Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001018.5

Sequence Length

501 nt

GC Content

0.6128

CAAAGCGAUCUCUUCUGAGGAUCCGGCAAGAUGGCAGAAGUAGAGCAGAAGAAGAAGCGGACCUUCCGCAAGUUCACCUACCGCGGCGUGGACCUCGACCAGCUGCUGGACAUGUCCUACGAGCAGCUGAUGCAGCUGUACAGUGCGCGCCAGCGGCGGCGGCUGAACCGGGGCCUGCGGCGGAAGCAGCACUCCCUGCUGAAGCGCCUGCGCAAGGCCAAGAAGGAGGCGCCGCCCAUGGAGAAGCCGGAAGUGGUGAAGACGCACCUGCGGGACAUGAUCAUCCUACCCGAGAUGGUGGGCAGCAUGGUGGGCGUCUACAACGGCAAGACCUUCAACCAGGUGGAGAUCAAGCCCGAGAUGAUCGGCCACUACCUGGGCGAGUUCUCCAUCACCUACAAGCCCGUAAAGCAUGGCCGGCCCGGCAUCGGGGCCACCCACUCCUCCCGCUUCAUCCCUCUCAAGUAAUGGCUCAGCUAAUAAAGGCGCACAUGACUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-188.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -195.59

Frequency: 0.0000

Diversity: 167.48

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((.((((...(((......)))..)))).)).......(((.((..((.(((((((.....((((..((......)).)))).((((.((((((...((((((((.(((((..((((.((.((((.(((.((........))))).))))(((((((.((....(..(((((((((((....(((((.....)))))...))))...)).)))))..)....)).))))))).(((((((((((((.((((((..((((((((((((.(..(((.(((.((......))))).)))..).))).)))..)))))).....(((..((.(((((......))))).))..)))(((.....))))))))).))..)))...)))))))).........)).))))..))))).)))))..))).)))))))))).........))))))).)).))))).(((.(((((...(((......))))).))).)))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

....((.,((((({(((...,{{,,,...}}},|)}}}}|,}|||}{{..((,,,,(((({...}}}||..,|}}..,,.,.||||.((((.({{{{{.,,((((((((.(((((..{{{{.((|((((.,{|,||},,...,,|}||},|}}}(((((((.((....(..(((((((((((...,((({{.....))))}...))))..})),}))))..}....)).))))))).,{(((((((({((,(((((({.(((((({(((((.{..(((.(((.{(......}}))),))),.}.))).))),.)))))).}...(((..((.(((({......})))).))..))){({.....}}|||||}}.}}||)|}..,|)))))}}.........)),))}}..)}})),))|||,{}}}.})})))))}})),},..}}),))))).})}.}},..{{{.{((((...{{{......))))).))).}}}....