Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_030919.3
Sequence Length
2370 nt
GC Content
0.5076
GAGGGCUGUCGAGUCCGAGCGCCGCCAUGGCUCUGCUGUCCGAGGGCCUGGACGAGGUGCCCGCCGCCUGCCUGUCGCCGUGCGGGCCGCCCAACCCGACCGAGCUGUUCAGCGAGUCACGGCGCCUGGCUCUGGAGGAGCUGGUGGCGGGCGGCCCCGAAGCCUUCGCGGCCUUCCUGCGACGCGAGCGCCUGGCUCGUUUCCUGAACCCCGAUGAGGUGCACGCCAUUCUGCGCGCGGCGGAGAGGCCGGGAGAGGAGGGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGAGGACUCGUUCGGCUCCUCGCACGACUGCUCUUCGGGCACCUACUUCCCCGAGCAGUCGGACCUGGAGCCACCGCUGUUGGAGCUUGGCUGGCCCGCCUUCUACCAGGGCGCCUACCGCGGCGCCACGCGUGUCGAGACGCACUUCCAGCCCCGCGGCGCUGGCGAAGGUGGCCCCUACGGCUGCAAGGACGCUCUGCGCCAGCAGCUCCGCUCGGCGCGAGAGGUGAUUGCAGUGGUCAUGGACGUGUUCACAGACAUCGACAUCUUCAGAGACCUGCAAGAAAUAUGCAGGAAACAGGGAGUUGCUGUGUAUAUCCUUCUGGACCAGGCUCUCCUCUCUCAAUUUCUGGAUAUGUGCAUGGAUCUGAAAGUUCAUCCUGAACAGGAAAAGUUAAUGACAGUUCGGACUAUCACAGGAAAUAUCUACUAUGCAAGGUCAGGAACUAAGAUUAUUGGGAAGGUUCACGAAAAGUUCACGUUGAUUGAUGGCAUCCGCGUGGCAACAGGCUCCUACAGUUUUACAUGGACGGAUGGCAAAUUAAACAGCAGUAACUUGGUAAUUCUGUCUGGCCAAGUGGUUGAACACUUUGAUCUGGAGUUCCGAAUCCUGUAUGCCCAGUCCAAGCCCAUCAGCCCCAAACUCCUGUCUCACUUCCAGAGCAGCAACAAGUUUGAUCACCUCACCAACCGAAAACCACAGUCCAAGGAGCUCACCCUGGGCAACCUGCUGCGGAUGCGGCUGGCUAGGCUGUCAAGUACUCCCAGGAAGGCGGACCUGGACCCAGAGAUGCCCGCAGAGGGCAAGGCAGAGCGCAAGCCCCAUGACUGUGAGUCCUCUACUGUUAGUGAGGAAGACUACUUCAGCAGCCACAGGGACGAGCUCCAGAGCAGAAAGGCCAUUGACGCUGCCACUCAAACAGAGCCAGGAGAGGAGAUGCCAGGGCUGAGUGUGAGUGAGGUGGGAACACAAACCAGCAUCACCACAGCAUGUGCUGGUACCCAGACUGCAGUCAUCACCAGGAUAGCAAGCUCUCAAACCACGAUUUGGUCCAGAUCGACCACUACUCAGACUGACAUGGAUGAGAACAUUCUCUUUCCUCGAGGAACUCAAUCUACAGAAGGGUCACCAGUCUCAAAAAUGUCUGUAUCGAGAUCUUCCAGUUUGAAGUCUUCCUCCUCUGUGUCUUCCCAAGGCUCUGUGGCAAGCUCCACUGGUUCUCCCGCUUCCAUCAGAACCACUGACUUCCACAAUCCUGGCUAUCCCAAGUACCUGGGCACCCCCCACCUGGAACUGUACUUGAGUGACUCACUUAGAAACUUGAACAAAGAGCGGCAAUUCCACUUCGCUGGUAUCAGGUCCCGGCUCAACCACAUGCUGGCUAUGCUGUCAAGGAGAACACUCUUUACUGAAAACCACCUUGGCCUUCAUUCUGGCAAUUUCAGCAGAGUUAAUUUGCUUGCUGUUAGAGAUGUAGCACUUUAUCCUUCCUAUCAGUAACUGCUCCGUGUUCAGACUCCUGGUUUCUUCCAGGCUUACAGUGGACAUCAUCAGCUUCCUGCUUUAAAAAAUAUCUUAUGUCCCUAAUUGCCUUUCUUUUACCUGACUUUGUCACCUUUGUUGUCUUUGAAUUCUUUAGGCUGCAUAUUAUUUUACAUGCUUUGUUUUGUCAUGUAUAUACCAGGUAUUGGUUUUAUGGUUUAAACACUAUGGAUACAGGGGUUUGUUUUGCACAAUUUUAAUAGUCAUGCACUACAUAAUGAUGUUUUGGUCAAUGACAGACCACGUAUAUGUUGGCAGUCUCAUAAGAUUAUAAUACUGUAUUUUUACUAUACCUUUUCUGUGUUUAGAUACAAAUACCAUUAUGUUACAGUUGCCUACAGUAUUCAGUGCAGUAACAUGAUGUACAGGUUUGUAGCCUGUUUUGCAUUUUUCUUAGGUUGUAUGCUCUUCUGUUUUAAAGGUUUGAAUCACCAGCAUUUUUGUGAUCAAAAUCCUAUUUAGAAAAAAUAAAACUACUUUCUGUUUAUCUCUUUAGAAUAUCUGUGUUCUUAGCAUUAAAUAAAUAUAAACUUGUGCUUCUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-794.8 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -840.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 527.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((((.((((((..((((((((..((..(((((.(((..(((((((..(.((((((((.(((.(((((((((((((((((((...((.(((.((((.(((...((((((.......))))))..))).))))))))).))))))))).....(((((.(((((((.((((((.((((((.....)))))).))....(((.......)))((.(((......))).)).)))).))))))).)).)))...))))))))))))))))))))).).....)))))))((((((..(..(((((((((...(((.........))).)))))))))..)..))))))...))).)))))))..))).((((.((((((..((((((((((......))))))..((((......)))).......(((....))).)))).))))))))))...((.(((((((..((.((((((((((((......))).))))).))))))..))))))).)))))))..))))))...))).)))))))))))(((((((((((.......))))))(((((((((((..(((.(((..((..((((((((((((((((((((((..((((((((...((((.((((.((((((...(((((((....))))........)))...))))))))))))))(((....)))..((((((.(((..((((((.(((((.....(((((((((............((((.((((((.(((((((.((....)).))(((.............))).))))).))..)))).))))....(((((((...........)))))))...))))).)))))))))..))))))..))).)))))).(((((((..(((...(((((.((((((.(((.(((.......)))))).....)))))).........(((.(((....((.((((...(((.(((((...)))))..))))))).))...))).)))...)))))........((....)).)))))).))))..))))))))((((.....))))..((((..(((((((((...((.(((.((((.((((.((((...((..((((....))))..))...))))))).).)))))))..))....)))..))).))))))).(((.....)))...)))))))))).))).((..((((((((.(((((.(((.........))).).))))))))((.(((.(((((.....(((....)))...))))).))))).....))))..))......)))))))))..))....))).)))........(((.((((....))))..)))..(((...))).....((((((((((...((((((.((((((((.((((((((((.((((......))))))))...((((((((((...(((.((...(((((.(((...((.(((((((............))))))).)).))))))))..))))).....((((.(((((((.......((....)).((((((.(((((((...)))))))....(((((((..((((((............(((((.........))))).........((((((..(((..(((((((.......((......))......)))))))...))).)))))).....((((((.....))))))(((((.(((.((((........))))....))).))))).))))))..)))))))...(((((......)))))..))))))((((((....(((.....)))..............))))))....................((((...))))....(((.((((...........)))).)))........(((((((........).))))))....)))))))))))...((((((......))))))))))))))))..(((..((((..(((.....)))..))))..)))...((((......))))...(((((....(((((.((..(((((...(((....)))...)))))......)))))))....))))).....)))))).....(((((((((((...(((((.........)).)))))))))))))).(((((((...)))))))...))))))))...))))))...))))))))))(((((((((((((.((((..........)))))))))..)))..)))))............))))))))))).)))))..((((((....)))))).(((((.................)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.(((((((..(((((((((.((((((........))))))))).}..)))))((((((((.(((.(((((((((((((((((((...((.(((.((((.(((...((((((.{....,))))))..))).))))))))).))))))))).....(((((.(((((((.((((,,,((({((,..,,||}}||.,|,,...........}))|||.{||,.....))),))})))).))))))).)),}))...)))))))))))))))))))))....)))))))..)))).))))...(((((((((...(((.........})).)))))))))(((..((((.....((((.(((.((((((((((.((((((((..,,,{((((((......))))))..((((......))))....{{{((({...)),})))).)))))))).,,..((.(((((((..((.((((((((((((......))).))))).))))))..))))))).))...|}.{(((((....}}}},,},,,,.((((((({((((((.......))))))....,(((((..{(({.(,...{((....)))}}})}}.))))),},,...})))))}),}|||{.|{{(.((((({...(((((((....}))}........)))...))))))))}))}}}{{{....}}}..{(((((.(({..((((((.((((({....{(((((((({,{....,},,,((((.((((((.((((((({((..,,||,||,......}}}...}}}),.)))))).)}.,)))).)))).,,.(((((((...........))))))).,.})))).)))))))))..))))))..}}),)))))).)))).))))))))).))))......)))).))),......((((,.{((,,((((((((({..(((..(((.(((....((.((((...(((.(((({...}))))..))))))).))...))).)))..))).,)))},......{{{((..,,,,,.))))),,.,{|{{{{({{{.,,,.))}}|.{(((((,,({(((((((.{({..({{,,(((((.(((...}))))))}....}}).))}((((((.{(((((((({,{,{{{||,((((((((.((((..{{{(.(((((({(((({{((((((((((((.((((((.(({,..((((.(((((.(((.........))).).)))))))).,,.)).)))))}...{({{(((.{((........))).))}.,,},,........,,,,(({{{,,,,,,)}}}}..,,((((((((....(((.((((....))))..)))..(((((.(((....((((((.(({.,....,.}},.......))))))..))).))))))))))))),))....))))))){.(((({...})))).}(((((.(((.,,{(.(((((((............))))))).))}))))))))..)))})}}..{(({.,....}|||....,}}},}}}))..))))..}))))))...|.....,....{((((((..((((((,,,....{{{{.(((((,,{,{(,..{((((..........))))),..,|}}|{{(((({(....}||}},.,,||....,.,,,})|{{..,,...,)))....,}}||{||}}...,))))|(((((.(((.((,(,,......))),..)}))).))))),})))))..)))))))...(((((......)))))....}}}}((((((....(((.....)))..............)))))).)))).))))))))......{|{{...))),,},.,|},}}}},}}.........)))))).........(((((((........).)))))).,.{{{|,,,.,||,,((((((((......))))))))..}}))))))))))))))..{((((((..((.{.(((.{.(((((.,.{((,..{((((.......)))))))).))))).))))).))..))))))).......,((((((.,{(.{,{,......,},)).,))}))})..,,.(((((((((((...((({{.........}).)))))))))))))).(((((({...}))))))...{{{,.,..|...,).,},}))),,}||||{{{{{,(((((((,{((((.{,.....}.)))))))))..))}..,}}}}}......,,,,....,,.||||||..,||..{(((({....}))))).}}...,,,,,,.....,,)))))))))))))..
Back