Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021245.4
Sequence Length
1300 nt
GC Content
0.5346
ACAGCAGCUCAGUCCUCCAAAGCUGCUGGACCCCAGGGAGAGCUGACCACUGCCCGAGCAGCCGGCUGAAUCCACCUCCACAAUGCCGCUCUCAGGAACCCCGGCCCCUAAUAAGAAGAGGAAAUCCAGCAAGCUGAUCAUGGAACUCACUGGAGGUGGACAGGAGAGCUCAGGCUUGAACCUGGGCAAAAAGAUCAGUGUCCCAAGGGAUGUGAUGUUGGAGGAACUGUCGCUGCUUACCAACCGGGGCUCCAAGAUGUUCAAACUGCGGCAGAUGAGGGUGGAGAAGUUUAUUUAUGAGAACCACCCUGAUGUUUUCUCUGACAGCUCAAUGGAUCACUUCCAGAAGUUCCUUCCAACAGUGGGGGGACAGCUGGGCACAGCUGGUCAGGGAUUCUCAUACAGCAAGAGCAACGGCAGAGGCGGCAGCCAGGCAGGGGGCAGUGGCUCUGCCGGACAGUAUGGCUCUGAUCAGCAGCACCAUCUGGGCUCUGGGUCUGGAGCUGGGGGUACAGGUGGUCCCGCGGGCCAGGCUGGCAGAGGAGGAGCUGCUGGCACAGCAGGGGUUGGUGAGACAGGAUCAGGAGACCAGGCAGGCGGAGAAGGAAAACAUAUCACUGUGUUCAAGACCUAUAUUUCCCCAUGGGAGCGAGCCAUGGGGGUUGACCCCCAGCAAAAAAUGGAACUUGGCAUUGACCUGCUGGCCUAUGGGGCCAAAGCUGAACUUCCCAAAUAUAAGUCCUUCAACAGGACGGCAAUGCCCUAUGGUGGAUAUGAGAAGGCCUCCAAACGCAUGACCUUCCAGAUGCCCAAGUUUGACCUGGGGCCCUUGCUGAGUGAACCCCUGGUCCUCUACAACCAAAACCUCUCCAACAGGCCUUCUUUCAAUCGAACCCCUAUUCCCUGGCUGAGCUCUGGGGAGCCUGUAGACUACAACGUGGAUAUUGGCAUCCCCUUGGAUGGAGAAACAGAGGAGCUGUGAGGUGUUUCCUCCUCUGAUUUGCAUCAUUUCCCCUCUCUGGCUCCAAUUUGGAGAGGGAAUGCUGAGCAGAUAGCCCCCAUUGUUAAUCCAGUAUCCUUAUGGGAAUGGAGGGAAAAAGGAGAGAUCUACCUUUCCAUCCUUUACUCCAAGUCCCCACUCCACGCAUCCUUCCUCACCAACUCAGAGCUCCCCUUCUACUUGCUCCAUAUGGAACCUGCUCGUUUAUGGAAUUUGCUCUGCCACCAGUAACAGUCAAUAAACUUCAAGGAAAAUGAACUCAUUCUUCCUUUGAUAUUUGAGAGCAGAUGAAAGCCGAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-480 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -500.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 284.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((..(.....)..))))))))......((((.(((((..(((((((((.....((((((((..(((((((.((...(((((((((..(((.((((((.........((...((....(((((((.(((((((......(((.(((........)))))).(((((((......))))))).....)))))))((((....))))....)))))))....))....)).........)))))).))).)))..........))))))..)).)))))))..........((((((((...((((((((((......))).(((...((((.....))))..)))((((((((....))))))))((((((....))))))))))))).))))))))..((....))..(.((....)).)))))).)))...)))))))))(((((((((......((((((......((.(.((((((((.(((((.(((.....))).))))).)))))))).).))))))))..)))))))))......((((((...))))))(((((((((((..((((((.((((....((..((((((((((((.((((((....)))))).............((((((((((.(((.(((.((((((....))))))(((...((((........))))....)))((((((...))))))......................(((((.....))))))))..)))))))))).)))...((((((((((......((((..........))))........((((.((((...((((...)))).)))).))))........................)))))))))).........(((((((((((.(((((.((((.((((((((.(((..(........)..))).))).)))))...((((.(((..((((((((....(((....))))))))))).))).)))).....((((((((((.......))))))))))......))))...)))))...((((......))))........)))))))).))).....((((((......)))))).)))))..))))..)))))..))))..).)))))..)))))))))))..)))))))))....((((.(((....)))..((((((((((((((...(((((........)))))...)).)))))).((((((((((((....)))).)))).)))).......))))))........)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((..{.....}..))))))))......{(((.(((((..(((((((((...,.((((((((..(((((((.((...(((((((((..(((.((((((....,,...((...((,...(((((((.(((((((......(((.(((........)))))).(((((((......))))))).....)))))))((((....))))....)))))))....)).,..))..},,....)))))).))).}))..........))))))..)).)))))))....,.....((((((((...((((((((((......))),(((...((((.....))))..)))((((((((....))))))))((((((....))))))))))))).))))))))..((....))..(,((...,}).}))))).)))...))))))))){((((({{{.,.,..((((((......((.(.((((((((.{((((.(((.....))).))))).)))))))).).)))))))).,))))))))),..,.,((((((...))))))(((((((((((..(((((,.((((..(((.((((.(((,.(((..((((((....))))))..........,,.((((((((((.(((.(((.((((((....)))))}{{{...{{((.......,}}}}....}}}((((((...)))))}..|,..................(((((.....))))))))..)))))))))).))).,}{(((((((((.,,,,,((((..........))))....|}}}|(((.((((..{({....,).)..)))).)))}........................)))))))))},,....,}.,,))}.))))))).))).,}}},((((((((.(((..(........)..))).))).)))))..(((((((,.{{(((,((,({{{,((((.....})}))}}||,{{{((,({{.{{,((((((((({.......})))))))))}}.,.}))))))))))},|}|.|}}}}..}})}..,}}}....||||,|||{|}|,....((((((......)))))).}}})),.))))}..))))..}}}}..,.)))))..)))))))))))..))))))))),,..{{{{|(((,...}}}..{{{{{{{{{||||||.,{((({||,.....}}},....}}.}}}}}}.((((((((((((....)))).))))))}))..,,,,.)))))),,...,),})}).
Back