Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_005940.5

Sequence Length

2261 nt

GC Content

0.6192

AAGCCCAGCAGCCCCGGGGCGGAUGGCUCCGGCCGCCUGGCUCCGCAGCGCGGCCGCGCGCGCCCUCCUGCCCCCGAUGCUGCUGCUGCUGCUCCAGCCGCCGCCGCUGCUGGCCCGGGCUCUGCCGCCGGACGCCCACCACCUCCAUGCCGAGAGGAGGGGGCCACAGCCCUGGCAUGCAGCCCUGCCCAGUAGCCCGGCACCUGCCCCUGCCACGCAGGAAGCCCCCCGGCCUGCCAGCAGCCUCAGGCCUCCCCGCUGUGGCGUGCCCGACCCAUCUGAUGGGCUGAGUGCCCGCAACCGACAGAAGAGGUUCGUGCUUUCUGGCGGGCGCUGGGAGAAGACGGACCUCACCUACAGGAUCCUUCGGUUCCCAUGGCAGUUGGUGCAGGAGCAGGUGCGGCAGACGAUGGCAGAGGCCCUAAAGGUAUGGAGCGAUGUGACGCCACUCACCUUUACUGAGGUGCACGAGGGCCGUGCUGACAUCAUGAUCGACUUCGCCAGGUACUGGCAUGGGGACGACCUGCCGUUUGAUGGGCCUGGGGGCAUCCUGGCCCAUGCCUUCUUCCCCAAGACUCACCGAGAAGGGGAUGUCCACUUCGACUAUGAUGAGACCUGGACUAUCGGGGAUGACCAGGGCACAGACCUGCUGCAGGUGGCAGCCCAUGAAUUUGGCCACGUGCUGGGGCUGCAGCACACAACAGCAGCCAAGGCCCUGAUGUCCGCCUUCUACACCUUUCGCUACCCACUGAGUCUCAGCCCAGAUGACUGCAGGGGCGUUCAACACCUAUAUGGCCAGCCCUGGCCCACUGUCACCUCCAGGACCCCAGCCCUGGGCCCCCAGGCUGGGAUAGACACCAAUGAGAUUGCACCGCUGGAGCCAGACGCCCCGCCAGAUGCCUGUGAGGCCUCCUUUGACGCGGUCUCCACCAUCCGAGGCGAGCUCUUUUUCUUCAAAGCGGGCUUUGUGUGGCGCCUCCGUGGGGGCCAGCUGCAGCCCGGCUACCCAGCAUUGGCCUCUCGCCACUGGCAGGGACUGCCCAGCCCUGUGGACGCUGCCUUCGAGGAUGCCCAGGGCCACAUUUGGUUCUUCCAAGGUGCUCAGUACUGGGUGUACGACGGUGAAAAGCCAGUCCUGGGCCCCGCACCCCUCACCGAGCUGGGCCUGGUGAGGUUCCCGGUCCAUGCUGCCUUGGUCUGGGGUCCCGAGAAGAACAAGAUCUACUUCUUCCGAGGCAGGGACUACUGGCGUUUCCACCCCAGCACCCGGCGUGUAGACAGUCCCGUGCCCCGCAGGGCCACUGACUGGAGAGGGGUGCCCUCUGAGAUCGACGCUGCCUUCCAGGAUGCUGAUGGCUAUGCCUACUUCCUGCGCGGCCGCCUCUACUGGAAGUUUGACCCUGUGAAGGUGAAGGCUCUGGAAGGCUUCCCCCGUCUCGUGGGUCCUGACUUCUUUGGCUGUGCCGAGCCUGCCAACACUUUCCUCUGACCAUGGCUUGGAUGCCCUCAGGGGUGCUGACCCCUGCCAGGCCACGAAUAUCAGGCUAGAGACCCAUGGCCAUCUUUGUGGCUGUGGGCACCAGGCAUGGGACUGAGCCCAUGUCUCCUCAGGGGGAUGGGGUGGGGUACAACCACCAUGACAACUGCCGGGAGGGCCACGCAGGUCGUGGUCACCUGCCAGCGACUGUCUCAGACUGGGCAGGGAGGCUUUGGCAUGACUUAAGAGGAAGGGCAGUCUUGGGCCCGCUAUGCAGGUCCUGGCAAACCUGGCUGCCCUGUCUCCAUCCCUGUCCCUCAGGGUAGCACCAUGGCAGGACUGGGGGAACUGGAGUGUCCUUGCUGUAUCCCUGUUGUGAGGUUCCUUCCAGGGGCUGGCACUGAAGCAAGGGUGCUGGGGCCCCAUGGCCUUCAGCCCUGGCUGAGCAACUGGGCUGUAGGGCAGGGCCACUUCCUGAGGUCAGGUCUUGGUAGGUGCCUGCAUCUGUCUGCCUUCUGGCUGACAAUCCUGGAAAUCUGUUCUCCAGAAUCCAGGCCAAAAAGUUCACAGUCAAAUGGGGAGGGGUAUUCUUCAUGCAGGAGACCCCAGGCCCUGGAGGCUGCAACAUACCUCAAUCCUGUCCCAGGCCGGAUCCUCCUGAAGCCCUUUUCGCAGCACUGCUAUCCUCCAAAGCCAUUGUAAAUGUGUGUACAGUGUGUAUAAACCUUCUUCUUCUUUUUUUUUUUUUAAACUGAGGAUUGUCAUUAAACACAGUUGUUUUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-985.3 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1023.65

Frequency: 0.0000

Diversity: 754.12

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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