Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021223.3
Sequence Length
612 nt
GC Content
0.5719
GACAGCAGCCACACCUCUGCAGAGAGAAUGGCCAGCAGGAAGGCGGGGACCCGGGGCAAGGUGGCAGCCACCAAGCAGGCCCAACGUGGUUCUUCCAACGUCUUUUCCAUGUUUGAACAAGCCCAGAUACAGGAGUUCAAAGAAGCCUUCAGCUGUAUCGACCAGAAUCGUGAUGGCAUCAUCUGCAAGGCAGACCUGAGGGAGACCUACUCCCAGCUGGGGAAGGUGAGUGUCCCAGAGGAGGAGCUGGACGCCAUGCUGCAAGAGGGCAAGGGCCCCAUCAACUUCACCGUCUUCCUCACGCUCUUUGGGGAGAAGCUCAAUGGGACAGACCCCGAGGAAGCCAUCCUGAGUGCCUUCCGCAUGUUUGACCCCAGCGGCAAAGGGGUGGUGAACAAGGAUGAGUUCAAGCAGCUUCUCCUGACCCAGGCAGACAAGUUCUCUCCAGCUGAGGUGGAGCAGAUGUUCGCCCUGACACCCAUGGACCUGGCGGGGAACAUCGACUACAAGUCACUGUGCUACAUCAUCACCCAUGGAGACGAGAAAGAGGAAUGAGGGGCAGGGCCAGGCCCACGGGGGGGCACCUCAAUAAACUCUGUUGCAAAAUUGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-214.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -225.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 204.7
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((...((((((.((.((((((((.(((((((((((((((((((....((((..(((((...)))))..)).(((((.((((((.....)).))))........(.(((((((...((........)).))))))).).((((((.(((((..(((......)))..)))))....(((((...)))))(((..((((.((.(((((((.....))))..))).)).))))..))).(.((((((...))).))).)..))))))..)))))))......))).))))))))))...)))...(.(((((((((((...(((......)))...(((..((((((..((.....((((.(.((((.((.....)))))).).))))...)).))))))..)))..).)))))))))).)....)))......))))))))..)).))))))((((....))))(((((....(((.(((.((((((..........((((...)))).((((.((.((((.((...(.((....)).)...)).).))).)).)))).)))))).))).)))))))).............)))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.(((((({..((((((.((.(((((((({{{{,(((((((((((((((,,,{((((..(((((...)))))..,,.{||||.,({(|(,,,,.}}..))},,.,{||.{|(((((((...{(,.......)).))))))},}.((({((.(((((..(({......)))..)))))....(((((...)))))(((..((((.((.{((((((....,))),.}))).)).))))..))).(.((({({...))}.})).)..}}})))..}}))))|.,,...|||.||}}}}}|||...|||...({((({{(((((,...(((......)))}.{((({.((({{{..|||,|,,||{|.,||||,.||,},,.))},.,)))))))}}|}|.,})))).,)))..,.)))))))))}....,}))}.,.,..})))))))..)).)))))){{((.,.,))}}(((((....(((.(((.((((((,|....,.,}((((...)))).((((.((.{{({.({...{.{{....}).,...)},),))),)).)))).)))))).))).)))))))).............})))))}..........
Back