Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_000762.6
Sequence Length
1761 nt
GC Content
0.5662
AUCUAUCAUCCCACUACCACCAUGCUGGCCUCAGGGAUGCUUCUGGUGGCCUUGCUGGUCUGCCUGACUGUAAUGGUCUUGAUGUCUGUUUGGCAGCAGAGGAAGAGCAAGGGGAAGCUGCCUCCGGGACCCACCCCAUUGCCCUUCAUUGGAAACUACCUGCAGCUGAACACAGAGCAGAUGUACAACUCCCUCAUGAAGAUCAGUGAGCGCUAUGGCCCCGUGUUCACCAUUCACUUGGGGCCCCGGCGGGUCGUGGUGCUGUGUGGACAUGAUGCCGUCAGGGAGGCUCUGGUGGACCAGGCUGAGGAGUUCAGCGGGCGAGGCGAGCAAGCCACCUUCGACUGGGUCUUCAAAGGCUAUGGCGUGGUAUUCAGCAACGGGGAGCGCGCCAAGCAGCUCCGGCGCUUCUCCAUCGCCACCCUGCGGGACUUCGGGGUGGGCAAGCGAGGCAUCGAGGAGCGCAUCCAGGAGGAGGCGGGCUUCCUCAUCGACGCCCUCCGGGGCACUGGCGGCGCCAAUAUCGAUCCCACCUUCUUCCUGAGCCGCACAGUCUCCAAUGUCAUCAGCUCCAUUGUCUUUGGGGACCGCUUUGACUAUAAGGACAAAGAGUUCCUGUCACUGUUGCGCAUGAUGCUAGGAAUCUUCCAGUUCACGUCAACCUCCACGGGGCAGCUCUAUGAGAUGUUCUCUUCGGUGAUGAAACACCUGCCAGGACCACAGCAACAGGCCUUUCAGUUGCUGCAAGGGCUGGAGGACUUCAUAGCCAAGAAGGUGGAGCACAACCAGCGCACGCUGGAUCCCAAUUCCCCACGGGACUUCAUUGACUCCUUUCUCAUCCGCAUGCAGGAGGAGGAGAAGAACCCCAACACGGAGUUCUACUUGAAAAACCUGGUGAUGACCACGUUGAACCUCUUCAUUGGGGGCACCGAGACCGUCAGCACCACCCUGCGCUAUGGCUUCUUGCUGCUCAUGAAGCACCCAGAGGUGGAGGCCAAGGUCCAUGAGGAGAUUGACAGAGUGAUCGGCAAGAACCGGCAGCCCAAGUUUGAGGACCGGGCCAAGAUGCCCUACAUGGAGGCAGUGAUCCACGAGAUCCAAAGAUUUGGAGACGUGAUCCCCAUGAGUUUGGCCCGCAGAGUCAAAAAGGACACCAAGUUUCGGGAUUUCUUCCUCCCUAAGGGCACCGAAGUGUACCCUAUGCUGGGCUCUGUGCUGAGAGACCCCAGUUUCUUCUCCAACCCCCAGGACUUCAAUCCCCAGCACUUCCUGAAUGAGAAGGGGCAGUUUAAGAAGAGUGAUGCUUUUGUGCCCUUUUCCAUCGGAAAGCGGAACUGUUUCGGAGAAGGCCUGGCCAGAAUGGAGCUCUUUCUCUUCUUCACCACCGUCAUGCAGAACUUCCGCCUCAAGUCCUCCCAGUCACCUAAGGACAUUGACGUGUCCCCCAAACACGUGGGCUUUGCCACGAUCCCACGAAACUACACCAUGAGCUUCCUGCCCCGCUGAGCGAGGGCUGUGCCGGUGCAGGUCUGGUGGGCGGGGCCAGGGAAAGGGCAGGGCCAAGACCGGGCUUGGGAGAGGGGCGCAGCUAAGACUGGGGGCAGGAUGGCGGAAAGGAAGGGGCGUGGUGGCUAGAGGGAAGAGAAGAAACAGAAGCGGCUCAGUUCACCUUGAUAAGGUGCUUCCGAGCUGGGAUGAGAGGAAGGAAACCCUUACAUUAUGCUAUGAAGAGUAGUAAUAAUAGCAGCUCUUAUUUCCUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-674.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -707.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 490.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((((.......((((.((((((..(((((((((((.((((.(((((((..(((..(((.(((((((((.(.....).)))))..))))))).)))..)))))))(((.((((((((((((.....)))(((((..((((((.(((...(((((((..(((....))).))))..)))....)))...))))))..))))).(((((.((((((.((.((((......((((((((((...(((((..(((((((((..(((.(.((.((((.(((((((((.((..((((((((((..(((((((.(((.(((((.((.(((.(((((.(((((..((((((........(((.(((((((.(.(((......))).).)))))))))).(((((((.(((((.(.....((((((((........))))))))....).))))).))..)))))..))))))..)))))..))))).))).))..)))))....(((..((((((((((...........((((((((((...((((.((...((((((((.(.((..........)).).))))))))..(((((.((....)).)))))....(((((....((((.((.(((.(((.(((....))))))))).))))))....))))))).))))...((((...))))...(((.(((((...(((.((((..((.(((((((.(......).)))))))...)).)))))))..))))).)))))))))))))..........)))).))))))..)))...((((...)))).....)))))))))).(((.(((.......))).)))(((.(((((.((.....)).))))).)))......)))))).....))))...)).)))))...)))).)))).)).).))).)))))))))))))).....((.(((((((((.((((...((..(((....)))..))(((..(((....)))..))).....)))).))))))))))))))..))))))).)))).)).)))))))).))).......)))))))))..)))..(((((((..((((((((.....((.(((...(((.((((.....)))).)))....)))))))))))))..))))))).....(((...)))))))))))))).))))..((((((((((......))))..)))))).((((((((........(((......)))((.((..((((.((.((.(((((((((....(((..........)))...))))))))).)))))))).)))).........))))))))...)))))).))))((((((((((((((((.....(((((((((....((((((((((..(.((.(((((((.(((..((((((....))))))(((((.(.((..(((((((((.(..((((..(((.((........)).)))..((((((((..((.(((.((((......)))).))).)).))))))))..))))..)))))))))).....)).).)))))..)))(((...)))..))))))))))..)).))))).)))......))))))))).....))))))))))).....((((((.((....(((...)))..)).)))))).))))))))))))..)))((((((...........((((((..............)))))).......))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,({.(((((((.......((((.((((((..(((((((((((.((((,(((((({{((((,,,{({{{{..,{{{.{,,,.{|{|||||,|||}||||,{({{{|{|||{((({.({(((({{{{|{.....)))|{|||,.{|{{{{.(({...{{{((((..(((....))).))))..))}....}))...)})}))..))))),{{({{.((((((.((,((({......((((((({{{,.,(((((..(((((((((..(((.(.((.((((.(((((((((.((,{(({{((((((,,((({{{{||||,(((((.((.(((.(((((.(((((..(((((({,....,,(((.(((((((.{.(((......))}.}.)))))))})).{{{{{,(,(((((,(...,,((((((((........))))))))....}.))})).}},,))))))}}}))))..)))))..))))).))).))..)))))...{(((..((((((((((.......,.{,{{((((((({,,,{{{{.({...((((((((.(.((..........)).).)))))))).,|{{{{.{{...,)).}}}||,|{{(((((....((((,({.(((.(((.(((....))))))))),)}))))....)))))}}.)))),..((({...})))...(((.{((((...(((.((((..((.(((((((.(,....,).)))))))...)).)))))))..))))).)))})))))))))},........)))).)))))).,)))...((((...)))).....,}}}||||||{(((,({{...,,..)))})))|{|.(((((,({.....)).))))).}}}......})))))....,)))}...)).))))),..}))).)))).)).).))).)))))))))))))),{...((.(((((((((.((((...((..(((....)))..))(((..(((....)))..))).....)))).)))))))))))))}..))))))).)))),)),)))))),}.}|},,,....|||||}||}.,|||.{((((((({,,,,,||||,...{((.(((...(((.((((.....)))).)))....))))))}}})))),|))))),),.}}))},..)))}))))))))))).))))..((((((,(((.,....),)),.)))))).{(((((((........(((......})){{.((..((((.(,{((.(((((((((....,{{{({,,,...,)))},.))))))))).)))))))).)))}....,.,..)))))))}...)))))).}))),((((((((((((((((.((((({,{,({(....((((((((((..(.((.(((((((......((((((....)))))){(((,...,,}}|(((,((((.(..((((,.,,..,,......,,,},|||{{((((((((.,{(.(((.((((......)))).))).)).)))))))).,))))..}}})}}||||.....,}}}})))))}..}.|||}.})),..))))))))))..)).))))))}})......)))))))))...)}))))))))))}....,|{|||({(((.{..(({{{|,..,))})),,,).)))))))))))).||||((({{,..,,..,{{..{{{{{{.,,,,||.||....}}.}},},,,}}.})))))..
Back