Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_020056.5
Sequence Length
1458 nt
GC Content
0.4698
ACAAUUGCUCUACAGCUCAGAGCAGCAACUGCUGAGGCUGCCUUGGGAAGAAGAUGAUCCUAAACAAAGCUCUGCUGCUGGGGGCCCUCGCCCUGACUGCCGUGAUGAGCCCCUGUGGAGGUGAAGACAUUGUGGCUGACCAUGUUGCCUCCUAUGGUGUGAACUUCUACCAGUCUCACGGUCCCUCUGGCCAGUACACCCAUGAAUUUGAUGGAGACGAGGAGUUCUAUGUGGACCUGGAGACGAAAGAGACUGUCUGGCAGUUGCCUAUGUUUAGCAAAUUUAUAAGUUUUGACCCGCAGAGUGCACUGAGAAAUAUGGCUGUGGGAAAACACACCUUGGAAUUCAUGAUGAGACAGUCCAACUCUACCGCUGCCACCAAUGAGGUUCCUGAGGUCACAGUGUUUUCCAAGUUUCCUGUGACGCUGGGUCAGCCCAACACCCUCAUCUGUCUUGUGGACAACAUCUUUCCUCCUGUGGUCAACAUCACCUGGCUGAGCAAUGGGCACUCAGUCACAGAAGGUGUUUCUGAGACCAGCUUCCUCUCCAAGAGUGAUCAUUCCUUCUUCAAGAUCAGUUACCUCACCUUCCUCCCUUCUGCUGAUGAGAUUUAUGACUGCAAGGUGGAGCACUGGGGCCUGGACGAGCCUCUUCUGAAACACUGGGAGCCUGAGAUUCCAGCCCCUAUGUCAGAGCUCACAGAGACUUUGGUCUGCGCCCUGGGGUUGUCUGUGGGCCUCAUGGGCAUUGUGGUGGGCACUGUCUUCAUCAUCCAAGGCCUGCGUUCAGUUGGUGCUUCCAGACACCAAGGGCUCUUAUGAAUCCCAUCCUGAAAAGGAAGGUGCAUCACCAUCUACAGGAGAAGAAGAAUGGACUUGCUAAAUGACCUAGCACUAUUCUCUGGCCUGAUUUAUCAUAUCCCUUUUCUCCUCCAAAUGUUUCUUCUCUCACCUCUUCUCUGGGACUUAAGGUGCUAUAUUCCCUCAGAGCUCACAAAUGCCUUUCAAUUCUUUCCCUGACCUCCUUUCCUGAAUUUUUUUAUUUUCUCAAAUGUUACCUACUAAGGGAUGCCUGGGUAAGCCACUCAGCUACCUAAUUCCUCAAUGACCUUUAUCUAAAAUCUCCAUGGAAGCAAUAAAUUCCCUUUUGAUGCCUCUAUUGAAUUUUUCCCAUCUUUCAUCUCAGGGCUGACUGAGAGCAUAACUUAGAAUGGGCGACUCUUAUGUUUUAGGCCAAUUUCAUAUCAUUCCCCAGAUCAUAUUUCAAGUCCAGUAACACAGGAGCAACCAAGUACAGUGUAUCCUGAUAAUUUGUUGAUUUCUUAACUGGUGUUAAUAUUUCUUUCUUCCUUUUGUUCCUACCCUUGGCCACUGCCAGCCACCCCUCAAUUCAGGUACCAACGAACCCUCUGCCCUUGGCUCAGAAUGGUUAUAGCAGAAAUACAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-421.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -448.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 283.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((...((((.(..(((((...)))))..)))))..((((((.........))))))....)))(((((((.(.(((((....))))).)..(((((..((((((((...((((((...(((((.((.....)).)))))))))))...)).(((((((......))).))))((((.....)))).......((((.......))))....((((.((((....((((((((((.......(((..((.((((((((.(((...((..((((((.....(((..(((((((((((.((((((((.((((((((((((.((((((((.(((((((((.....((((((((((((.....((((((((((((.....((((((..((((.(((((((.(............))))))))(((((.((((...((((((.((...(((((...)))))..............(((((....))))).((((((((.........))))))))..)).)))))).))))..)))))....(((..(((((.((....)).)))))..)))))))..)))))).....(((((((.(((..((((...))))....)))))).))))((.((((((((((((((.(((...........(((.((((((((.((..........)).)))).)))).)))((((....)))).......))).))))))..))))))))))))))..)))))))).)))))).)))))))))))))..)).)))...((((((((...)).))))))(((.((....))..))).(((((....(((.((((...)))).))).)))))..(((.((((((...(((((.......))))))))))))))(((((((.....(((((((((.((((.........(((....((((((..((..((((((((...((((((............((.((........))))...(((((....................)))))............................((((((...((((((.((......))))))))))))))...............((((..((.(((((.(((.((((......)))).))).))))).))..))))..))))))...))))))))..)).))))))...)))..)))).))).))....))))..)))))))............)))))))).)))))))))...(((.((...)).)))...........)))))))).))).......(((((....)))))))).))))).....))).......))))))...))....))).)))))))).))...)))..))))))).)))..)))))))).......))))))..)))))..)))))))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....{(((.,.((((.({{((((({..|}}}},.})})),.{(((((.........)))))}....,}}||||,,|}|,(((((....))))).,..(((((..((((((,{...((((((...(((((.((,....}).))))))))))).,,||.((({(({....,,)|}.}}}}(({(.....)))).,.....((((.......)))).|..((((.((((....((((((((((.......(,(..((.((((((((.(((...((..((((((.....(((,.(((((((,(((.((((((((.((((((((((((.(((((,{(.{,(((((((.....((((((((((((.,...,(((((((((((.....{(((((..((((.(((((((.(............,)))))))(((((.((((...((((((.{{..,((({,.,.}|||,,,...........,|{{|||..,}}}}}.{(((((((.........))))))))||)},)))))}.))))..)))))....(((..(((((.((....)).)))))..)))))))..))))))...,,{,,({{{.{((,.{{{{...,,,).,,.)))))).)))}{{.,(((({{((((,|{||{{{,(({{...,,..|||,|,||{....,})))))))..)))}|||((((((((({(({{{{(|....}},,,)))))).)))))))))})),,}))))..)))))))).))))))}}))))))))))))..}).}},...(((((({{...,}.))))))(((.((....))..))).(((((....(((.((((...)))).))).)))))..,{,{((((((...(((((.......))))))))))))}|(((((((.....{({{(((((.((((.......,.(((....((((((..((..((((((((...((((((......,,..,.{(,((........)),,...,..,,......,},...........|||,......,..,........|..........|||||,...(((((,,((......)))))))),,}}},....,,.........{(((,.((.(((((.(((.((((......)))).))).))))).)),,))},..))))))...))))))))..)).))))))...))).,)))).))).))....})))..))))))),...........)))))))).)))))))))...(((.{{...}}.))),|......,,.)))))))).))).......(((((....))))),)).))))).,...}}}.......)))))}...))....))).)))))))).))...)))..))))))).)))..)))))))).......))))))..)))))..,))))),....................
Back