Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002870.5

Sequence Length

1164 nt

GC Content

0.5129

CUUCCUGGCCUGGGCUCCGUGCCGCUCUGUUUGCCAACCGUCCAGUCCCGCCUACCAGUGCCGGGCGCUCCCCACCCCUCCCCCGGCUCCCCCGGUGUCCGCCAUGGCCAAAGCCUACGACCACCUCUUCAAGUUGCUGCUGAUCGGGGACUCGGGGGUGGGCAAGACUUGUCUGAUCAUUCGCUUUGCAGAGGACAACUUCAACAACACUUACAUCUCCACCAUCGGAAUUGAUUUCAAGAUCCGCACUGUGGAUAUAGAGGGGAAGAAGAUCAAACUACAAGUCUGGGACACGGCUGGCCAAGAGCGGUUCAAGACAAUAACUACUGCCUACUACCGUGGAGCCAUGGGCAUUAUCCUAGUAUACGACAUCACGGAUGAGAAAUCUUUCGAGAAUAUUCAGAACUGGAUGAAAAGCAUCAAGGAGAAUGCCUCGGCUGGGGUGGAGCGCCUCUUGCUGGGGAACAAAUGUGACAUGGAGGCCAAGAGGAAGGUGCAGAAGGAGCAGGCCGAUAAGUUGGCUCGAGAGCAUGGAAUCCGAUUUUUCGAAACUAGUGCUAAAUCCAGUAUGAAUGUGGAUGAGGCUUUUAGUUCCCUGGCCCGGGACAUCUUGCUCAAGUCAGGAGGCCGGAGAUCAGGAAACGGCAACAAGCCUCCCAGUACUGACCUGAAAACUUGUGACAAGAAGAACACCAACAAGUGCUCCCUGGGCUGAGGACCCUUUCUUGCCUCCCCACCCCGGAAGCUGAACCUGAGGGAGACAACGGCAGAGGGAGUGAGCAGGGGAGAAAUAGCAGAGGGGCUUGGAGGGUCACAUAGGUAGAUGGUAAAGAGAAUGAGGAGAAAAAGGAGAAAAGGGAAAAGCAGAAAGGAAAAAAAGGAAGAGAGAGGAAGGGAGAAGGGAGAGGAAUGAAUUGAGGAAGUGAAAGAAGGCAAGGAGGUAGGAAGAGAGGGAGGAGGAAAGGAAGGAGAGAUGCCUCAGGCUUCAGACCUUACCUGGGUUUUCAGGGCAAACAUAAAUGUAAAUACACUGAUUUAUUCUGUUACUAGAUCAGGUUUUAGGGUCCUGCAAAAGGCUAGCUCGGCACUACACUAGGGAAUUUGCUCCUGUUCUGUCACUUGUCAUGGUCUUUCUUGGUAUUAAAGGCCACCAUUUGCACAAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-364.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -383.82

Frequency: 0.0000

Diversity: 261.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.(((((..(((((.(((((((((.((((((....(((((......((..((((((..(((((((((..(((((..((..((((((..(((((.(((((.((((((..(((.....((((((((...((((.(((.....))).)))).))))))))...((((((((.(((((.(((.((((...((((....))))...............(((((...((((.(((....)))..))))....)))))....)))).)))...)))))....)))))))).......))))))))).).))))....((.((........)).))..))))).))))))..(((((((.((((.(.......((((.(((.((((...(((....)))...))))...)))))))........).)))).))))))).))..))))))))))))))..))))))))......)).)))..((((((...(((((((((((.......))).(((((....)))))(((((((.((.(....).)))))))))((((((.(((..(((((.........)))))..)))..)))))).(((((((((((...((((((.(((((....(((.(((..((..(((...(((.....))))))..)).))).)))....))))).).))))).((.(((......))).)))))))))).)))..))))))))))))))...((((((.........))).))).......)))))).)))))).))).)).......)))....))))).))))).........(((((((((.................................................((((((((((.(((..((.((((.((.(((.((.......(((.((((..((..(((......((((((...((((...((((....((.((.......))))...))))...)))).(((((....)))))...........(.((((.((.((((((((.........)))))))))))))).).)))))).....)))..))...)))).).)).......)).))))).)))).)).))).))....))))))))(((.......))))))))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((,{((((..{((((.(((((((((.((((((..,,{((((,{{{{.((..{((((,..((((((((({{(((((.,({,,((((((,.(((((.(((((.(((((,.,(((.....((((((((...((((.(((.....))).)))).)))))))).{.((((((((.(((((.(((.(((({..((((....))))..,.........,..(((((...((((.(((....)))..))))....)))))..,.}))).))}...)))))....)))))))).,.....))))))))).).))))....,,.,,........}},||,,,)))).))))))..(((((({.((((.(.......((((.(((.((((.,.(((....)))...))))...)))))))........).)))).})))))}.))..))))}))))))|||,..}}}))))..,...,}.,,}..((((((...(((((((((((.......))),(((((....)))))|((((((.,({(...}),,,)))))),{(((((.(((..(((((.........)))))..)))..)))))},({(((((((((...((((((.(((((....(((.(((..{{..(((...(((.....))))))..)).))).)))....))))).).))))).({.(((......))).)))))))))),,))..)))))))))))))),},|||||{..,,,,..,)}).))),}.,...)))})),)))))).))}.))}.,....,))...,))))).))))),,.......(((((((({....,.......,,,.............,,......|............{(((((((,,,{{(,.((.((({{(({{(((({{...({.,{{.((((..,(..(((...,{{(({{((,,.((((...({{{....,..,........))))...))))..,)))).|||{,.,,,})|||{{.........|}|,{,.{(.((((((((.........)))))))))),}},.,|)))))}...,,))).,))...)))).).)).,...}))).))))).)))).)).))).))....))))))))(((.......))))))))))))......