Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_013292.5
Sequence Length
657 nt
GC Content
0.5784
GACUCCUUGCUUCUUUCCAGCCGGAGCCGCUGCCUUGCCCCCCGGAGACUGAAGACAUGGCACCCAAGAGGGCCAAGAGAAGGACAGUAGAGGGCGGAAGCUCCAGCGUCUUCUCCAUGUUCGACCAGACUCAGAUCCAGGAGUUCAAAGAGGCCUUCACUGUGAUCGACCAGAACCGUGAUGGUAUUAUAGACAAGGAGGACCUUCGGGACACCUUCGCAGCCAUGGGCCGCCUCAAUGUGAAGAAUGAGGAGUUGGAUGCCAUGAUGAAGGAAGCCAGCGGUCCCAUCAACUUCACCGUCUUCCUGACCAUGUUCGGGGAGAAGCUCAAGGGUGCCGACCCUGAGGAUGUGAUCACCGGAGCCUUCAAGGUCUUGGACCCUGAGGGAAAGGGCACCAUCAAGAAGAAGUUCCUGGAGGAGCUGCUGACCACGCAGUGUGACCGCUUCUCCCAGGAGGAGAUCAAGAACAUGUGGGCGGCCUUCCCCCCCGACGUGGGCGGCAACGUCGACUACAAAAACAUCUGCUACGUCAUCACGCACGGCGACGCCAAGGACCAGGAGUAGGGGCACCCGCGGGCCUCCGCUGCCCGACGCUUCUGUUCGGCCCGACCUCCACCCCGGCUCCCAAUAAAAUUUAACUGAUCUUUGUUUCUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-222 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -234.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((..(((.......))).)))).)((......)).....((((((.(((((((((((.((.....)))))).(((..((...((.((((.(((......(((((.((((((((..........(((((........)))))....(((((((((.(((((((..((((.........)))))))))))....))))).)))).(((((..((((((.(((...))).))......((((((.(((.((((((((...((........))...)))))..))))))...))))))..(((((((((......)))))))))..((((.((((....))))))))((((.(....((....((((((.((((...)))).))))))...))...)))))..))))..))))))))))))).)))))....(((.(((((....((((((....))))))........((((((((.((......))))).)))))((((....))))(((((((........)).)).)))....))))).)))..(((..((((.((((((..(((((...((((....)))))))))...)))))))))))))))).)))).)).))..)))...............)).)))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.((.((((((((({{{((((.(..((......))..}))))...}})....(((((((.(({,(((((((..{,(,,(((({{,{({(((({...,,,,,.,)))))))),,.))}}}...,.(((((........))))},.....))))))).(((((((..((((.........)))))))))))....(((((.((...,)}.,.)))}}{{.(((...))).}|((({.{.,....,.})))|.,|})).)))))))..})))))))).)).}})),,....{{{{{....(((((((((......)))))))))..(((,,((((....))))))))((((|{..,.((....((((((.((((...)))).))))))...))}}}}}))).....)}}}}{((((((((((({((((......}}))),....))))))}}}))))|((((({{.{..{{((((({,((,....,}}|}},}}}})|||||,..|||||.,,,,,........||,..{{{|.,,..,,.,))}),,)||..{((.{((((((..(((((...((((....)))))))))...))))))),))||}|}|.........,}))))}}..............})})))),}}},,,..
Back