)))..))))))).))))).((((...))))...((((...))))....((((((((((((......(((.((......)).))).........))))))))))))))))))..))).)))).).).))))..))))))))).....)))).........(((((((....))))))).(((((((((....)))))))))....((((......))))......))))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((....((((....((((..((.((((...)))).))))))(((((((((.((((..((((.....(((.((((((((.((((,,,,(((({{((((({(..(((,(((((.{.((((((..((..(((((((((((((............)))).))))...........))))).))..))).))).))))).,{{.{{({{{,,{..((((((........)))))).......{{{,..(((......))),))))...)))}((((((.((....)).)))))),|.....)}}....))))))))))(((........)))..{{.,(,...}},)).{(({..(((((((....)))},)))...)))}..)))).).))))..))).)))..))))..)))).)))))))))(((((((((..((((.(.(...(((((((..((((((((((((((({(({{{...||(((((((((((((((((.......(((.((.......((((((((......(({...........}}}............,,......((((...,,,..((((((.,......}.)))))).........)))))))))))))}.))).......)))),})))))))))))}.,||,||}|||{{{(,,(((,((((((((((....((.......))..)))).))))))..,}}}},}}}....||}.},}}}},....(((.(((....))).))){{||||.||..{(((.,{,,((((((....))))))...}}}).)).)}.,,}}..))))))))),{{{{....}}}},........,{((((.(((((((..(((.(((.......))).)))..))))))).})))}|.,{,...,}}|||.{{{{...}})).,,.((((((((((({..,.{{({{.{({,,...}),)),...,.}}}.))))))))))))))))))..)))}}))).).).))))..))))))))).....))))....{{{{.(((((({....})))))}.||||{{||{|||||||,}})))}}}.{(((......)))}......))))..............
Back