Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001349338.3
Sequence Length
7177 nt
GC Content
0.4314
GUACUCGCGGCGGCCCGGCCCUCGCCCGGGAGUGCGUGUGUGCGCGCGUGUGUGCGCGAGUGAGUGUGUGCGCGGGGUGCGCGCGCGGGCGGGAGUGGGCGCGCGCGGGGAAAGGCCCGAAAACACCUUAGUUUGCACCGAGAGACCAUUUGCAGCGGAACCCGAAAGUUUGUAAGAGGAAGAGAGCGCGCGGCGAGCGAGCGAGCGGGCCGGGGGCAGCGGCAGCGGCGCCGGGGACCAUGGUGCUGCCGGCGCCUCCUCCGCGGGCGUGAAGGCGGCGCUCCUACUCCCUCCCCGGACUCCGCGGUGUCCCAGAAGCUUUUGUUGACAAUUCCAGUUUCCGAACAAAACAUUUCGGCAAUGGUGAGGGCUUCGAUCCCUUCUCUGAUUUGCUGUCAGCCAUGAACGGAUGGAUGUGAUGCCUGCUAGCCAAAAGGCUUCCCUCUGUGUGUUGCAGUCCUGUGGCAUUAUGCAUGCCCCCUCCCAGUGACCCCAGGCUUUUUAUGGCUGUGAGACACGUUAAAAUUUCAGGGGUAAGACGUGACCUUUUGAGGUGACUAUAACUGAAGAUUGCUUUACAGAAGCCAAAAAAGGUUUUUGAGUCAUGAUGCAAGAAUCUGGGACUGAGACAAAAAGUAACGGUUCAGCCAUCCAGAAUGGGUCGGGCGGCAGCAACCACUUACUAGAGUGCGGCGGUCUUCGGGAGGGGCGGUCCAACGGAGAGACGCCGGCCGUGGACAUCGGGGCAGCUGACCUCGCCCACGCCCAGCAGCAGCAGCAACAGGCACUUCAGGUGGCAAGACAGCUCCUUCUUCAGCAGCAACAGCAGCAGCAAGUUAGUGGAUUAAAAUCUCCCAAGAGGAAUGACAAACAACCAGCUCUUCAGGUUCCCGUGUCAGUGGCUAUGAUGACACCUCAAGUUAUCACUCCCCAGCAAAUGCAGCAGAUCCUCCAGCAACAAGUGCUGAGCCCUCAGCAGCUCCAGGUUCUCCUCCAGCAGCAGCAGGCCCUCAUGCUUCAACAGCAGCAGCUUCAAGAGUUUUAUAAAAAACAACAGGAACAGUUGCAGCUUCAACUUUUACAACAACAACAUGCUGGAAAACAGCCUAAAGAGCAACAGCAGGUGGCUACCCAGCAGUUGGCUUUUCAGCAGCAGCUUUUACAGAUGCAGCAGUUACAGCAGCAGCACCUCCUGUCUUUGCAGCGCCAAGGCCUUCUGACAAUUCAGCCCGGGCAGCCUGCCCUUCCCCUUCAACCUCUUGCUCAAGGCAUGAUUCCAACAGAACUGCAGCAGCUCUGGAAAGAAGUGACAAGUGCUCAUACUGCAGAAGAAACCACAGGCAACAAUCACAGCAGUUUGGAUCUGACCACGACAUGUGUCUCCUCCUCUGCACCUUCCAAGACCUCCUUAAUAAUGAACCCACAUGCCUCUACCAAUGGACAGCUCUCAGUCCACACUCCCAAAAGGGAAAGUUUGUCCCAUGAGGAGCACCCCCAUAGCCAUCCUCUCUAUGGACAUGGUGUAUGCAAGUGGCCAGGCUGUGAAGCAGUGUGCGAAGAUUUCCAAUCAUUUCUAAAACAUCUCAACAGUGAGCAUGCGCUGGACGAUAGAAGUACAGCCCAAUGUAGAGUACAAAUGCAGGUUGUACAGCAGUUAGAGCUACAGCUUGCAAAAGACAAAGAACGCCUGCAAGCCAUGAUGACCCACCUGCAUGUGAAGUCUACAGAACCCAAAGCCGCCCCUCAGCCCUUGAAUCUGGUAUCAAGUGUCACUCUCUCCAAGUCCGCAUCGGAGGCUUCUCCACAGAGCUUACCUCAUACUCCAACGACCCCAACCGCCCCCCUGACUCCCGUCACCCAAGGCCCCUCUGUCAUCACAACCACCAGCAUGCACACGGUGGGACCCAUCCGCAGGCGGUACUCAGACAAAUACAACGUGCCCAUUUCGUCAGCAGAUAUUGCGCAGAACCAAGAAUUUUAUAAGAACGCAGAAGUUAGACCACCAUUUACAUAUGCAUCUUUAAUUAGGCAGGCCAUUCUCGAAUCUCCAGAAAAGCAGCUAACACUAAAUGAGAUCUAUAACUGGUUCACACGAAUGUUUGCUUACUUCCGACGCAACGCGGCCACGUGGAAGAAUGCAGUGCGUCAUAAUCUUAGUCUUCACAAGUGUUUUGUGCGAGUAGAAAACGUUAAAGGGGCAGUAUGGACAGUGGAUGAAGUAGAAUUCCAAAAACGAAGGCCACAAAAGAUCAGUGGUAACCCUUCCCUUAUUAAAAACAUGCAGAGCAGCCACGCCUACUGCACACCUCUCAAUGCAGCUUUACAGGCUUCAAUGGCUGAGAAUAGUAUACCUCUAUACACUACCGCUUCCAUGGGAAAUCCCACUCUGGGCAACUUAGCCAGCGCAAUACGGGAAGAGCUGAACGGGGCAAUGGAGCAUACCAACAGCAACGAGAGUGACAGCAGUCCAGGCAGAUCUCCUAUGCAAGCCGUGCAUCCUGUACACGUCAAAGAAGAGCCCCUCGAUCCAGAGGAAGCUGAAGGGCCCCUGUCCUUAGUGACAACAGCCAACCACAGUCCAGAUUUUGACCAUGACAGAGAUUACGAAGAUGAACCAGUAAACGAGGACAUGGAGUGACUAUCGGGGCGGGCCAACCCCGAGAAUGAAGAUUGGAAAAAGGAAAAAAAAAAAAACACGUCAAAAGUUAGCAGUGAAAUUGUUCUCCAUUUGUUGUACAGUCUGGAGGAUUUUCACUACGUUUUGACAACUCUGAAAUGUGUUAACUCUUAGUGCCAUCAAGAACCCCAUUUGGGAGUAUUUUUGAUUUUUCUACUUUUUGUUGAAAAAAGGAAUUUGUACUCUGUGCAUUGGAUGGACUUGUUUGGUACUUGGGAUUUUCCUCUCUUAACCGUCAACAUCAGUGUUGUAAAUUUGCUAAACUGAUUCACUUUUAGCAGCAGACUUUGAACUGCAGUCCUGCCAACGUUGGACACUGAGGACGCCCGACAGAGCUUGUGCACCUAAGCUGCAGACCAAGCCUUUGCCCAGAAUUUAAGGAUUCCAAUGGACGACCUAUUUGCACAGUACUGCAUGUUGAUUAUCACUGCCUUUACUCCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGCUUCCAGUUGGGAUGGGGAAGGCCUUUGUGUGUGUAUUGGGGGGAGGGGUUAAAAAAUAAUUAUCCCAAACUUUUUAAUGUAUUGCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUCCUUCUACUAUACCAUUUUAAGUUCUGACCUCAGGCCUCCAUUUGGGCCGAUGGCCUCUUGGAGGCUUAAAGUUUUCUGUACCUUGUGAUGAAUGUUAAUAGGUGUUUUUAUUAUACAAAGCUGAAUGUCAUUUCUCGUUUGUAGCUUUCUGUCACUCAUUCCAUCUUCCUUCAGACAUCACCACGUUUCUCUAAAGUCAGAAAACAUUCCGUUUUGGUCUUUUUCAAAAAGGUCCCAAAUGCUGCACUCUACACAUGAAGGCCCUCUCACACAGACGUGACGUCCUGCCAGAAAGAGAAUGAAUGACAGAAAAAAAAAAGAGAGACAAACUCUAGGAACAAUGCCGAUUCAUUCCACGCAGCAGUAUUGGGGGUGGUUCGGGGGAGGGGUGUUUCGGAUUUUCUUUUUUUCUUUUCUUUUCUUUUUUUUUUUUUGCAGCAACCAUUAAUAAAUGCCACCACAUUCUACCAGCACAAGGAAACAUAGGCAGCACUGAAAAAAAAAAAAAAGCUCAUAUUAAUUAGACUGACAAUAUGGCCUUGGAAGGCUCUCCCUUGUGGAACCAAGUUGCCAUGGGCCUUGGGUGCUCUGCGAUAACGGGUGUGGGUUGGUUUUGUUUGCAAAAUGGCCAAAAAAAAAAACCGGCUUCCCCGAGCAGCUGCCCUGAAAGUAGGGGUGGCGGCGGCGGCGCUGAGUUUAUACAUUAGUUCAGACCUACUUGGUGGCAUUAAACUGUUUGAAUGCAAAUUCGAUUUCAGAUUGAACUUGUUAAGGGAGUUAACGAGGGCUGAGUUCAGCAAAUGCUAAAGUGUUAAUUUCAAAUAUGCAAAUUUGGUACUGCAGUUUGUUAUGCAAUAUUAUAUCACCAACCCAGUAUCACAAAAACUCAUAGAAGAUAUCAUGUAGGCCCUGGGCUUUGGGGGGGUCCCAAACAUGGUAUGCAGAAAUGUGAUGGUUACAGGUCAGUACAACCUCAGUCCUUAGAACCCCUCCACACUUCAGCUCUGCACCCACUUUCCUGUCAUUUAUUUAUAUAGGACUGUAGUUUUUUUUAGUUCGAGAGCCUUUCGAAGCUUAAUUUAUAUUCUUUCUUUGUACCUUUUUUCUAAAAUUACCAAAGAUAUUACACAAAGGUAAAUUAUGUUCUCUGUUUUAUGCUUUAUCUGAUGAAGCCAAAUAUCCUCUUAUUGUUGAUCAAAGGAGGCAAAAGAAUUUAGAGGCAAAUGACAAGCGAUAGGCUAUUGCAACCUGAGAAAGAGAACUGCUCCUUCAUCGUAAAUUUAGAAGACCAAGUAGAUAAUGGAACCAAAGUUGUUACUUUUUUCUAGUAGUUAUUUUUCCUUUUUCUUUUUGUGUACCUCUACAGAGACCAAAACUCAUUCUCUUAAAGAGAUUUUAUGGGGCUACUGCAGAUAAAAAUAGGACACAAUAUUAAAGGAGCUACAGAAGGAAGGGAGUCCCAUCUCAAAAAAAAAAUGAAUGUAUGCCACUGCAAUUAGAGUAUCCAAUAAAGGAGACAGUUUAGAGUCAGGACAGAAAAGCUUCCAUAAUUGAACUAGAUUACAUAAUAGUAUUUCUAGAAAAAGAGAUAUUUUUAGAUUGUAUGCCACUUUUGUUUAAGAACUGUGCUGUGAUCACUGUAUUAAUUUUGGUUUAUCUUGGCAUAUAUCCUUCAGUUUGUUUUUAUUUUUAAUUUUUCCUUUUUUUCCGAUUAGGCUUUGGUCAGCAUUUUUCAUUUAAAGAAAA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1982.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2122.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 2301.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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