Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001127895.2

Sequence Length

2225 nt

GC Content

0.6521

ACUUCGCUGGGAGCCUUCCCGGCGCGCAAGCCGGAUCCGGCAGUGCUGCGGGGAGGAGAGAGGACGAGGCGGCGGCGGCAGCAGGAGGUGGGGGACCGAUCGCGCCGGGGGCCGAAGAGGAACGCCGCCCCGCGCCCUCUCGCUCCCCGCACGCUCCGGCUGCCGGCCCCACGCUGCUCGCCCACAGAUCGCACUGGGUUCCGCUUGGAGCGGGCGGAGGCACCGGGCCCGAGCUGGGUCGGAGGUCCUCUCCGCCGCCUGCGCGCCCCAAGCAGAGGAUCCGCCGCGGAGAACCGCUCCCGGACUGGAGGCGCCCGCGGCCUCGGGUGCGUCCGCUGCGCCAGGUUUAAAGGUCAACAAGAAUAUCUUACCUUAAUUUGACAAGUACGCAAGAAAUAAUGCAAGACUCGUUUAUGUUCAGAUCUCGGCCUGAUGGACGCCUGGUGUGGACGAUGAGGGAAGAACGUGCCCCCCACACCCAAGAGGUGACCCCUGAGCCAGCCCCGGAUGACCCUGCGACCUGGAACAAUGCGGCUGGCCUGCAUGUUCUCUUCCAUCCUGCUGUUCGGAGCUGCAGGCCUCCUCCUCUUCAUCAGCCUGCAGGACCCUACGGAGCUCGCCCCCCAGCAGGUGCCAGGAAUAAAGUUCAACAUCAGGCCAAGGCAGCCCCACCACGACCUCCCACCAGGCGGCUCCCAGGAUGGUGACUUGAAGGAACCCACAGAGAGGGUCACUCGGGACUUAUCCAGUGGGGCCCCGAGGGGCCGCAACCUGCCAGCGCCUGACCAGCCUCAACCCCCGCUGCAGAGGGGAACCCGUCUGCGGCUCCGCCAGCGCCGUCGCCGUCUGCUCAUCAAGAAAAUGCCAGCUGCGGCGACCAUCCCGGCCAACAGCUCGGACGCGCCCUUCAUCCGGCCGGGACCCGGGACGCUGGAUGGCCGCUGGGUCAGCCUGCACCGGAGCCAGCAGGAGCGCAAGCGGGUGAUGCAGGAGGCCUGCGCCAAGUACCGGGCGAGCAGCAGCCGCCGGGCCGUCACGCCCCGCCACGUGUCCCGUAUCUUCGUGGAGGACCGCCACCGCGUGCUCUACUGCGAGGUGCCCAAGGCCGGCUGCUCCAAUUGGAAGCGGGUGCUCAUGGUGCUGGCCGGCCUGGCCUCGUCCACUGCCGACAUCCAGCACAACACCGUCCACUAUGGCAGCGCUCUCAAGCGCCUGGACACCUUCGACCGCCAGGGUAUCUUGCACCGUCUCAGCACCUACACCAAGAUGCUCUUUGUCCGCGAGCCCUUCGAGAGGCUGGUGUCCGCCUUCCGCGACAAGUUUGAGCACCCCAACAGCUACUAUCACCCGGUCUUCGGCAAGGCCAUCCUGGCCCGGUACCGCGCCAAUGCCUCUCGGGAGGCCCUGCGGACCGGCUCUGGGGUGCGUUUUCCCGAGUUCGUCCAGUACCUGCUGGACGUGCACCGGCCCGUGGGGAUGGACAUUCACUGGGACCAUGUCAGCCGGCUCUGCAGCCCCUGCCUCAUCGACUACGAUUUCGUAGGCAAGUUCGAGAGCAUGGAGGACGAUGCCAACUUCUUCCUGAGCCUCAUCCGCGCGCCGCGGAACCUGACCUUCCCCCGGUUCAAGGACCGGCACUCGCAGGAGGCGCGGACCACAGCGAGGAUCGCCCACCAGUACUUCGCCCAACUCUCGGCCCUGCAAAGGCAGCGCACCUACGACUUCUACUACAUGGAUUACCUGAUGUUCAACUAUUCCAAGCCCUUUGCAGAUCUGUACUGAGGGGCGCCGCAGCUGGCCGGGGCCGCCCUGCCCCGGUCACUCACCUGUGCUCCCGGGCAUCCUCCUGUCCCUGGCUCCUCAUCCUGGGAGCAACAGGGCUCUGAGGACGUGAGGAGCCAUCGCUGUGGGAGGCAGCAGGCCCCGGGUGGGGGGCAGAGGCGCCCAGCCUUGGAUGGGGACCCCAGCCCCUGGCCUGUACCUGUUUCCUCAUUCCUUGGCUGAGGGAGAGGCUGAGAACUGGGCAGACACCCCUGGAGCUCAGCCGACAGUUUUGAUGAGCAGGGAAGUCUGAGGCCCAGAGGACGGGGGGCCCAGCGGUAAGGGAUGUCCCGCACUCCCUUAGCCAUUGCCUUGGACCAAACCACGUGGUUUGCAGCUUUUCUACGAGCCAGGGGGGAGGUUCCCUUGGAUUAAGGUUCCAAAUAAAGCACAUGGUUUCCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1015.7 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1048.1

Frequency: 0.0000

Diversity: 689.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......(((((((((((((((((((((..((((....))))((.(((.((((((((((...(((((.(((((.(((((((((.((((((((((((.(((..((((.((((((...........))).))).))))....))).))))).))).)))).)))))((((((..((((((((((((.(((.(((((..(((((((((((((.(((.((((.(((....(((((.....)))))((((.....)))))))..)))).))).)))))).).))))))(((((((.(...((((.((.....)).))))))))))))...((((.(((((((((.((((((....(((((....((((...))))))))).....(((.(((..(((........)))...))).))).....((((........)))).((.((((((((((((.....(.(((.........)))))))))))....))))).)))))).))))))...)))))))))))))).)))......(((((((((((((.(((((..(((...(((((((((..((..((((((((................))))))))..))..))))....((((........)))).)))))...)))...))))))))))))(((..(........)..)))(((....((.(((((((.((((((.(.(((((.(..((((.......))))..)))))).))))))).).))))))))..)))))))))((((((..(((((((((((((..........((((((((.((....)).)))))))).(((((((((((((((((((..((((((.......)))..))).))))))))..((((((((........((......)).......))))))))....)).)))))).)))..))).))))))(((((..........))))).))))..))))))(.((((((...)))))).).......)))))))))))....)..))))))...)))))))))...))))).(((((((.((((((.((.((....)))).))))))...)))))))...(((((((((((.(((..((..(((....)))))))).)).)))))))))(((.((((((......(((((((((.......((((((.((((((((((.((((((((.(((((((((............(((((((((((....................))))))))))).)))))).).)).))).))))))))).((((.((.....)))))).......((((((((..(((.........(((.....)))...(((((...)))))((((.(((((.....(((((....)))))..)))))))))))).))))))))......(((.((.((((((((....)))))))).))..))).)))))))))))).......))))....)))))..((((((((..(((.(((((...((((....))))...)))))...)))..))))).))).)))))).)))..))))))))))))))).....)))))))).))))...((((((((((((((((((((.(((((.(((....))))).))).(((((((((((((.((((..((((((...(((........))).((((((((((((((......)).)).........((((.((..(((...)))..)).)))).).)))))))))....)))))).(((((((.(.((.((((((((((......))))))))))))...).))))))).)))))))))).......((((((((((((((.(((((......))))).))))..))))))))))..)))))))((((.((((((...(((((.((((((.(.((..((((........))))..)).).)))))).)))))..)))))).))))......((((((((((((..((......((((((((((..((((...(((((..(((.....))).)))))))))..))))...)))))).....((((.((((........))).).)))))).))))))))))))...)))))))))........(((((((.((.....)).))))))))))))))))))...(((((.......)))))...........))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

......(((((((((,{{(((((((((..((((,.,,|}||((.(((,{(((((((((.{.(({((,(((((,(((((((((.((((((((((((.(((..((((.(((((({{........}))).))).))))....))).))))).))).)))).)))))}|{||,..,||||||||{{(.(((..,...}}|{(({((((({{|,||{{(((({(({,{(.(((((,...,))))),|,|},.,,))))))){(((({(|((.({.{((,{,(({{{{((((,(({(...,,)}}})))..,({(,(((((((,,,,..}|}}}}},|||{((({(((((((,..(((((....((((...})))))))).,,,,(((.(((..(((........)))...))).}}}..,|,||||,,,..{{{|||||||,||||||}||}||.,,,,,.((({(((((((((......((((.....))))......|.(((((((.((..({..((........))..}}.)}.))))))),.))))))))),))})}}}||.||||,.||.}||||||||,,,,,,,,,,,,..,,))))))}),,}|..||||,{{|,|{{,|{||,|||||||..|(({,..,||}}..}}}}}||||,|{({,(((({.....,.|||,.....,||,||{|||{,(({(((|{.((((,,(..((((.......))))..)))))),)))}))).|||}||||||{,|||||,|||{||||{.,||({{(({(({((..........((((((((.((....)).)))))))).(((((((((((((((((((..((({{{.......,))..))).))))))))..((((((((....,...((.....,}}.......))))))))....)).)))))).}))..)))})))))){{{{{...,,..,,.))})).))))..)))))),.|}|{(({{{|||,}{|||||.||||||,|||}|||,{{{|{{||||||...||}}}})},.,}})})),(((((((,((((((.({{((....)))).)))))).,.)))))))...,|||||||||||((,..,||.{(({{{{|||||,}|{||{||,||||,|(({.,,{{||,..||}|,,,,||||}},....((((({.,,{{(((,(((((....})))},|(((((((...{,..{,.(((((((((((....{,......,.......)))))))))))..}}||||},({(|||.|}}|)))})}|||}|({.....)})}}.....,}}||}}}}.....))}.,..,}.}}|||}}}}.))}.}||||.}}}}|||}{{,,..})|))},..})}||}}))),)))}})))|}||}}||||,}||}}},....,,|||,||.((((((((....)))))))).))..}))}))))))))}}}}.......}}}}}...,)}}}.}|||((({{..{{{,(((((,{,{(((,,,,||,,..}))))}...}}).,))))).,)}.})))}}.})}..}}))})))}}}))}}...,,)))))))).)))}...((((((((((((((((((((.(((((.(((....))))).))).(((((((((((((.((((..((((((...(((........))).(((((((((({(((......)).}}.........((((.((..(((...)))..)).)))).)})))))))))....)))))).{((({((.(,((.((((((((((......)))))))))),,...).))))})),))))))))}}.......((((((((((((((.(((((......))))).))))..)))))))))).,)))))))((((.((((((...(((((.((((((.(.((..((((........))))..)).).)))))).)))))..)))))).))))......{(((((((((((.,{{......((((((((((..((((,..{((((..{{{.....))).)))))))))..)))),..))))))....,((((.((((........))).).)))))).)))))))))))}..,))))))))),,,,,...,|||||{.{(,,,..}}.}))))},))))))))))),..(((((.......))))}...........))))))))).