Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001633.4
Sequence Length
1262 nt
GC Content
0.5658
AGUUCACAGCUGCCCUGUUGCAGGGAGGCGGUGGCCCUUCUGUUGCUAGACCGAGCCUGUGGGAUAUACCAAGGCAGAGGAGCCCAUAGCCAUGAGGAGCCUCGGGGCCCUGCUCUUGCUGCUGAGCGCCUGCCUGGCGGUGAGCGCUGGCCCUGUGCCAACGCCGCCCGACAACAUCCAAGUGCAGGAAAACUUCAAUAUCUCUCGGAUCUAUGGGAAGUGGUACAACCUGGCCAUCGGUUCCACCUGCCCCUGGCUGAAGAAGAUCAUGGACAGGAUGACAGUGAGCACGCUGGUGCUGGGAGAGGGCGCUACAGAGGCGGAGAUCAGCAUGACCAGCACUCGUUGGCGGAAAGGUGUCUGUGAGGAGACGUCUGGAGCUUAUGAGAAAACAGAUACUGAUGGGAAGUUUCUCUAUCACAAAUCCAAAUGGAACAUAACCAUGGAGUCCUAUGUGGUCCACACCAACUAUGAUGAGUAUGCCAUUUUCCUGACCAAGAAAUUCAGCCGCCAUCAUGGACCCACCAUUACUGCCAAGCUCUACGGGCGGGCGCCGCAGCUGAGGGAAACUCUCCUGCAGGACUUCAGAGUGGUUGCCCAGGGUGUGGGCAUCCCUGAGGACUCCAUCUUCACCAUGGCUGACCGAGGUGAAUGUGUCCCUGGGGAGCAGGAACCAGAGCCCAUCUUAAUCCCGAGAGUCCGGAGGGCUGUGCUACCCCAAGAAGAGGAAGGAUCAGGGGGUGGGCAACUGGUAACUGAAGUCACCAAGAAAGAAGAUUCCUGCCAGCUGGGCUACUCGGCCGGUCCCUGCAUGGGAAUGACCAGCAGGUAUUUCUAUAAUGGUACAUCCAUGGCCUGUGAGACUUUCCAGUACGGCGGCUGCAUGGGCAACGGUAACAACUUCGUCACAGAAAAGGAGUGUCUGCAGACCUGCCGAACUGUGGCGGCCUGCAAUCUCCCCAUAGUCCGGGGCCCCUGCCGAGCCUUCAUCCAGCUCUGGGCAUUUGAUGCUGUCAAGGGGAAGUGCGUCCUCUUCCCCUACGGGGGCUGCCAGGGCAACGGGAACAAGUUCUACUCAGAGAAGGAGUGCAGAGAGUACUGCGGUGUCCCUGGUGAUGGUGAUGAGGAGCUGCUGCGCUUCUCCAACUGACAACUGGCCGGUCUGCAAGUCAGAGGAUGGCCAGUGUCUGUCCCGGGGUCCUGUGGCAGGCAGCGCCAAGCAACCUGGGUCCAAAUAAAAACUAAAUUGUAAACUCCUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-486.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -509.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 333.1
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((((((.(((((((((((((((.(((((((((((((((.((((((.(((.((((......))..((((..((((((((.(((.((((((.((.((((((((((((((........)))))((((((((((((((.((((.......))))...)))))))............)).))))).................((((.((((((((((((((........)))))...)))).((((.((.(((((.....)).))).)).)))).........(((((....)))))((((((((.((((((((.(((((.(.((.((.......)).(((((.(((....((((((((......))))))))...))).)))))....(((((((((((((((....)).))))).....(((....))).......(((((....)))))((((....)))).((.((((((((.((((.((.(((((...........((((((((.(((((((...(((((((..((...))....(((.((((.(((.((((((.(((((.((((.((....(((((((((.(((((((((..(((....((.((((((.((((..(((..(((((.(((....))).)))))))).)))).))))))))....)))(.(((((.(((...((....))....)))))))).)...(((((..((..........))..)))))))))))))).)..))))))))....))..)).)).)))))..)))))))))..)))).)))...(((((.(((......))))))))........)))))))...))))))).(((.((.....)))))...)))))))))).))).)).))))...)).)))))).))......))))))))..))))))))...)))))))).)).....))))))))))))))))))))))....))))))))))...))).))))).)))..))))((((.((((((((((((((((.((.((..(((((((.((((((((...........)))))((((.......))))((((......)))))))))))))).....)).)).))))).....)))))))))))...)))).)).)))))))))))))..))))))..))))).))))).........))))))))))))))))(((.((....)).))).................))).)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((.{{,((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.((((((.(((.{(((......)),.{(((..((((((((.(((.((((((.({{((((((((({((((........))))}((((((((({((((.(((,{(({...,,))}}.))))))).,.......}}.}).))))).................((((.(((((((,,{((((.,,....,}}}}}.,,||}|.((((,({.(((((.....)).))).)).)))).,}.,..,.(((((....)))))((((((((.((((((((.(((((.(.((.(((.({,..{{((((.({,{(......}},((((((({(((..({(((..(((((((.,......{{{,,((((((((....}},)})))}....{((,.,{{{.......|||||||{{,,,,,|(({{....}}}},||.|||||,|}}}|||,}||||{{.....,}.....((((((((.,((((((...(((((((,,{,..,|,....(((.((((.(((.((((((.((((,.{{{|,||{,,{(((((({{..((((((((({.,,,.}}}||,((((({.((((..(({.{(((((.(((....))).)))))))).)))).})))))}|,,..|||(,{((((,(({...{({.,.,|.,,,}},))))).}.,,,((((..{{..........))..)))))))))}}))),)..)))}}}}},}},,,..,)))).})))),,)))))))))..)))).))),,.(((((.(((......)))))))).,......}))))))...))))))}.{{(.{{|...})))))...)))))))))))))))..)))..})..)))).))))))}.}}.)))))))))).))))))))...)))))))).)))....))))))))))))))))))))))....))))))))))...))).))))).)))..)))|((((.((((((((((((((((.{((((..,,})}|,,((((((((,.{,{{,.....||||((((.......))))(({{......))})}})).))))))),..}}.,,.))))).....)))))))))))...)))),,}.)))))))))))))..))))))..))))).)))))..,,...,.))))))))))))))))|{{.||,...}}|||,................,))).,}},.......
Back