Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001394787.1
Sequence Length
592 nt
GC Content
0.6470
AGUGGCUGGGAGCAGAUGGCAGUGCAGUCUAAAGCCUUCUGUGCGGGCGGCCUGGCCCCCGGCUGGAAGCUGCUGGUCCAGGGACAUGCUGACUCUGGAGAGGACAGGUUCGAGACUAACUUCUUGUUGGAGACGGGGGACAUUGCCUUCCACAUCAAGCCCCGGUUCUCCAGCGCCACUGUGGUGGGCAAUGCCUUCCAGUACGGCCGCUGGGGCCCGGAGCAGGUGUCUAGCAUCUUCCCGCUGGCCCCGGGGGAGCCCUUUGAGAUAGAGGUCAGCUGGGACGCGGAGCACUUCCACGUCUACGCCCCGGAGCACAAGGUGCUACAGUUCCCAUGCCGUCAGAGGCCGCUGGGCGCCACCACCAGGGUGCGCGUGCUGAGUGACCACUGCCUGGCCCAGGUGGAGCUGGCCAAGAGGGGCCUGAGCUGGGGGGACCGGGGCUACUGAGUGACACCUGCACCCCAGGAGCCAGCCUCGGCUUGUCCCAUGUCCAGGGUACCUGGAGUCCCACCCUGGGGCAGCUGGGUGAGGGGGUCUGUGGUCCUGUGUGCUCCUCGCAGCUCCACCUUCAAUAAACUCUGAGAAGGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-276.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -284.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 114.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(.(((((.(((((((.(((.............))).)))))((((.((..((((((((((.((.(((.(((((..(((((((.((...)).)))))))..)).))).))).)).(((((.....)))))...)))))).((((((((.(((((....((.(.((....)).).))...))))).))))))))....))))..)).))))((((((((((.(.((((((...)))))).))))..)))))))(((((((((((((...))))))...))).(((((.(((.....))).)))))...))))(((((((((((.((((((((((((.(((((.(((.((.((((.(((((((((.....))))...))))).)))).)).))))(((.(((((((((((((((((......))))..))))((((.((((((((((.(((.(((.(....))))..))).....)))))))).)).))))...((((((...))))))...))).)))))).)))...)))).))))).)))))))))).)))))))))).))))).).(((((............)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{.(((((.(((((((.(((,,......,}...))).)))))((((.((..((((((((((.((.(((.(((((..(((((((.({...|}.)))))))..)).))).))).)).{{{{(.,,..}}})),,.)))))).((((((((.(((((....((.|.((....)).),}}...))))).))))))))....))))..)).)))){(((((((((.(.((((((...)))))).))))..))))))}((({{({(((((,...))))))...))).(((((.(((,...,))).))))).,.))))(((((((((((.((((((((((((.,(((..,,,.||,((((.(((((((((.....)))).,,))))).)))).||.|||,(((.((((((((({(((((((......))))..}))|((((.((((((((((.,{{.{{{.,.{{{{,,,..)))}.},,)))))))).)).)))),..((((((...))))))...)))}}})))).))),..)))}.))))).)))))))))).)))))))))).))))).}.(((((............)))))..
Back