Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002963.4
Sequence Length
429 nt
GC Content
0.4895
ACACAUCUCACUCAUCCUUCUACUCGUGACGCUUCCCAGCUCUGGCUUUUUGAAAGCAAAGAUGAGCAACACUCAAGCUGAGAGGUCCAUAAUAGGCAUGAUCGACAUGUUUCACAAAUACACCAGACGUGAUGACAAGAUUGAGAAGCCAAGCCUGCUGACGAUGAUGAAGGAGAACUUCCCCAACUUCCUUAGUGCCUGUGACAAAAAGGGCACAAAUUACCUCGCCGAUGUCUUUGAGAAAAAGGACAAGAAUGAGGAUAAGAAGAUUGAUUUUUCUGAGUUUCUGUCCUUGCUGGGAGACAUAGCCACAGACUACCACAAGCAGAGCCAUGGAGCAGCGCCCUGUUCCGGGGGCAGCCAGUGACCCAGCCCCACCAAUGGGCCUCCAGAGACCCCAGGAACAAUAAAAUGUCUUCUCCCACCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-113.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -121.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 60.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((..............)))).(((....)))(((((.((((((....))))))((((.....))))..(((.(((((((((....(((.(..(((((.((((((((.............)))).)))).).))))..))))..(((((((((.(.((..((((.....))))..)).).))....((((((..........))))))..........((..((((((((.((...(((((((.((((..(((..((((......)))))))..)))).))))))).)).)))))))).))..............))))).))...(((((((....))))))).(((((.............)))))....)))))))))))).......(((((((......))).))))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......,{{{..............}}}}.(((....})){(({(,((({{{.,,,)}})))((((.....))))..(((.(((((((((....(((.{..(((((.((((((((.............)))).)))).).))))..})))..(((((((,..,.{{..((((,,,..,}}}..},.,,)),},.((((((.,......,.))))))..........((..((((((((.((...(((((((.((((..(((..((({......}))})))..)))).))))))).)).)))))))).))....,.........))))).))..,(((((((....)))))))}(((((.............)))))....)))))))))))).,.....,(({{({......))),}},}....)})),
Back