Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_031476.4
Sequence Length
4583 nt
GC Content
0.5099
ACUCGCAUCCCAGGGCGUCUCCGGCUGCUCCUAUUGAGCUGUCUGCUCGCUGUGCCCGCUGUGCCUGCUGUGCCCGCGCUGUCGCCGCUGCUACCGCGUCUGCUGGACGCGGGAGACGCCAGCGAGCUGGUGAUUGGAGCCCUGCGGAGAGCUCAAGCGCCCAGCUCUGCCCGAGGAGCCCAGGCUGCCCCGUGAGUCCCAUAGUUGCUGCAGGAGUGGAGCCAUGAGCUGCGUCCUGGGUGGUGUCAUCCCCUUGGGGCUGCUGUUCCUGGUCUGCGGAUCCCAAGGCUACCUCCUGCCCAACGUCACUCUCUUAGAGGAGCUGCUCAGCAAAUACCAGCACAACGAGUCUCACUCCCGGGUCCGCAGAGCCAUCCCCAGGGAGGACAAGGAGGAGAUCCUCAUGCUGCACAACAAGCUUCGGGGCCAGGUGCAGCCUCAGGCCUCCAACAUGGAGUACAUGACCUGGGAUGACGAACUGGAGAAGUCUGCUGCAGCGUGGGCCAGUCAGUGCAUCUGGGAGCACGGGCCCACCAGUCUGCUGGUGUCCAUCGGGCAGAACCUGGGCGCUCACUGGGGCAGGUAUCGCUCUCCGGGGUUCCAUGUGCAGUCCUGGUAUGACGAGGUGAAGGACUACACCUACCCCUACCCGAGCGAGUGCAACCCCUGGUGUCCAGAGAGGUGCUCGGGGCCCAUGUGCACGCACUACACACAGAUAGUUUGGGCCACCACCAACAAGAUCGGUUGUGCUGUGAACACCUGCCGGAAGAUGACUGUCUGGGGAGAAGUUUGGGAGAACGCGGUCUACUUUGUCUGCAAUUAUUCUCCAAAGGGGAACUGGAUUGGAGAAGCCCCCUACAAGAAUGGCCGGCCCUGCUCUGAGUGCCCACCCAGCUAUGGAGGCAGCUGCAGGAACAACUUGUGUUACCGAGAAGAAACCUACACUCCAAAACCUGAAACGGACGAGAUGAAUGAGGUGGAAACGGCUCCCAUUCCUGAAGAAAACCAUGUUUGGCUCCAACCGAGGGUGAUGAGACCCACCAAGCCCAAGAAAACCUCUGCGGUCAACUACAUGACCCAAGUCGUCAGAUGUGACACCAAGAUGAAGGACAGGUGCAAAGGGUCCACGUGUAACAGGUACCAGUGCCCAGCAGGCUGCCUGAACCACAAGGCGAAGAUCUUUGGAACUCUGUUCUAUGAAAGCUCGUCUAGCAUAUGCCGCGCCGCCAUCCACUACGGGAUCCUGGAUGACAAGGGAGGCCUGGUGGAUAUCACCAGGAACGGGAAGGUCCCCUUCUUCGUGAAGUCUGAGAGACACGGCGUGCAGUCCCUCAGCAAAUACAAACCUUCCAGCUCAUUCAUGGUGUCAAAAGUGAAAGUGCAGGAUUUGGACUGCUACACGACCGUUGCUCAGCUGUGCCCGUUUGAAAAGCCAGCAACUCACUGCCCAAGAAUCCAUUGUCCGGCACACUGCAAAGACGAACCUUCCUACUGGGCUCCGGUGUUUGGAACCAACAUCUAUGCAGAUACCUCAAGCAUCUGCAAGACAGCCGUGCACGCGGGAGUCAUCAGCAACGAGAGUGGGGGUGACGUGGACGUGAUGCCCGUGGAUAAAAAGAAGACCUACGUGGGCUCGCUCAGGAAUGGAGUUCAGUCUGAAAGCCUGGGGACUCCUCGGGAUGGAAAGGCCUUCCGGAUCUUUGCUGUCAGGCAGUGAAUUUCCAGCACCAGGGGAGAAGGGGCGUCUUCAGGAGGGCUUCGGGGUUUUGCUUUUAUUUUUAUUUUGUCAUUGCGGGGUAUAUGGAGAGUCAGGAAACUUCCUUUGACUGAUGUUCAGUGUCCAUCACUUUGUGGCCUGUGGGUGAGGUGACAUCUCAUCCCCUCACUGAAGCAACAGCAUCCCAAGGUGCUCAGCCGGACUCCCUGGUGCCUGAUCCUGCUGGGGCCUGGGGGUCUCCAUCUGGACGUCCUCUCUCCUUUAGAGAUCUGAGCUGUCUCUUAAAGGGGACAGUUGCCCAAAAUGUUCCUUGCUAUGUGUUCUUCUGUUGGUGGAGGAAGUUGAUUUCAACCUCCCUGCCAAAAGAACAAACCAUUUGAAGCUCACAAUUGUGAAGCAUUCACGGCGUCGGAAGAGGCCUUUUGAGCAAGCGCCAAUGAGUUUCAGGAAUGAAGUAGAAGGUAGUUAUUUAAAAAUAAAAAACACAGUCCGUCCCUACCAAUAGAGGAAAAUGGUUUUAAUGUUUGCUGGUCAGACAGACAAAUGGGCUAGAGUAAGAGGGCUGCGGGUAUGAGAGACCCCGGCUCCGCCCUGGCACGUGUCCUUGCUGGCGGCCCGCCACAGGCCCCCUUCAAUGGCCGCAUUCAGGAUGGCUCUAUACACAGCAGUGCUGGUUUAUGUAGAGUUCAGCAGUCACUUCAGAGAUGUAUCUUGUCUUUGUCAGGCCCUUCGUCUUCAUGGCCCACCUGUUUUCUGCCGUGACCUUUGGUCCCAUUGAGGACUAAGGAUCGGGACCCUUUCUUUACCCCCUACCCGUUGUGGCUCCCACCCUGCCUCGGACUGGUUUACGUGUCCUGGUUCACACCCAGGACUUUUCUUUGCAAGCGAACCUGUUUGAAGCCCAAGUCUUAACUCCUGGUCUCGUAAGGUUCCACUGAGACGAGAUGUCUGAGAACAACCAAAGAAGGCCUGCUCUUUGCUGCUUUUAAAAAAUGACAAUUAAAUGUGCAGAUUCCCCACGCACCCGAUGACCUAUUUUUUCAGCCGUGGGAGGAAUGGAGUCUUUGGUACAUUCCUCACCGAGGUUAGCAGCUCAGUUUGUGGUUAUGAAACCGUCUGUGGCCUCAUGACAGCGAGAGAUGGGAAUACACUAGAAGGAUCUCUUUUCCUGUUUUCGUGAAACGACUCUUGCCAAACGUUCCCGAGGCGCCAAGGAGUGUAGUACACCCUGGCUGCCAUCACUCUAUAAAAGUGCUUCAUGAGCCCAGACCAAAAGCCCACAGUGAAAUGAAGUACCCUUUUGUAAAUAGCAUUUUUUUGCAGAAGGUGAAAAUUCCACUCUCUACCACCGGGCCAGCCAAUAGAUCACUUUGGUGAAUGCUAGUUUCAAAUUUGAUUCAAAAUAUUUCUUAGGUGAAAGAACUAGCAGAAAGUCAAAAACUAAGAUACUGUAGACUGGACAAGAAAUUCUACCUGGGCACCUAGGUGAUGCCUUCUUUCUUUGAUUGCCUUUCUAAUAAAUGCAGAAUCUGAAGGUAAAUAGGUUUAAAACAAAACAAAAACCCACCCCUUUAAGGAGUUGGUAAAAAGCAGUUCAACUCUUAGCUUGACUGAGCUAAAAUUCACAGGACUACGUGCUUUGUGCAUUGUAGUCUAGUCGUAAUUCAUAGGUACUGACUCCUCAGCCCCAAAUGUCGGAGAGGAAGAAUUCGGUCAGCCUGUCAGGUCGUGAGUCCAGUUACCACCAAACAUCUGGGAAACUUCUGGGUGCUGGGUGCUCUGCUGCUGGACUUUUGUGGCUGUGUCUGUGUCUGCAAGAUAAAUUAGAUCGCCCUGUGGGGUUUGCAGAAUUAGUGAAGGGUCCAGGACGAUCCCAGUGGGCUCGCUUCCAAAGCAUCCCACUCAAGGGAGACUUGAAACUUCCAGUGUGAGUUGACCCCAUCAUUUAAAAAUAAAGUCCCCGGGUUCCUUAAUGCCUCCUUCACUGGGCCUUCCUAGCAGGAUAGAAAGUCCUUGCCCAGAGCAGGACCUGGCUGUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUCCCGAGACCAAGUUUCACUCUGUUGCCCAAGGUAGAGUGCAGUGGCGUGAUCUCUGCUCAUUGCAACUGCCGCCUCCCGGGUUCAAGCAAUUCUCAUGCAUCAGCCUCCCAAGUACCUGGGACUACAGGCGUGAGCUACCAUGCCCGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCAUUAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUUACCUCAGGUGAUCCACCCACCUUGGCCUCCCGAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACUGCGCCCGGCCAUGGACCUGGCUGUCUUUAUCAUCCCCACAAACAUUUUGAAACUGGAAUAUUUGUCUUCAGAAAAUGGAAACAAGACUAUAAAUGAUAAGCCCUGUCCCUAGCACCACCUCUCCUGUGUGUGGAAUAGAGGCCCCUCGUGCUACCAACACUUACCCUGUGUUUAAAAAGAUCUUGUACCAAGCCAACGGCGUUCCUGGCUCUCCUGCCCACAGGAUGAACAUUUUCGGCUUCCUUAGGAGUUUUGCCCUACCGUAUUCCAAAGCGUGUGCUGGUUUCUCAUAUUGUCUGUAGGCUCACUCAGCCCGCAGUUUAUGUGUGUGCUUUUUUCUAUGAAAAAUGAUGUAUUUUGCUACUUCCUGUGUACAAAGUUUUAUUGUAAAUGUUUUUUGUGCUUUGCAUGAACAGGGGCCACGUUGUUGCAAUUGUUUCAGUAGAACUGGUUUGAUUUCUAAAAUGUUCCUGUAACAUAUCUUUUAUGAACAAAUCUGAACAAUUUGUGAAAUAAAACAUUGAAAACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1558.1 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1643.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 1072.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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