Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002616.3
Sequence Length
4676 nt
GC Content
0.6268
GGAGCUUCCACUCGGCUGCGGGCUGGAGCGGCGGCGGGCAGGCGUGCGGAGGACACUCCUGCGACCAGGUACUGGCUGUGAUCGAACUUCUCAACCCUCAGAGACUUAGAUCUUCCACCUCACUCCCUCAGCCAAGCCUCCAGGCCCCCUCGUGCAUCCGUGGUGGCCUCUCUGCCUUCUCUGUUCUGUUCUCCCCAUGGCCCAGACAUGAGUGGCCCCCUAGAAGGGGCUGAUGGGGGAGGGGACCCCAGGCCUGGGGAAUCAUUUUGUCCUGGGGGCGUCCCAUCCCCUGGGCCCCCACAGCACCGGCCUUGCCCAGGCCCCAGCCUGGCCGAUGACACCGAUGCCAACAGCAAUGGUUCAAGUGGCAAUGAGUCCAACGGGCAUGAGUCUAGAGGCGCAUCUCAGCGGAGCUCACACAGCUCCUCCUCAGGCAACGGCAAGGACUCAGCCCUGCUGGAGACCACUGAGAGCAGCAAGAGCACAAACUCUCAGAGCCCAUCCCCACCCAGCAGUUCCAUUGCCUACAGCCUCCUGAGUGCCAGCUCAGAGCAGGACAACCCGUCCACCAGUGGCUGCAGCAGUGAACAGUCAGCCCGGGCAAGGACUCAGAAGGAACUCAUGACAGCACUUCGAGAGCUCAAGCUUCGACUGCCGCCAGAGCGCCGGGGCAAGGGCCGCUCUGGGACCCUGGCCACGCUGCAGUACGCACUGGCCUGUGUCAAGCAGGUGCAGGCCAACCAGGAAUACUACCAGCAGUGGAGCCUGGAGGAGGGCGAGCCUUGCUCCAUGGACAUGUCCACCUAUACCCUGGAGGAGCUGGAGCACAUCACGUCUGAGUACACACUUCAGAACCAGGAUACCUUCUCAGUGGCUGUCUCCUUCCUGACGGGCCGAAUCGUCUACAUUUCGGAGCAGGCAGCCGUCCUGCUGCGUUGCAAGCGGGACGUGUUCCGGGGUACCCGCUUCUCUGAGCUCCUGGCUCCCCAGGAUGUGGGAGUCUUCUAUGGUUCCACUGCUCCAUCUCGCCUGCCCACCUGGGGCACAGGGGCCUCAGCAGGUUCAGGCCUCAGGGACUUUACCCAGGAGAAGUCCGUCUUCUGCCGUAUCAGAGGAGGUCCUGACCGGGAUCCAGGGCCUCGGUACCAGCCAUUCCGCCUAACCCCGUAUGUGACCAAGAUCCGGGUCUCAGAUGGGGCCCCUGCACAGCCGUGCUGCCUGCUGAUUGCAGAGCGCAUCCAUUCGGGUUACGAAGCUCCCCGGAUACCCCCUGACAAGAGGAUUUUCACUACGCGGCACACACCCAGCUGCCUCUUCCAGGAUGUGGAUGAAAGGGCUGCCCCCCUGCUGGGCUACCUGCCCCAGGACCUCCUGGGGGCCCCAGUGCUCCUGUUCCUGCAUCCUGAGGACCGACCCCUCAUGCUGGCUAUCCACAAGAAGAUUCUGCAGUUGGCGGGCCAGCCCUUUGACCACUCCCCUAUCCGCUUCUGUGCCCGCAACGGGGAGUAUGUCACCAUGGACACCAGCUGGGCUGGCUUUGUGCACCCCUGGAGCCGCAAGGUAGCCUUCGUGUUGGGCCGCCACAAAGUACGCACGGCCCCCCUGAAUGAGGACGUGUUCACUCCCCCGGCCCCCAGCCCAGCUCCCUCCCUGGACACUGAUAUCCAGGAGCUGUCAGAGCAGAUCCACCGGCUGCUGCUGCAGCCCGUCCACAGCCCCAGCCCCACGGGACUCUGUGGAGUCGGCGCCGUGACAUCCCCAGGCCCUCUCCACAGCCCUGGGUCCUCCAGUGAUAGCAACGGGGGUGAUGCAGAGGGGCCUGGGCCUCCUGCGCCAGUGACUUUCCAGCAGAUCUGUAAGGAUGUGCAUCUGGUGAAGCACCAGGGCCAGCAGCUUUUUAUUGAGUCUCGGGCCCGGCCUCAGUCCCGGCCCCGCCUCCCUGCUACAGGCACGUUCAAGGCCAAGGCCCUUCCCUGCCAAUCCCCAGACCCAGAGCUGGAGGCGGGUUCUGCUCCCGUCCAGGCCCCACUAGCCUUGGUCCCUGAGGAGGCCGAGAGGAAAGAAGCCUCCAGCUGCUCCUACCAGCAGAUCAACUGCCUGGACAGCAUCCUCAGGUACCUGGAGAGCUGCAACCUCCCCAGCACCACUAAGCGUAAAUGUGCCUCCUCCUCCUCCUAUACCACCUCCUCAGCCUCUGACGACGACAGGCAGAGGACAGGUCCAGUCUCUGUGGGGACCAAGAAAGAUCCGCCGUCAGCAGCGCUGUCUGGGGAGGGGGCCACCCCACGGAAGGAGCCAGUGGUGGGAGGCACCCUGAGCCCGCUCGCCCUGGCCAAUAAGGCGGAGAGUGUGGUGUCCGUCACCAGUCAGUGUAGCUUCAGCUCCACCAUCGUCCAUGUGGGAGACAAGAAGCCCCCGGAGUCGGACAUCAUCAUGAUGGAGGACCUGCCUGGCCUAGCCCCAGGCCCAGCCCCCAGCCCAGCCCCCAGCCCCACAGUAGCCCCUGACCCAGCCCCAGACGCCUACCGUCCAGUGGGGCUGACCAAGGCCGUGCUGUCCCUGCACACACAGAAGGAAGAGCAAGCCUUCCUCAGCCGCUUCCGAGACCUGGGCAGGCUGCGUGGACUCGACAGCUCUUCCACAGCUCCCUCAGCCCUUGGCGAGCGAGGCUGCCACCACGGCCCCGCACCCCCAAGCCGCCGACACCACUGCCGAUCCAAAGCCAAGCGCUCACGCCACCACCAGAACCCUCGGGCUGAAGCGCCCUGCUAUGUCUCACACCCCUCACCCGUGCCACCCUCCACCCCCUGGCCCACCCCACCAGCCACUACCCCCUUCCCAGCGGUUGUCCAGCCCUACCCUCUCCCAGUGUUCUCUCCUCGAGGAGGCCCCCAGCCUCUUCCCCCUGCUCCCACAUCUGUGCCCCCAGCUGCUUUCCCCGCCCCUUUGGUGACCCCAAUGGUGGCCUUGGUGCUCCCUAACUAUCUGUUCCCAACCCCAUCCAGCUAUCCUUAUGGGGCACUCCAGACCCCUGCUGAAGGGCCUCCCACUCCUGCCUCGCACUCCCCUUCUCCAUCCUUGCCCGCCCUCGCCCCGAGUCCUCCUCACCGCCCGGACUCUCCACUGUUCAACUCGAGAUGCAGCUCUCCACUCCAGCUCAAUCUGCUGCAGCUGGAGGAGCUCCCCCGUGCUGAGGGGGCUGCUGUUGCAGGAGGCCCUGGGAGCAGUGCCGGGCCCCCACCUCCCAGUGCGGAGGCUGCUGAGCCAGAGGCCAGACUGGCGGAGGUCACUGAGUCCUCCAAUCAGGACGCACUUUCCGGCUCCAGUGACCUGCUCGAACUUCUGCUGCAAGAGGACUCGCGCUCCGGCACAGGCUCCGCAGCCUCGGGCUCCUUGGGCUCUGGCUUGGGCUCUGGGUCUGGUUCAGGCUCCCAUGAAGGGGGCAGCACCUCAGCCAGCAUCACUCGCAGCAGCCAGAGCAGCCACACAAGCAAAUACUUUGGCAGCAUCGACUCUUCCGAGGCUGAGGCUGGGGCUGCUCGGGGCGGGGCUGAGCCUGGGGACCAGGUGAUUAAGUACGUGCUCCAGGAUCCCAUUUGGCUGCUCAUGGCCAAUGCUGACCAGCGCGUCAUGAUGACCUACCAGGUGCCCUCCAGGGACAUGACCUCUGUGCUGAAGCAGGAUCGGGAGCGGCUCCGAGCCAUGCAGAAGCAGCAGCCUCGGUUUUCUGAGGACCAGCGGCGGGAACUGGGUGCUGUGCACUCCUGGGUCCGGAAGGGCCAACUGCCUCGGGCUCUUGAUGUGAUGGCCUGUGUGGACUGUGGGAGCAGCACCCAAGAUCCUGGUCACCCUGAUGACCCACUCUUCUCAGAGCUGGAUGGACUGGGGCUGGAGCCCAUGGAAGAGGGUGGAGGCGAGCAGGGCAGCAGCGGUGGCGGCAGUGGUGAGGGAGAGGGCUGCGAGGAGGCCCAAGGCGGGGCCAAGGCUUCAAGCUCUCAGGACUUGGCUAUGGAGGAGGAGGAAGAAGGCAGGAGCUCAUCCAGUCCAGCCUUACCUACAGCAGGAAACUGCACCAGCUAGACUCCAUUCUGGGACCAUCUCCAGGAGUCCAUGAGAGGCUUUCUUCUCCUAUGUCCCAAUUCUCAGAACUCAGAUGUGGCUAGACCAACCAGUGGGAAACUGCCCCAGCUUCUCCCACCAUAGGGGGCCGGACCCCCAUCACCAGCCUAGGAUCCAGGGGCUGCCUCUGGCCUCUUAGGGAGCAGAGAGCAGAACUCCGCAGCCCAGCCCAGAGGAGUGUCACCUCCCACCUUUGGAGAGGAAUCCUUCCCUCCCCUGGACAAAGUUGCUGACAAGCUGCUGAAGUGGCCUCUCCAUAUUCCAGCUGAGCCUGAAUCUGACUCUUGAGGGUUGGGGCUGCACUUAUUUAUUGCGGGGAGACAGCUCUCUCUCCCACCUCCUCCCCAGAUGGGAGGAGAGCCUGAGGCCCAAGCAGGACCCGGGGGUUCCAGCCCCUAGCUGCUCUGGAGUGGGGGAGGUUGGUGGACCAUGGAGUCCCUGGUGCUGCCCCUCAGGUGGGACCCAGGCGUUCUCAGCUGUACCCUCUGCCGAUGGCAUUUGUGUUUUUGAUAUUUGUGUCUGUUACUACUUUUUUAAUACAAAAAGAUAAAAACGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2004.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2078.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 1480.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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