Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006498.3
Sequence Length
596 nt
GC Content
0.5336
CUGUUUGUGCUGGGUACUGGGAGAUGCAGGCGGGGAGACACAAGGUAGAAGGGGCAAAGUCCUCACCUAGGACCUUGAGGGAGUUAAUGUGUAAUAUUCUAGGAUAUAAGCUUGACCACGAGUUGAGACCCUGAGCACAGGCCUCCAGGAGCCGCUGGGAGCUGCCGCCAGGAGCUGUCACCAUGACGGGGGAACUUGAGGUUAAGAACAUGGACAUGAAGCCGGGGUCAACCCUGAAGAUCACAGGCAGCAUCGCCGAUGGCACUGAUGGCUUUGUAAUUAAUCUGGGCCAGGGGACAGACAAGCUGAACCUGCAUUUCAACCCUCGCUUCAGCGAAUCCACCAUUGUCUGCAACUCAUUGGACGGCAGCAACUGGGGGCAAGAACAACGGGAAGAUCACCUGUGCUUCAGCCCAGGGUCAGAGGUCAAGUUCACAGUGACCUUUGAGAGUGACAAAUUCAAGGUGAAGCUGCCAGAUGGGCACGAGCUGACUUUUCCCAACAGGCUGGGUCACAGCCACCUGAGCUACCUGAGCGUAAGGGGCGGGUUCAACAUGUCCUCUUUCAAGUUAAAAGAAUAAAAGACUUCCAGCCGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-192.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -204.6
Frequency: 0.0000
Diversity: 198.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(.(.((((...)))).).).)))(((.(((((.....((((.((.(((......))))))))).....((((((((((...((((((.(((((....))))).((((((....))))))..(((((((.((....((((((((...((....)).(((((((((((...((((((...)))))).......((((....(((.((((((..((((((.(((((......(((((....((((((((.(((((..((((...(((.............)))...))))..)).).))...))))..))))..)))))))))).)))))).....))))....)))))....)))))))).)))))))..))))))))..(((..(((((.......)))))..))).)).)))))))((((((((.........))))))))..((((.....))))....((((.(((((...((((.(.(((....))).)))))...(((((.....))))).(((..(((.....)))...)))))))).)))))))))).))))))))))................))))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((.{.(.((((...)})).).}.})}(((.(((((.,.{.((((.(,,(((,,...,))))))))).,,,.((((((((((...(((({{.{{{{{....}}}}}.{(((((,,,.||||||..,{(((((,((,{{((({((({(..,{{.||||,.|{(((({((({|,{((((({...})))))...,,||||,||}},||..,,{(((,.((((((,(((({...,,,{({,{....{{((((((.(((((..{||{.{,{{({{{{,.,......,}).}})))),,|}.|,|,...})))..)))}..,}}}}})))|,)})))},.,..}}}}||,,||}}|,|..})).,})).}))))))..)))),)))..{{,..,{{{{.......)))))}})},.}}.)))))||((((((((.........))))))))},((((.....))))..}}|{{{,{((((.,.((((.,.(((....))).,)))}.,.(((((.....))))).(((..(((.....)))...)))))))).)))}})))}},)))))))))),,............,.))))).)))..
Back