Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_031431.4
Sequence Length
4555 nt
GC Content
0.4167
GCAGUGUUGGAAGCUCCGGUUCUCCCGGAAGUGGCCCAGGUCUCUCUGUCGGGGUCCCCUCCAUCUCGCUGCUGCUGAAGGCCGCGAGGGCGGCGGCGAUGGCGGAGGCGGCGCUGUUGCUGCUGCCUGAGGCGGCGGCGGAGCGGGACGCUAGGGAAAAGCUGGCUCUCUGGGAUCGGAGACCGGACACGACGGCGCCGCUGACCGACAGGCAGACGGACUCGGUAUUGGAGCUGAAGGCGGCGGCAGAGAACUUGCCGGUGCCAGCUGAGCUUCCAAUUGAAGACUUGUGCAGUUUAACAUCCCAGUCACUGCCCAUUGAACUGACUUCAGUAGUGCCUGAAUCUACAGAAGACAUUCUCUUGAAGGGCUUCACUUCCUUAGGAAUGGAAGAAGAAAGAAUUGAAACCGCACAGCAGUUUUUCUCAUGGUUUGCAAAGCUGCAAACUCAGAUGGAUCAAGAUGAAGGAACUAAAUAUAGACAGAUGAGGGAUUACUUGUCUGGGUUUCAGGAGCAGUGUGAUGCUAUAUUGAAUGAUGUAAACAGUGCUCUUCAGCAUCUGGAGUCUUUGCAGAAACAGUAUCUUUUUGUGUCCAAUAAGACAGGAACCCUACAUGAAGCCUGUGAACAGCUCCUAAAAGAACAGUCGGAACUUGUUGAUCUGGCUGAAAACAUUCAACAAAAGCUUUCCUAUUUUAACGAAUUGGAAACUAUUAACACAAAAUUGAAUUCCCCUACAUUGUCGGUGAAUAGUGACGGAUUUAUACCUAUGCUGGCCAAGUUAGAUGAUUGUAUAACAUAUAUCUCAUCUCAUCCUAAUUUUAAAGAUUAUCCCAUAUAUUUGCUGAAGUUUAAACAGUGUCUUUCUAAAGCUUUGCACCUCAUGAAGACAUAUACUGUGAACACACUACAGACCCUCACAAGUCAGUUACUGAAAAGGGAUCCUUCAUCUGUACCUAAUGCAGACAAUGCCUUCACAUUAUUUUAUGUGAAAUUUCGAGCUGCUGCCCCCAAAGUCAGAACUCUUAUUGAACAAAUAGAACUGCGGUCUGAAAAAAUACCUGAAUACCAACAACUGCUAAAUGAUAUCCACCAGUGUUACCUUGAUCAGCGGGAGCUCCUUUUGGGCCCUAGUAUUGCUUGCACUGUUGCAGAGUUAACCAGCCAAAAUAAUAGAGAUCACUGUGCCUUGGUUCGUAGUGGCUGUGCCUUCAUGGUUCAUGUCUGCCAGGAUGAACACCAACUUUACAAUGAAUUUUUCACAAAACCAACAUCAAAAUUAGAUGAGCUUUUGGAGAAACUGUGUGUGUCAUUGUAUGAUGUCUUCAGGCCAUUGAUCAUUCAUGUUAUUCACUUAGAGACUCUGUCGGAACUUUGUGGGAUUCUUAAAAAUGAGGUGCUUGAAGAUCAUGUGCAGAACAAUGCUGAGCAACUGGGGGCAUUUGCAGCUGGAGUCAAGCAGAUGUUAGAAGAUGUACAGGAGCGGCUCGUCUACCGAACCCACAUCUAUAUUCAGACGGACAUCACGGGCUAUAAACCAGCUCCUGGAGAUCUGGCAUAUCCCGAUAAGUUAGUCAUGAUGGAGCAGAUUGCACAGAGUUUGAAAGAUGAACAGAAGAAGGUACCUUCAGAAGCUUCAUUUUCAGAUGUUCACUUAGAAGAAGGAGAGUCUAACAGUCUGACAAAAUCUGGUUCAACAGAAUCCCUCAAUCCUAGACCACAGACCACAAUUUCUCCAGCAGAUCUUCAUGGAAUGUGGUAUCCUACGGUUCGAAGAACUCUUGUCUGUCUCUCCAAAUUAUACAGAUGCAUAGAUAGGGCAGUGUUCCAAGGAUUAUCACAGGAAGCAUUGUCUGCCUGCAUUCAGUCCUUACUUGGAGCGUCAGAGUCUAUCAGCAAAAACAAGACUCAGAUUGAUGGACAACUUUUCUUAAUUAAGCACCUUUUGAUACUUCGUGAACAAAUUGCUCCAUUUCACACUGAAUUCACCAUUAAGGAAAUUUCCCUGGACCUCAAGAAAACUAGAGAUGCAGCAUUUAAAAUCCUGAACCCUAUGACUGUCCCAAGAUUUUUUAGGCUGAAUAGCAACAAUGCCUUGAUAGAGUUCUUGUUGGAGGGUACUCCUGAGAUAAGAGAACAUUAUCUUGACUCUAAAAAAGACGUAGACCGUCAUCUGAAAUCGGCCUGUGAGCAGUUUAUUCAGCAGCAGACCAAGCUGUUUGUAGAACAGCUGGAGGAGUUCAUGACAAAGGUUUCAGCGUUAAAAACAAUGGCCAGUCAGGGAGGCCCCAAGUAUACUCUCUCACAGCAGCCUUGGGCACAACCAGCAAAGGUCAAUGACCUUGCGGCAACUGCAUAUAAGACAAUAAAAACAAAGCUGCCUGUGACAUUGAGAAGUAUGUCCUUGUACCUAUCCAAUAAAGAUACCGAGUUCAUCUUGUUUAAACCUGUGAGGAAUAAUAUUCAGCAAGUCUUCCAGAAGUUCCACGCUCUGUUAAAGGAAGAGUUCAGCCCUGAAGACAUCCAGAUCAUUGCCUGUCCAUCUAUGGAACAGCUGAGCCUUCUGCUGUUGGUUUCUAAAUAAGCAGGCCAGCCGGGCUGUGCACCUAAAUGUCUGUCUGGGAGGAGCAGGCUGAGAAGUCUUGCAGUCUGCAGGACACCGAGGAAUCGUAUGUGGGAACGUCCCCGAGAACCACACGAGCGUGCUGCUCAGUGCUGACUGCAGAAUGAAAUAGAAGCAAAGUGUUACAGGAUCAGUGUUUUCUUUUCUAAAACAUCAAAAUGCCAAAGAUUAAUCUGUGAUUGGUGAUAACUGCCUCGUUUAAAUGGUCACAAGAAAUGUGAAGAGAGAGCUAGGGCAGACAUGCAGUGAAAUGGUUCUUUGUUAAAAAUGUGCAAUAAAAAUAGAUUACAAUAAGUAGUGCAAAGAACUUUACAGAAAUCAAGCGAAUUAGAAGGCCUGUAAGAGUAAGGUUUGCUAAAACGUGAAACACUGUAACACUUUUAACCACUGAGCAUUCCACAGUGAAAUGUUAUUUCUAUGCUCUUAUUUAAUGUAAUGUUUCUCCUGUCAUUUUUGAAGUUGAGUUUGGAGUAGAUUGGUUGCUUCUGAGAACACAUUCUGCCUUCCUGGGAAGUCGGGGUGUCAUCCUUUCCUCUGUUUGAUGUGAGGUAGUUUAAAGAUACAAGGACUUUGUGUGAAGCUCCAGCAUCUGUGCCCCUUGAAUUGCUUAGGUGCAGACAGUUCUAAAGCAAGGAGCUGCAGCAUUCUCAUCAUAGAUACGUGCAGUAUCUUUAAUGAGUAUCUUCAUGGUAUGAUAGUGUGUGUUUGUGAGUGCGAAGUACCAAUUAAGGUGUCUUAAAUUUGGCGCAUAGAGGAGAGAAGGAAACCUGAGGAGUAGUGUUCCUCCUGAAUGAAGGUUCAGGUCACCAGCCUUCUGUACACUGCCUUUGGUUUUAGCAGUUCUUUGAAAAGCAAACACUUUCAUGUCCUGUCUAUUCAUUCAGCUGGCUGUGCUGUGCUGUGGACCAGCUGUGUGGAUCUCUAGCCCAGCUACAGCAGAAUACAUUUUACCAGCAAACCUAAGGAUGACAAACACUAUCCACAUCUGAAAACUACCACACCAUAUCAGGGAUCAUAAAUUAUGCAUAUCUAUGAAUUUUCCAACAAAUUCCUACUUCCUGAUUGGAUUGGUUUUGCCGCUGAUGUUAAGGCAGCCAGCUUCUUAGUUCAAAAAGAAUUCUGAGUUUUUCAAACACUAGUCUAGAGGUGGACAUUGUCAGGGGUUCUGGAAUGGGACCAGGGGACCUUUUGGUGCAGUGGGUGCCUGUAACUCAUUAGACGUACUGAGGCAGCACUUCUGCAGGGUGCAUACCCUGAUUGUUGUCAUUUGUAACAGGUCACUUCCUUUUCACUCAGUUUAAAUUGGUGAUGGACGUUGCUUGAUUGAGCUUAUUACUCUCUAUUUUGAGAAGGUAGAAGGUAAGAGGGCCCAUAUUCAUUCUUUGCCAUGAAAUGAAUGAAUUAGGAAGAUUGUAUUUACUUAACUGUUUUUUAAAUACAUGUUUAAUGAAAUAAACUGUAAAAUAUCCAGUUUUGUGUAUUAUAUGUACAUUUGAUUUUUAAUAGCCUUUCCAAAGAAAUGAGGGCAUGAUUAUUGUACAGUAAGUACGUGACUGAUUUAAUUUGAUUUACAGAGCGGAGUGUGUUCUUAUAAAAAUAUUUAAUGACAUUGGUUCUUGUCUUUUGAUCUUUUAUUUCUGAAACACUCAAACACCUUACAAAGUGCUGAGUAGGUAAUAGUGACCCAACUUGUUUGCUAAAUGAUUAUUUGUUUAAAUCUGUACAGUUUUAAGUGUUCACUUAUACAAAGAGUGUAUAUACUUUCAAAUAAUUUAAAAUGCUUUAUAUUAUUUGGCUAGAAAUUGCUGUUUUUAAUAAAUGUGAAUUUUUUAAAAAUAAAGAUUUUUGCUUCCUACCUUGUCCUCACGUGUCUGAUACGUGUGUGCAUUCCUUGAGGAAAAUUUCUUUAAUUAAAAUUUUAAUUGAGAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1303.6 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1391.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 981.1
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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