Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001648.2
Sequence Length
1464 nt
GC Content
0.5485
AGCCCCAAGCUUACCACCUGCACCCGGAGAGCUGUGUCACCAUGUGGGUCCCGGUUGUCUUCCUCACCCUGUCCGUGACGUGGAUUGGUGCUGCACCCCUCAUCCUGUCUCGGAUUGUGGGAGGCUGGGAGUGCGAGAAGCAUUCCCAACCCUGGCAGGUGCUUGUGGCCUCUCGUGGCAGGGCAGUCUGCGGCGGUGUUCUGGUGCACCCCCAGUGGGUCCUCACAGCUGCCCACUGCAUCAGGAACAAAAGCGUGAUCUUGCUGGGUCGGCACAGCCUGUUUCAUCCUGAAGACACAGGCCAGGUAUUUCAGGUCAGCCACAGCUUCCCACACCCGCUCUACGAUAUGAGCCUCCUGAAGAAUCGAUUCCUCAGGCCAGGUGAUGACUCCAGCCACGACCUCAUGCUGCUCCGCCUGUCAGAGCCUGCCGAGCUCACGGAUGCUGUGAAGGUCAUGGACCUGCCCACCCAGGAGCCAGCACUGGGGACCACCUGCUACGCCUCAGGCUGGGGCAGCAUUGAACCAGAGGAGUUCUUGACCCCAAAGAAACUUCAGUGUGUGGACCUCCAUGUUAUUUCCAAUGACGUGUGUGCGCAAGUUCACCCUCAGAAGGUGACCAAGUUCAUGCUGUGUGCUGGACGCUGGACAGGGGGCAAAAGCACCUGCUCGGGUGAUUCUGGGGGCCCACUUGUCUGUAAUGGUGUGCUUCAAGGUAUCACGUCAUGGGGCAGUGAACCAUGUGCCCUGCCCGAAAGGCCUUCCCUGUACACCAAGGUGGUGCAUUACCGGAAGUGGAUCAAGGACACCAUCGUGGCCAACCCCUGAGCACCCCUAUCAACCCCCUAUUGUAGUAAACUUGGAACCUUGGAAAUGACCAGGCCAAGACUCAAGCCUCCCCAGUUCUACUGACCUUUGUCCUUAGGUGUGAGGUCCAGGGUUGCUAGGAAAAGAAAUCAGCAGACACAGGUGUAGACCAGAGUGUUUCUUAAAUGGUGUAAUUUUGUCCUCUCUGUGUCCUGGGGAAUACUGGCCAUGCCUGGAGACAUAUCACUCAAUUUCUCUGAGGACACAGAUAGGAUGGGGUGUCUGUGUUAUUUGUGGGGUACAGAGAUGAAAGAGGGGUGGGAUCCACACUGAGAGAGUGGAGAGUGACAUGUGCUGGACACUGUCCAUGAAGCACUGAGCAGAAGCUGGAGGCACAACGCACCAGACACUCACAGCAAGGAUGGAGCUGAAAACAUAACCCACUCUGUCCUGGAGGCACUGGGAAGCCUAGAGAAGGCUGUGAGCCAAGGAGGGAGGGUCUUCCUUUGGCAUGGGAUGGGGAUGAAGUAAGGAGAGGGACUGGACCCCCUGGAAGCUGAUUCACUAUGGGGGGAGGUGUAUUGAAGUCCUCCAGACAACCCUCAGAUUUGAUGAUUUCCUAGUAGAACUCACAGAAAUAAAGAGCUGUUAUACUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-543 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -573.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 262.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((..(((((.(.(((.(..((.((.(((((((.(.((((((.((((.(.(((((((((((((((.....(((..((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.....)))))))))((((.(((((((((((.((.(((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((......((((((..........))))))))))))).)))))..(((((((((..(((((((((.(((.((((((.((........)).))))))...........((..(((....)))..))......((((........))))..(((((.(((....))).)))))....))).)))).)))))...))..)))))))...))))).).))))..)))))..)).))))......(((.(((((...)))))...)))((((...(((((((......(((((((........)))).))).(((((((.((((((..(((((((((.......))).))))))..))((((.((...(((((((((...))))))))).)).)))).(.(((((.......))))).)..))))))))))))))))))...))))..))))).)).))))))))))).))))......(((((...((......))..((((((((...(((((....((....(((((((((...))).))))))...))....)))))....))))))))(((.(((((.(((..((...(((.(((..((.....)).)))))).))..))))))))))).....)))))..(((.(((...(((((...(((((......)))))))))))))))))))))))))))))....((((((.(.(((((....))))).).)))))).........(.((((..((((((((.....((.(((((((.....)))...)))).))..((((((((.((((((((((((((((....(((...)))..(((........)))...)))))).)))))))))).))))))))))))))))...)))).).))).)))).)))....)))))))).).(((((.((...)).)))))..((..((.(((((((((...))))....))))))).))....(((...))).....))))))).)))(((((((.(((((((((.((...........)))))))))))..((((........)))).......)))))))(((((((((((....)))))).)))))...)))))))).))).....)))).).))))))))))).)))....)))).)))).).)))).))))).......(((.....)))..........((((.(((.(((......))).)))))))......)))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{,,,.{{{{{.,({{{{.{.{{{,|.,||,{(.(((((((.(.(((((({((((.({(((((((((((((((.....(((..((((((({.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.....)))))))),((((.(((((((((((.{(,(((((,(((((,,(((({(((((((((({((((((((((,.....{((((((.,.....,..))))))))))))))))})}..(((((((((.,(((((((({.(((.((((((.((........)).))))))..{{,......((..(((....))).,)}..,,}.((((........)))),,(((((.(({....})).)))))..,,))).}))).))))).}.))..)))))))...))))).).)))).,))))),.}|{||||{...))}}},{((((...))))),,,},,((((...(((((((.{{{..,,,|||{,,..{{{.|,)),))).((((((,{((((((..(((((((((.......)))}}}))))..))((((.((...(((((((((...))))))))).)).)))).{.(((((.......))))).,..))))))))))))))))))...))))..})))),)}.))))))))))).))))......(((((...{{......,,..((((((((...(((((....{(...,(((((({{{...}},.))))))}..))....)))))....))))))))(((.(((((.(({..((...(((.(({.,{......}).)))))).}}}}})))))))))).....)))))..,{(.(((...(((((..,(((((......))))))))))))))})))))))))))))},,.,((((((.(.(((((....))))).).))))))}.|}},...,.{{{{..((((((((.,,..((.(((((((.....))}...)))).)),,{(((((((.((((((((((((((((..,.(((...))).}(((........)))...)))))).)))))))))).)))))))})))))))).,.}}}}.}.))).)))).)))},..,))))))).}.(({{(,((....,,)))}}.,{{..{{.(((((((((...))))}...,))))|,{((....))).,.,}}.,...))))))).)))(((((((.(((((((((.((...........)))))))))))..((((........)))).......)))))))(((((((((({....})))))))))))...)))))))).))}.....))))},.))))))))))}.)))....)))).)))}.),)))|,|||}}....,,,{{|,|||,{{{....,,..,.||||.{||,|||......}}}.}|||||,,,,...},}.)))}...,,,..
Back