Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002272.4

Sequence Length

2141 nt

GC Content

0.5525

ACUCACCGGCCUGGGCCCUGUCACUUCUCUGAUAGCUCCCAGCUCGCUCUCUGCAGCCAUGAUUGCCAGACAGCAGUGUGUCCGAGGCGGGCCCCGGGGCUUCAGCUGUGGCUCGGCCAUUGUAGGCGGUGGCAAGAGAGGUGCCUUCAGCUCAGUCUCCAUGUCUGGAGGUGCUGGCCGAUGCUCUUCUGGGGGAUUUGGCAGCAGAAGCCUCUACAACCUCAGGGGGAACAAAAGCAUCUCCAUGAGUGUGGCUGGGUCACGACAAGGUGCCUGCUUUGGGGGUGCUGGAGGCUUUGGCACUGGUGGCUUUGGUGGUGGAUUUGGGGGCUCCUUCAGUGGUAAGGGUGGCCCUGGCUUCCCCGUCUGCCCCGCUGGGGGAAUUCAGGAGGUCACCAUCAACCAGAGCUUGCUCACCCCCCUCCACGUGGAGAUUGACCCUGAGAUCCAGAAAGUCCGGACGGAAGAGCGCGAACAGAUCAAGCUCCUCAACAACAAGUUUGCCUCCUUCAUCGACAAGGUGCAGUUCUUAGAGCAACAGAAUAAGGUCCUGGAGACCAAAUGGAACCUGCUCCAGCAGCAGACGACCACCACCUCCAGCAAAAACCUUGAGCCCCUCUUUGAGACCUACCUCAGUGUCCUGAGGAAGCAGCUAGAUACCUUGGGCAAUGACAAAGGGCGCCUGCAGUCUGAGCUGAAGACCAUGCAGGACAGCGUGGAGGACUUCAAGACUAAGUAUGAAGAGGAGAUCAACAAACGCACAGCAGCCGAGAAUGACUUUGUGGUCCUAAAGAAGGACGUGGAUGCUGCCUACCUGAACAAGGUGGAGUUGGAGGCCAAGGUGGACAGUCUUAAUGACGAGAUCAACUUCCUGAAGGUCCUCUAUGAUGCGGAGCUGUCCCAGAUGCAGACCCAUGUCAGCGACACGUCCGUGGUCCUUUCCAUGGACAACAACCGCAACCUGGACCUGGACAGCAUUAUUGCCGAGGUCCGUGCCCAGUACGAGGAGAUUGCCCAGAGGAGCAAGGCUGAGGCUGAAGCCCUGUACCAGACCAAGGUCCAGCAGCUCCAGAUCUCGGUUGACCAACAUGGUGACAACCUGAAGAACACCAAGAGUGAAAUUGCAGAGCUCAACAGGAUGAUCCAGAGGCUGCGGGCAGAGAUCGAGAACAUCAAGAAGCAGUGCCAGACUCUUCAGGUAUCCGUGGCUGAUGCAGAGCAGCGAGGUGAGAAUGCCCUUAAAGAUGCCCACAGCAAGCGCGUAGAGCUGGAGGCUGCCCUGCAGCAGGCCAAGGAGGAGCUGGCACGAAUGCUGCGUGAGUACCAGGAGCUCAUGAGUGUGAAGCUGGCCUUGGACAUCGAGAUCGCCACCUACCGCAAACUGCUGGAGGGCGAGGAGUACAGAAUGUCUGGAGAAUGCCAGAGUGCCGUGAGCAUCUCUGUGGUCAGCGGUAGCACCAGCACUGGAGGCAUCAGCGGAGGAUUAGGAAGUGGCUCCGGGUUUGGCCUGAGUAGUGGCUUUGGCUCCGGCUCUGGAAGUGGCUUUGGGUUUGGUGGCAGUGUCUCUGGCAGUUCCAGCAGCAAGAUCAUCUCUACCACCACCCUGAACAAGAGACGAUAGAGGAGACGAGGUCCCUGCAGCUCACUGUGUCCAGCUGGGCCCAGCACUGGUGUCUCUGUGCUUCCUUCACUUCACCUCCAUCCUCUGUCUCUGGGGCUCAUCUUACUAGUAUCCCCUCCACUAUCCCAUGGGCUCUCUCUGCCCCAGGAUGAUCUUCUGUGCUGGGACAGGGACUCUGCCUCUUGGAGUUUGGUAGCUACUUCUUGAUUUGGGCCUGGUGACCCACCUGGAAUGGGAAGGAUGUCAGCUGACCUCUCACCUCCCAUGGACAGAGAAGAAAAUGACCAGGAGUGUCAUCUCCAGAAUUAUUGGGGUCACAUAUGUCCCUUCCCAGUCCAAUGCCAUCUCCCACUAGAUCCUGUAUUAUCCAUCUACAUCAGAACCAAACUACUUCUCCAACACCCGGCAGCACUUGGCCCUGCAAGCUUAGGAUGAGAACCACUUAGUGUCCCAUUCUACUCCUCUCAUUCCCUCUUAUCCAUCUGCAGGUGAAUCUUCAAUAAAAUGCUUUUGUCAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-791.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -828.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 493.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((.(((((((((..(((((....((((.((((((..((((((.(((.(..((....(((((......)))))))..).)))))))))...))))))))))..)))))..))))....)))))(((((.(((((.((((.((((((....(((.((((((((((((.((((((((..((((((((((((.((((((((.......))).(((((..((((.(((((.........))))).)))))))))(((((.(((((((.((.(.((((...(((((((..(.(((((((((...(((((((((((((((.(((..(.((((((((((........)))).)))))).)..))))))))..((((....)))).......))))))))))....))))))))).).)))))))((((....)))).......(((.....)))...(((..((.(((.(((.((((((......................))))))))).))).)))))..((.((((((((....(((...........((.((((((((....((((..((.((..(((..((((..(((((.((((((((.......((((.(.((((((((((.(((.((.(..(((((((.((...(((((((((..(..(.((..(.....)..)).)..)..)))).)))))....))...)))))))..).))))).))).............))))))).).))))....((((.((((........)).)).))))(((((.....)))))((((...))))((((((.....)))))).))))))))....)))))...))))...)).)..)).))..))))....))).))))).))))))))))))).))....)))).))).)))).(((....((((((((......))))))))......))).....((((((.(...(((....)))).)))))))))))))).......))))).)))))))))))).((((........))))(((...))).....)).)))))).)))))).....((....)).)))))).)))...))))))..))))..((((((..((((((.(((.....(((...))).(((((((((((..((((...((...(((((((((.(((((((((((((...(((((((.(.((((........)))).).).))...)))).........(((((.(((..((...(((((((((((.(.(((((((..(((((((((..(((((((...(.(((.((.(((((((.((((..(((...(.((((...(((((((..(((((((....(((((..(((..(((...))))))..)))))........).))))))(((((.(((((........)).))))))))..)))))))....)))))))).))))..)).))).)).)).))).)....)))))))...))))))))).)))).)))...).)))))))))))...)).))).)))))..((.(((((.((((((....(((((((((..((((((((((...........((.....))(((.(((((((((...(((((.......((((((((....))).)))))..(((((.((....)).)))))...........)))))..))))))))))))((((.....((....))...)))).............((((.......))))..))))))))))...))))))))))))))).))))).)).))))))))))).)).)))))))))((((..((((((.......((((.((((((((((((..(.(((((((..........(((.((..........)).)))((((......)))).........))))))))..)))).)))))))).))))((((.((((......))))...))))..........))))))..)))).))...)))).....))).))))).)))))).))))))...(((((((.((..(((...))))).)))))))......)))))).)))))..)))))....)))))...........(((((....).))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

...((((,{((((((((..(((((....((((.((((((..((((((.(((.(,,{,,,,.{((((......)))))})),}.)))))))))...))))))))))..)))))..))))....))))))))|(((((((.((((.((((((....(((.((((((((((((.((((((((..((((((((((((.((((((((,{{,...}}}{{(((...(((({(({,{........,|||||,||}},|}|(({(((.((({,{{.{|}|,||||}..(((((((..(.(((((((((...(((((((((({{(((.(((..(.((((((((((........)))).)))))).)..)))))),||.((((....))))....,,.))))))))))....))))))))).).))))))){{{{.,,,)))),,,..}}|||}}...||},,,{||,,{,,{({.({(,((({,,...,....,|{,{{..,..,.,||||||}||{|||,|||.{,{(({(((({((({{{{(,,......,{{(((,{(((((.,,...,((...(((((.....})))}....|||,,.,||||||,....}}}|||,.,.,,{|||||||,,{{.(({({,{{{{|||}||..,|||||,{,{.|{||{,{{..{.....},,||,||{|{,||||..}}}}.,,,)}.}})))),},,})}))))),}}},.,,,,,..,,.,)},)))),).)),,....|||.|{{{{.|||.....},))}),))(((((.....)))))}}}},)))))}|(((((.....)))))}.}}||||||{{.{||,||...((({{...,..}}))}...}),))}...)),)))))),||||}||,}||||.,,....)))).})).)))),(((....((((((((......))))))))......))).....((((((.(.,.({{....)))).))))))||||}},)),,..,,))))).)))))))))))).((((..,,,...}))){{{...}}}.....)).)))))).)))))),....((....}}.,))))).)))...))))))..)))),,(({,{,..{((((({(({...,{((,....||{({{((((((((..({({..,((,..{((((((((.(((((((((((((...(((((((.(.((((.,......)))).},).},..,)))).........(((((.(((..((...(((((((((((.(.(((((((..(((((((((..(((((((...{.{((.((.(((((((.((((..(({..{(.((((...(((((((,,(((((((....(((((..(({,,(({...})),)).,)))))........),})))))|{{{..,{|(({,,,{{..}}.)))}))))}.)))))))....)))))))).))))..)).))},)).)).))}.}....)))))))...))))))))).)))).)))...).)))))))))))...)).))).)))))..((.(((((.((((((,...{((((((((..((((((((({,..........,|.....||(((.(((((((((...(((((....,..((((((((....))).)))))..(((((.({.....).)))))...........)))))..))))))))))))((((.....{{....})...)))).............((((.......)))).,)))))))))}...))))))))))))))).))))).)}.))))))))))).)).))))))))}((((..((((((.......{(((.((((((((((((..{.((((((({{.{(,,....))...)}},.....,{{{{{.{{{|.,,,,,}}||,,.....,})))))))}..))))})))))))).)))|((((.((((......))))...))))..........))))))..)))).,,...)))).....))),})))).})))),,)))}})},,|{((((({((.......,|||,,.)))}}}}....}})}}}}},}}}},..,}.}},},})}}},.},,,..........)))))))},....