Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002474.3
Sequence Length
6880 nt
GC Content
0.5519
GAGAUUUGGACGCUCCGGCCUGGGAGGUGCGUCAGAUCCGAGCUCGCCAUCCAGUUUCCUCUCCACUAGUCCCCCCAGUUGGAGAUCUGGGACCAACAAGGCACCAUGGCGCAGAAGGGCCAACUCAGUGACGAUGAGAAGUUCCUCUUUGUGGACAAAAACUUCAUCAACAGCCCAGUGGCCCAGGCUGACUGGGCCGCCAAGAGACUCGUCUGGGUCCCCUCGGAGAAGCAGGGCUUCGAGGCAGCCAGCAUUAAGGAGGAGAAGGGGGAUGAGGUGGUUGUGGAGCUGGUGGAGAAUGGCAAGAAGGUCACGGUUGGGAAAGAUGACAUCCAGAAGAUGAACCCACCCAAGUUCUCCAAGGUGGAGGACAUGGCGGAGCUGACGUGCCUCAACGAAGCCUCCGUGCUACACAACCUGAGGGAGCGGUACUUCUCAGGGCUAAUAUAUACGUACUCUGGCCUCUUCUGCGUGGUGGUCAACCCCUAUAAACACCUGCCCAUCUACUCGGAGAAGAUCGUCGACAUGUACAAGGGCAAGAAGAGGCACGAGAUGCCGCCUCACAUCUACGCCAUCGCAGACACGGCCUACCGGAGCAUGCUUCAAGAUCGGGAGGACCAGUCCAUUCUAUGCACAGGCGAGUCUGGAGCCGGGAAAACCGAAAACACCAAGAAGGUCAUUCAGUACCUGGCCGUGGUGGCCUCCUCCCACAAGGGCAAGAAAGACACAAGUAUCACGGGAGAGCUGGAAAAGCAGCUUCUACAAGCAAACCCGAUUCUGGAGGCUUUCGGCAACGCCAAAACAGUGAAGAACGACAACUCCUCACGAUUCGGCAAAUUCAUCCGCAUCAACUUCGACGUCACGGGUUACAUCGUGGGAGCCAACAUUGAGACCUAUCUGCUAGAAAAAUCACGGGCAAUUCGCCAAGCCAGAGACGAGAGGACAUUCCACAUCUUUUACUACAUGAUUGCUGGAGCCAAGGAGAAGAUGAGAAGUGACUUGCUUUUGGAGGGCUUCAACAACUACACCUUCCUCUCCAAUGGCUUUGUGCCCAUCCCAGCAGCCCAGGAUGAUGAGAUGUUCCAGGAAACCGUGGAGGCCAUGGCAAUCAUGGGUUUCAGCGAGGAGGAGCAGCUAUCCAUAUUGAAGGUGGUAUCAUCGGUCCUGCAGCUUGGAAAUAUCGUCUUCAAGAAGGAAAGAAACACAGACCAGGCGUCCAUGCCAGAUAACACAGCUGCUCAGAAAGUUUGCCACCUCAUGGGAAUUAAUGUGACAGAUUUCACCAGAUCCAUCCUCACUCCUCGUAUCAAGGUUGGGCGAGAUGUGGUACAGAAAGCUCAGACAAAAGAACAGGCUGACUUUGCUGUAGAGGCUUUGGCCAAGGCAACAUAUGAGCGCCUUUUCCGCUGGAUACUCACCCGCGUGAACAAAGCCCUGGACAAGACCCAUCGGCAAGGGGCUUCCUUCCUGGGGAUCCUGGAUAUAGCUGGAUUUGAGAUCUUUGAGGUGAACUCCUUCGAGCAGCUGUGCAUCAACUACACCAACGAGAAGCUGCAGCAGCUCUUCAACCACACCAUGUUCAUCCUGGAGCAGGAGGAGUACCAGCGCGAGGGCAUCGAGUGGAACUUCAUCGACUUUGGGCUGGACCUACAGCCCUGCAUCGAGCUCAUCGAGCGACCGAACAACCCUCCAGGUGUGCUGGCCCUGCUGGACGAGGAAUGCUGGUUCCCCAAAGCCACGGACAAGUCUUUCGUGGAGAAGCUGUGCACGGAGCAGGGCAGCCACCCCAAGUUCCAGAAGCCCAAGCAGCUCAAGGACAAGACUGAGUUCUCCAUCAUCCAUUAUGCUGGGAAGGUGGACUAUAAUGCGAGUGCCUGGCUGACCAAGAAUAUGGACCCGCUGAAUGACAACGUGACUUCCCUGCUCAAUGCCUCCUCCGACAAGUUUGUGGCCGACCUGUGGAAGGACGUGGACCGCAUCGUGGGCCUGGACCAGAUGGCCAAGAUGACGGAGAGCUCGCUGCCCAGCGCCUCCAAGACCAAGAAGGGCAUGUUCCGCACAGUGGGGCAGCUGUACAAGGAGCAGCUGGGCAAGCUGAUGACCACGCUACGCAACACCACGCCCAACUUCGUGCGCUGCAUCAUCCCCAACCACGAGAAGAGGUCCGGCAAGCUGGAUGCGUUCCUGGUGCUGGAGCAGCUGCGGUGCAAUGGGGUGCUGGAAGGCAUUCGCAUCUGCCGGCAGGGCUUCCCCAACCGGAUCGUCUUCCAGGAGUUCCGCCAACGCUACGAGAUCCUGGCGGCGAAUGCCAUCCCCAAAGGCUUCAUGGACGGGAAGCAGGCCUGCAUUCUCAUGAUCAAAGCCCUGGAACUUGACCCCAACUUAUACAGGAUAGGGCAGAGCAAAAUCUUCUUCCGAACUGGCGUCCUGGCCCACCUAGAGGAGGAGCGAGAUUUGAAGAUCACCGAUGUCAUCAUGGCCUUCCAGGCGAUGUGUCGUGGCUACUUGGCCAGAAAGGCUUUUGCCAAGAGGCAGCAGCAGCUGACCGCCAUGAAGGUGAUUCAGAGGAACUGCGCCGCCUACCUCAAGCUGCGGAACUGGCAGUGGUGGAGGCUUUUCACCAAAGUGAAGCCACUGCUGCAGGUGACACGGCAGGAGGAGGAGAUGCAGGCCAAGGAGGAUGAACUGCAGAAGACCAAGGAGCGGCAGCAGAAGGCAGAGAAUGAGCUUAAGGAGCUGGAACAGAAGCACUCGCAGCUGACCGAGGAGAAGAACCUGCUACAGGAACAGCUGCAGGCAGAGACAGAGCUGUAUGCAGAGGCUGAGGAGAUGCGGGUGCGGCUGGCGGCCAAGAAGCAGGAGCUGGAGGAGAUACUGCAUGAGAUGGAGGCCCGCCUGGAGGAGGAGGAAGACAGGGGCCAGCAGCUACAGGCUGAAAGGAAGAAGAUGGCCCAGCAGAUGCUGGACCUUGAAGAACAGCUGGAGGAGGAGGAAGCUGCCAGGCAGAAGCUGCAACUUGAGAAGGUCACGGCUGAGGCCAAGAUCAAGAAACUGGAGGAUGAGAUCCUGGUCAUGGAUGAUCAGAACAAUAAACUAUCAAAAGAACGAAAACUCCUUGAGGAGAGGAUUAGUGACUUAACGACAAAUCUUGCAGAAGAGGAAGAAAAGGCCAAGAAUCUUACCAAGCUGAAAAACAAGCAUGAAUCUAUGAUUUCAGAACUGGAAGUGCGGCUAAAGAAGGAAGAGAAGAGCCGACAGGAGCUGGAGAAGCUGAAACGGAAGCUGGAGGGUGAUGCCAGCGACUUCCACGAGCAGAUCGCUGACCUCCAGGCGCAGAUCGCAGAGCUCAAGAUGCAGCUGGCCAAGAAGGAGGAGGAGCUGCAGGCGGCCCUGGCCAGGCUUGACGAUGAAAUCGCUCAGAAGAACAAUGCCCUGAAGAAGAUCCGGGAGCUGGAGGGCCACAUCUCAGACCUCCAGGAGGACCUGGACUCAGAGCGGGCCGCCAGGAACAAGGCUGAAAAGCAGAAGCGAGACCUCGGCGAGGAGCUGGAGGCCCUAAAGACAGAGCUGGAAGACACACUGGACAGCACAGCCACUCAGCAGGAGCUCAGGGCCAAGAGGGAGCAGGAGGUGACGGUGCUGAAGAAGGCCCUGGAUGAAGAGACGCGGUCCCAUGAGGCUCAGGUCCAGGAGAUGAGGCAGAAACACGCACAGGCGGUGGAGGAGCUCACAGAGCAGCUUGAGCAGUUCAAGAGGGCCAAGGCGAACCUAGACAAGAAUAAGCAGACGCUGGAGAAAGAGAACGCAGACCUGGCCGGGGAGCUGCGGGUCCUGGGCCAGGCCAAGCAGGAGGUGGAACAUAAGAAGAAGAAGCUGGAGGCGCAGGUGCAGGAGCUGCAGUCCAAGUGCAGCGAUGGGGAGCGGGCCCGGGCGGAGCUCAAUGACAAAGUCCACAAGCUGCAGAAUGAAGUUGAGAGCGUCACAGGGAUGCUUAACGAGGCCGAGGGGAAGGCCAUUAAGCUGGCCAAGGACGUGGCGUCCCUCAGUUCCCAGCUCCAGGACACCCAGGAGCUGCUUCAAGAAGAAACCCGGCAGAAGCUCAACGUGUCUACGAAGCUGCGCCAGCUGGAGGAGGAGCGGAACAGCCUGCAAGACCAGCUGGACGAGGAGAUGGAGGCCAAGCAGAACCUGGAGCGCCACAUCUCCACUCUCAACAUCCAGCUCUCCGACUCGAAGAAGAAGCUGCAGGACUUUGCCAGCACCGUGGAAGCUCUGGAAGAGGGGAAGAAGAGGUUCCAGAAGGAGAUCGAGAACCUCACCCAGCAGUACGAGGAGAAGGCGGCCGCUUAUGAUAAACUGGAAAAGACCAAGAACAGGCUUCAGCAGGAGCUGGACGACCUGGUUGUUGAUUUGGACAACCAGCGGCAACUCGUGUCCAACCUGGAAAAGAAGCAGAGGAAAUUUGAUCAGUUGUUAGCCGAGGAGAAAAACAUCUCUUCCAAAUACGCGGAUGAGAGGGACAGAGCUGAGGCAGAAGCCAGGGAGAAGGAAACCAAGGCCCUGUCCCUGGCUCGGGCCCUUGAAGAGGCCUUGGAAGCCAAAGAGGAACUCGAGCGGACCAACAAAAUGCUCAAAGCCGAAAUGGAAGACCUGGUCAGCUCCAAGGAUGACGUGGGCAAGAACGUCCAUGAGCUGGAGAAGUCCAAGCGGGCCCUGGAGACCCAGAUGGAGGAGAUGAAGACGCAGCUGGAAGAGCUGGAGGACGAGCUGCAAGCCACGGAGGACGCCAAACUGCGGCUGGAAGUCAACAUGCAGGCGCUCAAGGGCCAGUUCGAAAGGGAUCUCCAAGCCCGGGACGAGCAGAAUGAGGAGAAGAGGAGGCAACUGCAGAGACAGCUUCACGAGUAUGAGACGGAACUGGAAGACGAGCGAAAGCAACGUGCCCUGGCAGCUGCAGCAAAGAAGAAGCUGGAAGGGGACCUGAAAGACCUGGAGCUUCA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2396.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2513.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 1960.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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