Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_012138.4

Sequence Length

2062 nt

GC Content

0.5276

GCGCCUCCCGGAAGUGGCCGGUCCAGAGCUGUGGGGUGGCCUCCGCGCGGUCUCUGGCGGAGUCGGGGAAUCGGAUCAAGGCGAGAGGAUCCGGCAGGGAAGGAGCUUCGGGGCCGGGGGUUGGGCCGCACAUUUACGUGCGCGAAGCGGAGUGGACCGGGAGCUGGUGACGAUGGCGGGGCCGCAGCCCCUGGCGCUGCAACUGGAACAGUUGUUGAACCCGCGACCAAGCGAGGCGGACCCUGAAGCGGACCCCGAGGAAGCCACUGCUGCCAGGGUGAUUGACAGGUUUGAUGAAGGGGAAGAUGGGGAAGGUGAUUUCCUAGUAGUGGGUAGCAUUAGAAAACUGGCAUCAGCCUCCCUCUUGGACACGGACAAAAGGUAUUGCGGCAAAACCACCUCUAGAAAAGCAUGGAAUGAAGACCAUUGGGAGCAGACUCUGCCAGGAUCGUCUGAUGAGGAAAUAUCUGAUGAGGAAGGGUCUGGAGAUGAAGAUUCAGAGGGACUGGGUCUGGAGGAAUAUGAUGAGGACGACCUGGGUGCUGCUGAGGAACAGGAGUGUGGUGAUCACAGGGAGAGCAAGAAGAGCAGAAGCCACUCUGCAAAAACACCGGGCUUCAGUGUCCAGAGUAUCAGUGACUUUGAGAAAUUUACCAAGGGAAUGGAUGACCUUGGGAGCAGUGAGGAGGAGGAAGACGAAGAGAGUGGCAUGGAAGAAGGGGAUGACGCGGAAGACUCCCAAGGCGAGAGUGAGGAAGACAGGGCUGGAGAUAGAAACAGUGAGGAUGAUGGUGUGGUGAUGACCUUCUCUAGUGUCAAAGUUUCUGAGGAAGUGGAGAAAGGAAGAGCCGUGAAGAACCAGAUAGCACUGUGGGACCAGCUCUUGGAAGGAAGGAUCAAACUACAAAAAGCUCUGUUGACCACCAACCAGCUUCCUCAACCAGAUGUUUUCCCAUUGUUCAAGGACAAAGGUGGCCCAGAAUUUUCCAGUGCCCUGAAAAAUAGUCACAAGGCACUUAAAGCAUUGUUGAGGUCAUUGGUAGGUCUUCAGGAAGAGUUGCUUUUCCAGUACCCAGACACUAGAUAUCUAGUAGAUGGGACAAAGCCCAAUGCGGGAAGUGAGGAGAUUUCUAGUGAAGAUGAUGAGCUGGUAGAAGAGAAGAAGCAGCAACGAAGAAGGGUCCCUGCAAAGAGGAAGCUGGAGAUGGAGGACUAUCCCAGCUUCAUGGCAAAGCGCUUUGCCGACUUUACAGUCUACAGGAACCGCACACUUCAGAAAUGGCACGAUAAGACCAAACUGGCUUCUGGAAAACUGGGGAAGGGUUUUGGUGCCUUUGAACGCUCAAUCUUGACUCAGAUCGACCAUAUUCUGAUGGACAAAGAGAGAUUACUUCGAAGGACACAGACCAAGCGCUCUGUCUAUCGAGUUCUUGGCAAACCUGAGCCAGCAGCUCAGCCUGUCCCAGAGAGUUUGCCAGGGGAACCGGAGAUCCUUCCUCAAGCCCCUGCUAAUGCUCAUCUGAAGGACUUGGAUGAAGAAAUCUUUGAUGAUGAUGACUUUUACCACCAGCUCCUUCGAGAACUCAUAGAACGGAAGACCAGCUCCUUGGAUCCCAACGAUCAGGUGGCCAUGGGAAGGCAGUGGCUUGCAAUCCAGAAGUUACGAAGCAAAAUCCACAAAAAAGUAGAUAGGAAAGCCAGCAAAGGCAGGAAACUUCGGUUUCAUGUCCUUAGCAAGCUACUGAGUUUCAUGGCACCUAUUGACCAUACUACAAUGAAUGAUGAUGCCAGGACAGAACUGUACCGCUCUCUUUUUGGCCAGCUCCACCCUCCCGACGAAGGCCACGGGGAUUGACAUCGCCCACCUCCGACACCCAGUGGGCGCCUUGGCUGGUGCGGCUGCUGGUCCAGAUGGAGGAAACCAGUGACUUUAUGGGGCUGAGCUAGUAGGGAAGCCCCUGGAAAGAUGCUGCGUUCCGAACCUGUGCCUAAUACACGCAAGGGCGCUGUCCCGCCCAACCCCGCCUUUAAACGCCACAAAUAAAGAGCAUUGUUACCGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-698.8 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -736.35

Frequency: 0.0000

Diversity: 566.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((...(((((.((((......)))).))))))))).((((((((((((((((.(((((...((((((..........))))))(((((...(((((..(((.(((((((((((((((((((......)))).....((.(.((..(((((...))))).))..).))..)))).))))))))))).)))((((((...)))))).....(((((......))).))....((((....((((((.(((....(((.(((....))))))..)))...))))))....)))).....(((((((.....))))))).......((((((((.....((((((.(((((((((((.(((........))).)))......((........))((((........))))........((((.....((((((((.((....(((((.((((......)))).))))))).))))))))..)))).((((((((.....))))))))...((((.((..((.((.(.((((..(((((.(((.....))).)))....(((.((..(((((((((............((((((((.........((...(((((.(((.((((((.......)))))).........((((((..........))))))..))).)))))....)).........))))))))..........((((.(.(......).)))))..........((((((((..((((((((........((((((.......(((((((((..(..(((((((((.(.((..((...))..)).).))))).))))..).))))).....)))).....))))))....))))))))(((..((..((.(((....(((........)))))))).))..))).))))))))......)))))))))..)).)))...))..)))).)))))..)).))))((((((.(((.......)))...))))))...........(((((((((((((.(((((((.(((((((...))))))).((.((((...(((((....)))))...))))))....(((.....)))..((..((((..(((....)))......((((((((.(((((((.((.((......((((...(((.((((.......((((((((.(((((....)))))))))))))..((((((....))))))((((....))))..)))).))).....)))).....(((((..((..((((((.((((((((((.....((((((.(((......(((((((((((...((..((((..((((((..........))))).)....))))..))....)))))))).)))...(((((.((((........)))).))))).....((((((.....))))))))).)))))).(((((((.((((((....((((....)))).....)))))).))).)))).(((((((((.((((..((((..(((.........)))..)))).....)))).)))))).)))..........)))))).))))....)))).))....((((.(((((.((((((((...(((((((((((.........(((....)))...(((.((......)).))).((....))....((((((.(((((....))))).)).)))).)))))))))))..)))))))))))))))))..(((.(......).)))))..)))))(((((....))).))))))))))))).))))))))....))))..)))))))))..((((((....))).))).((((((....(((((((.(((((.....)).))).)))))))......))))))..))))))))))))).))))))))))))))((((....)))).....)))))))))))))...)))))((.........))..(((((......)))))..))))).)))....))))........)))).......)))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,{{{((((((....(((((.((((......)))).)))))|||{{,{||{{{{({{({{{,{({{{{..{(({{{{....},,...)}))))||,|||,.,..(((((({{((({({{{{{{||||((((......)))).|..,||,|.||,,|||||,,})}|||{||||||}||,|||}.}})))))||||,|.(((((((...))))))).,...{(((......))),|||||,{||||.|||{{.||}|,.,,..|,{,|||||.,||||||..,,.,{(((((((,,,..{{,.....{{(((((.....))))))}.,,{,{.{{{{||||.....,||{{|,||||||{{{(({{(({,,.,...},,.,||{.,{{,{{||..,||.{(((({,,....,,{||...,....}|||{.....((((((((.((....(((((.((((......)))).))))))).))))))))..,,},.,,,||||{.....}}}|})))|||||,...,..{,,((.{.{|||.,{|,{{,|{{.....}}|,|||{(({{,.,}}|,((({(,((,.......,....{{{{{|||,......,,||,.,||||{,|||||||||({{{.{{..(((((.,.......|)))))..}}.))),,)))))).}))),))})).,,.)}.........}}}|||||...{,,,..,(((,,{.,{{{{..|.|}|||...{{|.,.{((((((((,{((((((((........((((((.......((((,((((..(..(((((((((.(.((,.,,...,),,,}.}.)))))))})).||.)))},.....)))).....))))))....))))))))(((..((..((.(({,.{..,.........,})))))).))..))),)))))))}.}}...))))))))).||{||,.,||}},.||||,|}}}|,.,||||}|((((((.((,.......}}},,.)))))}....,,.,,,,(((((((((((((.(((((((.(((((((...))))))).((.((((...(((((....)))))...))))))....(((.....)))..((,.((((.,(((....)))}.....((((((((.(((((({,(,,((......((((...(((.((((.......((((((((.(((((....)))))))))))))..((((((....))))))((((....))))..)))).))).....)))).....(((((..,,..{.{{{,.((((((((((.....((((((.,{({{{{..(((((((((((..,((..((((,.((((((..........))))).)..,.)))),,)}....)))))))).))),}}||{{{.{{((.,,,,,,.||||,|||||{,...((((((.....))))))}}),))}|||,((((,{(.((((((....((((....}))).....)))))),,},.)))).|||((((((.((((.,((((..(((.,.......)))..)))),..,,)))).))))))}))),}}},,,}..)))))).)))).,..}}}|.}},,..((((.((((,{(((((((({..(((((((((((.........{{{....,}}...(((.((......)).))).{{....}}....{(((((.(((((....))))).)).)))).)))))))))))..)))))))))))))))))..(((.{....,,).,}},},.)))))(((({....))).))))))))))))).))))))))....)))),.}))))))))..((((((....))).))).((((((....(((((((,(((({.....)),))}.)))))))......))))))..))))))))))))).||||||}}}|}}}}{|{{.,,,)))),,...)))))))),)}})},})))))||,,......,))..|||{|.....,)))))..}}))},))},...,)))),.........,},)))))}))}}..