Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004048.4
Sequence Length
943 nt
GC Content
0.3913
AUUCCUGAAGCUGACAGCAUUCGGGCCGAGAUGUCUCGCUCCGUGGCCUUAGCUGUGCUCGCGCUACUCUCUCUUUCUGGCCUGGAGGCUAUCCAGCGUACUCCAAAGAUUCAGGUUUACUCACGUCAUCCAGCAGAGAAUGGAAAGUCAAAUUUCCUGAAUUGCUAUGUGUCUGGGUUUCAUCCAUCCGACAUUGAAGUUGACUUACUGAAGAAUGGAGAGAGAAUUGAAAAAGUGGAGCAUUCAGACUUGUCUUUCAGCAAGGACUGGUCUUUCUAUCUCUUGUACUACACUGAAUUCACCCCCACUGAAAAAGAUGAGUAUGCCUGCCGUGUGAACCAUGUGACUUUGUCACAGCCCAAGAUAGUUAAGUGGGAUCGAGACAUGUAAGCAGCAUCAUGGAGGUUUGAAGAUGCCGCAUUUGGAUUGGAUGAAUUCCAAAUUCUGCUUGCUUGCUUUUUAAUAUUGAUAUGCUUAUACACUUACACUUUAUGCACAAAAUGUAGGGUUAUAAUAAUGUUAACAUGGACAUGAUCUUCUUUAUAAUUCUACUUUGAGUGCUGUCUCCAUGUUUGAUGUAUCUGAGCAGGUUGCUCCACAGGUAGCUCUAGGAGGGCUGGCAACUUAGAGGUGGGGAGCAGAGAAUUCUCUUAUCCAACAUCAACAUCUUGGUCAGAUUUGAACUCUUCAAUCUCUUGCACUCAAAGCUUGUUAAGAUAGUUAAGCGUGCAUAAGUUAACUUCCAAUUUACAUACUCUGCUUAGAAUUUGGGGGAAAAUUUAGAAAUAUAAUUGACAGGAUUAUUGGAAAUUUGUUAUAAUGAAUGAAACAUUUUGUCAUAUAAGAUUCAUAUUUACUUCUUAUACAUUUGAUAAAGUAAGGCAUGGUUGUGGUUAAUCUGGUUUAUUUUUGUUCCACAAGUUAAAUAAAUCAUAAAACUUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-246.7 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -263.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 219.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((...))).))))))...((((...((((.(((((.((((....((((((.((((.((((((((((((.(((((((.....))))).))........((((((((.......((....((((........))))..)).......)))))))).....(((((.((((.......)))))))))...(((......)))..)))).)))))))).........))))))))))..(((((.((((((....)))))).)))))(((((..((((((......(((((((..((((((......(((..(((((((.(((((((((......((((((...)))))).((((...........))))......)))))...)))).....((((((((.....(((((((..((((((.(((.((((((.....(((((((.(((((((((...........(((((((((((..(((......((((..((.((((((((((((..(((((......)))))........)))))))))))).))..))))........)))..).)))))..)))))(((((((........((((((...))))))))))))).))))))))))))))))))))))))).))))))....((((((((((.(((.(((((...................)))))..)))))))))).)))..))).)))).....)))))))).....)))))))..)))......))))))..)))))))...........))))))....))))).((((((......))))))..((((((((((((((((............)))))))....))))))))))))))))))..))))...))))(((((((((((((...))))...)))))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((((...))).)))))).,.((((...{(((.((((,{(((({,,,((((((.((((.((((((((((((.({{((((.,...}}})).}|.|.,,...{(((((((.......({....((((........))))..}}.......)))))))),,,..|||{||(({{....,}}),,|}}}}}...{||,,....,}}..)))}.)))))))).........))))))))))..(((((.((((({....)))))).)))))(((((..((((((......(((((((..((((((......(((..(((((((.((((((((({,.{{{(,((((,..|||,,,.,,{,.,,,,}}},.}))),.,,...)))))...)))).....((((((((..,.,(((({((..{(((((.(((.((((((.....(((((((.({{((((({...........{((((((((((..(((......((((..({.((((((((((((..(((((......)))))........)))))))))))).})..))))........)))..).)))),.,))))|(((((({.......,((((((...))))))))))))),))))))))})))))))))))))))).)))))}..,.{{{{|{||||.,(({{((((....,}}}},,,..,|,|,}}}}}{||||}}}}}}}.}})..))),)))).....)))))))).....)))))))..)))......))))))..))))))).....,....,))))))....})))},,,{{{{....,,}}},.,.,|{{(((((((((((((............)))))))....))))))))))))))))))..))))...)))){|{((({{{{{{{...}||||..,})))}}}}.....,,,,,.
Back