Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002371.4
Sequence Length
1084 nt
GC Content
0.5563
ACUGGGCUCCGCGGAGCCAGCGAGAGGUCUGCGCGGAGUCUGAGCGGCGCUCGUCCCGUCCCAAGGCCGACGCCAGCACGCCGUCAUGGCCCCCGCAGCGGCGACGGGGGGCAGCACCCUGCCCAGUGGCUUCUCGGUCUUCACCACCUUGCCCGACUUGCUCUUCAUCUUUGAGUUUAUCUUCGGGGGCCUGGUGUGGAUCCUGGUGGCCUCCUCCCUGGUGCCCUGGCCCCUGGUCCAGGGCUGGGUGAUGUUCGUGUCUGUGUUCUGCUUCGUGGCCACCACCACCUUGAUCAUCCUGUACAUAAUUGGAGCCCACGGUGGAGAGACUUCCUGGGUCACCUUGGACGCAGCCUACCACUGCACCGCUGCCCUCUUUUACCUCAGCGCCUCAGUCCUGGAGGCCCUGGCCACCAUCACGAUGCAAGACGGCUUCACCUACAGGCACUACCAUGAAAACAUUGCUGCCGUGGUGUUCUCCUACAUAGCCACUCUGCUCUACGUGGUCCAUGCGGUGUUCUCUUUAAUCAGAUGGAAGUCUUCAUAAAGCCGCAGUAGAACUUGAGCUGAAAACCCAGAUGGUGUUAACUGGCCGCCCCACUUUCCGGCAUAACUUUUUAGAAAACAGAAAUGCCCUUGAUGGUGGAAAAAAGAAAACAACCACCCCCCCACUGCCCAAAAAAAAAAGCCCUGCCCUGUUGCUCGUGGGUGCUGUGUUUACUCUCCCGUGUGCCUUCGCGUCCGGGUUGGGAGCUUGCUGUGUCUAACCUCCAACUGCUGUGCUGUCUGCUAGGGUCACCUCCUGUUUGUGAAAGGGGACCUUCUUGUUCGGGGGUGGGAAGUGGCGACCGUGACCUGAGAAGGAAAGAAAGAUCCUCUGCUGACCCCUGGAGCAGCUCUCGAGAACUACCUGUUGGUAUUGUCCACAAGCUCUCCCGAGCGCCCCAUCUUGUGCCAUGUUUUAAGUCUUCAUGGAUGUUCUGCAUGUCAUGGGGACUAAAACUCACCCAACAGAUCUUUCCAGAGGUCCAUGGUGGAAGACGAUAACCCUGUGAAAUACUUUAUAAAAUGUCUUAAUGUUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-372 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -389.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 211.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((((.((((.......)).)).))))))))))((((((((((((......(((((..(((((((..((((((...((((((.(((((...(((((((((((((((....)))))(((.(((((...(((((.(((((...(.(((((...((((.........))))......))))).)..))))).)))))..(((((((.((.....)).(((((((((...)).)))))))(((((....((((..((...((((((((..(((((.....(((((.((....(((...........)))...)).))))).(((((((((.(((.((((.((((((((((.............)))))...........((((.(((((.......))))).)))).......((((..(((.((.((((.((((.((.((((...(.(((....))).).))))))))))...........))))..)))))....)))))))))...))))..)))...........)))))))))......)))))))))))))..))..)))).)))))...(((....))))))))))(((((.((.(((((..((.(((...))).))..)))))...)).))))).......................................)))))))))))))))))).))))).))))))...........))))))....)))).))).)))))(((..((.((............)).))...)))(((.((.((((((..(((((.........))))).(((((((((((((..((.(....).))..))).)))..))))))).......))))))..)).)))....((((.((((...((.((.((((....)))))).))....))))))))))))))))...((((.((((((((((((.((((((((((((((...)))).))))))))))))))))..........((((((....)))))).)))))).)))).((((....((((((....))))))...)))).....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{(((((((((.((((.......)).)).)))))))))|((((((((((((......{{{,{{.(((((((..((((((.,.((((((.(((((...(((((((((((((((....)))))(((.(((((...(((((.(((((...,.(((((...((((.........))))......))))).}..))))).)))))..(((((((.((.....)).(((((((((...)).)))))))(((((....{(((..({...((((((((..(((((.....(((((.((..,.(((.,,.....,..))),..)).))))).(((((((((,({({(,{{.,{|||{||{,........||,,{||||,...........,(((.(((((.......))))).)))}..,,.,,{{{(,.(({{((.((((.{{{{.{{.((((.,,{.(((....}}}.}.)))))))))),..........))))..)))))....}))))),}}.},)))),,|{{,......}}}.)))))))))......)))))))))))))..))}}})),.)))))...(((....))))))))))(((((.((.(((((..((,((,...,}}.))..)))))...)).))))).......................................)))))))))))))))))).))))).))))))...........))))))....))))}})).}}|||((({{(.{(,{........,,,||.|,.{.{({(,({,(.{(((((,.(((((.........))))).(((((((({((((,,((.(....,.})..))},))}..))))))).......|,,,,)}},,})))}}.,)|}))))}....{{.{{.{{{{.,..))}}}}.})}})))))))}),))))))))...((((.((((({(((((,{((((((((((((((...)))).)))))))))))))))}..........((((((....)))))),)))))).)))|.({{{....((((({....})))))...)))).....)))),.
Back