Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_019597.5
Sequence Length
2296 nt
GC Content
0.4242
ACUCGCUUACGUGAGCAGAAGUAGUUCUGGUCGUCGUCUACCGUCUCGCUAUAGCCGUUUGAGGGAAGAAGGAGGAAAAUUACCCGGUAUCGUUAGAGCUACACCAAAAUUGCAUUGAGCCAAACUUGCCACCAAGAGCCCAACAAUCACCAUGAUGCUGAGCACGGAAGGCAGGGAGGGGUUCGUGGUGAAGGUCAGGGGCCUACCCUGGUCCUGCUCAGCCGAUGAAGUGAUGCGCUUCUUCUCUGAUUGCAAGAUCCAAAAUGGCACAUCAGGUAUUCGUUUCAUCUACACCAGAGAAGGCAGACCAAGUGGUGAAGCAUUUGUUGAACUUGAAUCUGAAGAGGAAGUGAAAUUGGCUUUGAAGAAGGACAGAGAAACCAUGGGACACAGAUACGUUGAAGUAUUCAAGUCUAACAGUGUUGAAAUGGAUUGGGUGUUGAAGCAUACAGGUCCGAAUAGCCCUGAUACUGCCAACGAUGGCUUCGUCCGGCUUAGAGGACUCCCAUUUGGCUGUAGCAAGGAAGAGAUUGUUCAGUUCUUUUCAGGGUUGGAAAUUGUGCCAAAUGGGAUGACACUGCCAGUGGACUUUCAGGGGCGAAGCACAGGGGAAGCCUUUGUGCAGUUUGCUUCACAGGAGAUAGCUGAGAAGGCCUUAAAGAAACACAAGGAAAGAAUAGGGCACAGGUACAUUGAGAUCUUCAAGAGUAGCCGAGCUGAAGUUCGAACCCACUAUGAUCCCCCUCGAAAGCUCAUGGCUAUGCAGCGGCCAGGUCCCUAUGAUAGGCCGGGGGCUGGCAGAGGGUAUAAUAGCAUUGGCAGAGGAGCUGGGUUUGAAAGGAUGAGGCGUGGUGCCUAUGGUGGAGGGUAUGGAGGCUAUGAUGACUAUGGUGGCUAUAAUGAUGGAUAUGGCUUUGGGUCUGAUAGAUUUGGAAGAGACCUCAAUUACUGUUUUUCAGGAAUGUCUGAUCAUAGAUACGGAGAUGGUGGGUCCAGUUUCCAGAGCACCACAGGGCACUGUGUACACAUGAGGGGGUUACCUUACAGAGCCACUGAGAAUGAUAUUUAUAAUUUCUUCUCACCUCUUAAUCCCAUGAGAGUACAUAUUGAAAUUGGACCCGAUGGCAGAGUUACCGGUGAGGCAGAUGUUGAAUUUGCUACUCAUGAAGAUGCUGUGGCAGCUAUGGCAAAAGACAAAGCUAAUAUGCAACACAGAUAUGUGGAGCUCUUCUUAAAUUCUACUGCAGGAACAAGUGGGGGUGCUUACGAUCACAGCUAUGUAGAACUUUUUUUGAAUUCUACAGCAGGGGCAAGUGGUGGCGCUUAUGGUAGCCAAAUGAUGGGAGGGAUGGGCUUAUCCAACCAGUCUAGUUAUGGAGGUCCUGCUAGCCAGCAGCUGAGUGGUGGUUAUGGAGGUGGUUAUGGUGGUCAGAGCAGUAUGAGUGGAUAUGACCAAGUUCUGCAGGAAAACUCCAGUGACUAUCAGUCAAACCUUGCUUAGGUAGAGAAGGAGCACUAAAUAGCUACUCCAGAUAUAAAAGCUGUACAUUUGUGGGAGUUGAAUAGAAUGGGAGGGAUGUUUAGUAUAUCCAGUAUGAUUGGUAAAUGGGAAAUAUAAUUGAUUCUGAUCACUCUUGGUCAGCUUCUCUUUCUUUAUCUUUCUUUCUCCUUUUUUAAGAAAACGAGUUAAGUUUAACAGUUUUGCAUUACAGGCUUGUGAUUCAUGCUUACUGUAAAGUGGAAGUUGAGAUUAUUUUAAAACUUCAAGCUCAGUAAUUUUGAACACUGAAACAUUCAUCUAGGACAUAAUAACAAAGUUCAGUAUUGACCAUAACUGUUAAAACAAUUUUUAGCUUUCCUCAAGUUAGUUAUGUUGUAGGAGUGUACCUAAGCAGUAAGCGUAUUUAGGUUAAUGCAGUUUCACUUAUGUUAAAUGUUGCUCUUAUACCACAAAUACAUUGAAAACUUCGGAUGCAUGUUGAGAAACAUGCCUUUCUGUAAAACUCAAAUAUAGGAGCUGUGUCUACGAUUCAAAGUGAAAACAUUUGGCAUGUUUGUUAAUUCUAGCUUUUUGGUUUAAUAUCCUGUAAGGCACGUGAGUGUACACUUUUUUUUUUUUUAAGGAUACGGGACAAUUUUAAGAUGUAAUACCAAUACUUUAGAAGUUUGGUCGUGUCGUUUGUAUGAAAAUCUGAGGCUUUGGUUUAAAUCUUUCCUUGUAUUGUGAUUUCCAUUUAGAUGUAUUGUACUAAGUGAAACUUGUUAAAUAAAUCUUCCUUUUAAAAACUGGAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-667.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -710.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 579.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((.(((((....))))).))(.((.....)).)..(((.(((((((((....(((((((((((((....((((((((((((((.(((..(((((......((((.((((..((((.((((((((.(((((...((((((((...((((((((.(((...(((((..((((((.(((......))).)))))).))))).)))))))))))..)))..))))).(((((((((((.((((.((((.((..(((((...((((((((.....((((.(((.....)))))))....)))...)))))...)))))...)).)))))))).).))))))))))...(((((((((((((....(((.(..(((.((((((...(((((......)))))...))))..(((((((........(((.((((....)))).)))((((....((((..(((...((((....))))...))).))))....))))((((((((((((.((((...(((((((.........)))))))...)))).)......))))))))))).))))))).((((...((((..(((((((((((((((((...)))))))))..))))))))...))))...)))).....((((((...................)))))).))))).).)))...)))))))....))))))(((....((((((((((((........((((....((.((..(((((((....(((((.((((...........)))).))))).....))...)))))..)))).)))))).)))))))))).......))).))).)))).)))))).)))).....))))..))))....)))))))).)))))))).........))))))..((.((((..((((((((..(((((((.(((((((((.......(((((((((........(((.(((((((((((((((((.((.((...)))).)))(((((.......(((((((......((((....((((((.((...........)))))))).)))))))))))......)))))....))))))))))))...(.((.(((.....(((((((((((.....))))))..)))))......))).)).)((((.((........)).)))).........((((....))))((((.(((((....((((......)))).....))))).)))))).)))..((((((.(((..((((((((....((((.(((((((...(.((((((((((...))).))))...(((.((..(((((....)))))..)).)))(((((((((((.((((((((((((.((......)).)))))).((((.((((((((.((.(((........))).))..))))))))..))))))))))...))))).))))))))).)....)))))))))))...))))))))..))).)))))).((((.........((((.(((....)))..))))..........))))((((((.....))))))..)))))))))....))))))))))))))))..(((((((....)))))))..))))))))...)))).)))))))))))))))....))))).)))))))(((((((..((((((((...(((((.(((..(((((((((((..((.(((((((..((.....))..))))))....(((((..........))))).((((((..(((.((((((((...........((.(((((.......))))).))......((((((.....)))))))))))))).))))))))).)))..))))))))))))))))))))))))))).......((((((((((((((((((((((...........((((......((((.(((((((....)))))))...))))......)))).)))))))))......(((........)))..))))))))))))).))))))).....(((((..((........))...)))))))))))))).....(((((((((((..((((((((((.((((....(((((.(((.(((((..(((((((..((((..((.......))..))))..)))))))..)))))))).)))))...)))).)))))..........((((.((((..((.((((...))))))..)))).)))))))))..)))))..))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((((((.(((((....))))).))(((({{.((((((((((({((,(({{,,..{{{,{,,,,{,{,.......}}}..{(((((((.(((,.(((((......((((,((((..((({.(((((({(.(((({.,.((((((((...((((((((.(((...(((((..((((((.(({......})).)))))).))))).)))))))))))..)))..))))).(((((((((((.((((.((((.((..(((((...((((((((..,.{((({.(((.....)))}}))},..)))...)))))...)))))...)).)))))))).),})))))))))...,(((((((({{{{....|||,|..,((,{,{(((,,.(((((.,,...)}))),,,))))..{{|||||....,||.{({.{(((....)))}.)}|((((....((((..(((...((((....})))...})).))))....)))){(((((((((({.((((...(((((((.........)))))))...)))).}......))))))))))}.},}}|||{(((({,.{(({{,(((({((,(((((((((...)))))))))..}}}}||||.,,|}},...,))).,.,,((((((......,....,.......)))))).,.|}|,|.|||,..}})))))..},)})|||(({...,|||{{{{{({{{....,,,|{(({,..,{(|{{,.{{({{{{..,.(((((.((((...........)))).))))).,,,,)},,.,}})).,)))),)}}}}),))))))))}}......,))),))).)))).)))))).}))).,...)))).}))))....)))))))).)))))))),.,))))),{{{(((({,.,,.....,,,,,|}}}},|||,..{(({,,,{|||...,,|||||,,,}})}},..)))))))}((((((((((((,{{.((.((...)))).}||(((((.,.{.,.(((((((......((((....((((((.((.,{,...,}}.)))))))).))))))))))).},},.))))),...)))))))))))))}}}}}({((({.,,.(((((((((((.....))))))..)))))..,.{,|{|{||{|{{{{.((,,......}}.}))).....||..((({....)))),|))}}}||.....,{{{.,({{{{|{...{((({{{.{{|||||{(((({((((((((((((((,,..{{{{{{{{,{|(((((((...,.(({(((({{{...}}}.)))}...(((.((..(((((....)))))..)).)))(((((((((((.((((((((((((.((......)).)))))).((((.((((((((.,{.(((........))).),..))))))))..))))))))))...))))).)))))),}}.,....))))))).{((((((((((((|.{(((((({.{{.((((...,,{...((((.(((....)))..))))..,}}...,.))))||.}))))))},,,|(({.{{|.,,}})}}..}})},.,,,,....||..(((((((....)))))))..))))))))))))))),||||,||,,}},,,,,}}})},,},)}},}}}}}}},}))))}||}|,...}}}||))))}}.(((((((((((..{(,.((((((..((....,))..))))))..,,(((((..........))))).((((((..(((.(((((((((((..{({{,,,,.,|||,....,.,|{{{{{|,...,))}))),,......,)))}}))))))).)))))))))..,,..)))))))))))......}}}}}}))),}}}}}}}{(((((((((((((((((((((...........((((......((((.(((((((....)))))))...))))......)))).))))))))).,..,,.||,.,.|,..,}),.))))))))))))}..||{|||.,{,,{{,,,.,||.}}}},,,))})})})})))))))))).....{(((({({(((,,((((((((((,({{{....(((((.{{{.(((((..(((((((..{((..((({{.,....)}))))},,)))))))..)))))})}.))))),,,)))),}}}}|.....,,,..((((.((((..((.((({...))))))..)))).))))})))}..)))))..)))))},.
Back