Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032246.6
Sequence Length
3405 nt
GC Content
0.5336
GCUUUUCGCUCGGCAUUGCGGCCAGCCAGCCGGGCACUCGGGGGGCACGCGCGGCCACCGCUAGAGCUCUGCCCCCACCCCACCCGCCAGCAGGUCUGGGGUGGGGACCCAGGUGGGGGCUCCUGCAGCCACUGCCCGGUGCGGACCGCACGGAGCGACCCACUCCUCCCAGCACCGAGGAAGAAGCAACGGAGCCCUCAGCAGGCGACCGGCCUCCCCGCCCCUGACCACCCGCUUCCCGGCUGCCUUUGUGGCCGCAGCUUCUCGCCGCCGAGCCGAGGGCCGGCGGGGGCGCGGCGCGCACGGCCGAGCGAUGCCCAGCUCGCUGUUCGCAGACCUGGAGCGCAACGGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCGGAGGGGGAGAGACCCUGGAUGACCAAAGAGCCCUGCAGCUCGCGCUCGACCAGCUCUCCCUGCUGGGGCUGGACAGUGACGAGGGCGCCUCUCUGUACGACAGCGAGCCGCGCAAGAAGAGCGUGAACAUGACCGAGUGCGUGCCAGUACCCAGUUCUGAGCAUGUCGCCGAGAUCGUGGGGCGGCAAGGUUGUAAAAUCAAAGCGCUGCGGGCGAAGACCAAUACUUACAUCAAGACCCCAGUUCGCGGGGAGGAGCCUGUCUUUGUUGUGACGGGCAGGAAGGAGGAUGUGGCCAUGGCUCGGAGGGAGAUCAUCUCUGCUGCCGAGCACUUCUCCAUGAUCCGCGCCUCCCGGAAUAAGAACACGGCACUCAACGGCGCGGUGCCUGGGCCGCCCAACCUGCCCGGGCAGACCACCAUCCAAGUGCGGGUACCCUACCGCGUGGUGGGGCUCGUGGUGGGGCCCAAAGGCGCCACAAUCAAGCGCAUCCAGCAGCAGACGCACACGUACAUCGUGACGCCCAGCCGGGAUAAGGAGCCGGUGUUCGAGGUGACCGGCAUGCCAGAGAACGUGGAUCGCGCUCGAGAGGAGAUUGAGGCGCACAUUGCUCUGCGUACCGGCGGCAUCAUUGAGCUCACAGACGAGAACGACUUCCACGCCAACGGCACCGAUGUGGGCUUCGAUCUGCAUCAUGGGUCCGGCGGGUCCGGCCCAGGCAGCCUCUGGAGCAAGCCCACCCCCAGCAUCACGCCCACCCCCGGCCGCAAGCCUUUCUCUAGCUACCGCAACGACAGCUCCAGCUCGCUUGGCAGUGCUUCCACAGACUCUUAUUUCGGCGGCGGGACCAGCAGCAGCGCAGCGGCUACCCAGCGCCUGGCGGACUACAGCCCCCCUAGCCCCGCCCUGAGCUUUGCGCACAACGGAAACAAUAACAAUAACGGCAAUGGGUACACCUACACAGCGGGGGGAGAAGCCUCAGUGCCAUCCCCCGACGGCUGCCCCGAGCUGCAGCCCACUUUUGACCCGGCUCCCGCUCCCCCACCUGGGGCACCACUUAUCUGGGCCCAGUUCGAGCGGUCCCCGGGAGGCGGACCUGCAGCUCCGGUAUCUUCUUCCUGCUCUUCUUCUGCAUCUUCGUCUGCUUCUUCCUCCUCCGUGGUCUUCCCCGGGGGUGGCGCCAGUGCGCCCUCCAACGCCAACCUGGGGCUAUUGGUGCACCGCCGGCUGCACCCUGGCACCAGCUGCCCGCGCCUGUCUCCACCCUUGCACAUGGCCCCGGGGGCGGGAGAGCACCACCUGGCUCGCCGGGUGCGCAGCGACCCGGGUGGAGGAGGCCUGGCCUACGCCGCUUAUGCCAACGGGCUGGGGGCACAGCUGCCUGGCUUGCAGCCGUCGGACACGUCGGGCUCCUCCUCUUCGUCCAGCUCCUCCUCCAGCUCUUCAUCCUCUUCCUCCGGGCUUCGGCGUAAAGGCAGCCGCGACUGCUCCGUGUGCUUCGAGAGCGAAGUGAUUGCCGCGCUGGUGCCCUGUGGCCACAACCUCUUCUGCAUGGAGUGCGCCAAUCGCAUCUGUGAGAAGAGCGAGCCCGAGUGCCCGGUCUGCCACACCGCGGUCACUCAGGCCAUCCGCAUCUUUUCUUAAAGGCAGCGGGCGCUGCUAGUGCGCACCGUGCUGGGGGAAGGGGGAACCCCUCCCCACCCUCUUUCCCCAGCGCUCGCCUGCCUCCCUGGGUGCCCCCCCUCUCCCUUCUCCUUCCCGGCCCCACCAACACUCUGAGAUCCGAGAGGAGCUUGGAAAGCUGUAGUAUCCGCUCAUUUUUAAAAUUUAAUUUUUAAGUAAAGGAAUUUGCCAGGAUAUCUGCAUCAAGAGUACUGUAGCCUGGGAAACCUGAACACCUGAAAUGCAUGCUCUAUAAAUAAUAGGAACGGCGACAUUCUAGUAAUGAUAGUUUUUACACUGUACUUAAUAGGAAGCUUCCAAAAGAAGAAAACCCCACAAGUUUUCCAUUUUCUUAAAGUAGGAAAAAAUGAACAGUAAUAAUUAUGAUGAAGAUGAUAGUAGUGCUAUGGGAUGUGUGGACUGUUUAGUGUGUUCCCCUUUGUGGGUGGGUUCCUAUGAUACUUAUUAUAGAACACAGUGGAUCCUUUUUGAAUGUUCGUGGAAGGGCCAGGAGUUCCUGUGAAACCAGGAUACUGCAGCUUUAUUAAAGUUAAAGAAACUGUAACAUAUCUCUUAUAUAUUAAAAACGUUUAAAAGUUUUAAAGAGAAAUUGCAUUAAUACAGAUUGAAGUAUUUUAUUCUUUUUUGACUUGAAAAAUUAUAUUUCAUAUUGCAAAGAUGUUUACAAGUAUUUUAAUUUAAGUUCAGUGAACUUUUUUGUAGCUGGGUUAAAUCUUUUUAUUUUAGUAUGGCCUUAUGGCAAAGAACACUGUAUUAUUUUAAUAAUCACACAAUUGUGACGGAAUUACAACCAUAAAAUGUGUAAUGUUUUGAACAGUAUUCUGUUGGGAUGGAGAUUUUAUAGGUUCAGACAAAUCUUCUAGAUCUGCUUCACCCAGCAUAUUUUCUAUUCAGUGAUAUAAAGCAUAUUUUAUUCUAUAUUAUUACAAAAACGGAAAUGUAUAAACAUGUCAAAAAGAACUGUUGAUGCUUUCUAACAUUUGUAUAAAUAGAAUUCAGUGCAAGUUACAAAAAUUCUGUUGCACCACUCUAGUUUUAGUAUUUCUAUUUUAAUACAUUUGUUUACCACUUGUUUAUGUAUAUGUAGGUGAUGUUACUUGAGCUUAAAUGUACUUUACUGAGCAAAGUUUAAAAAACAAAGUAUAUUUUAUUUUAUGAUAAAGGGCCUUUAACCUCAUGGUCAAAUACUAAUAUUAUAUUUGCUGAGACAAGAUUUGAAAUUGUAUCAAGAGUUUUAUUUUUCUGACAUUUAAAGUUCUACAUAAUAAAGGUAAAACUUAAGUAAUGGUGCUACUUCAUUUUUUAAGUAUUUCUAUAUAAAUAAAAUAUUGAAGAAAAUCUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1266.4 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1326.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 787.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((.(((......)))))).....((((((((((((((((.(((.((((((.......((((((((.((.((((..((((((((.((((.(((((((((.....(.((((((((((.(..((..((.(((((((((((......((((.......)))))))..)))))).)).))..))..))))))))))).)((((.....))))))))))))).))))....))).....((((((.((((((((((.(((((.(((((((........)).)))))))))))))))(((.(((((.((((........))))))))).)))..........))))).))))))))))).)).)).)).))))).)))((((((((((((...((((.(((.(...((((......))))..).))).))))))))))).(((((((((((((...((((((((((.(((.((((...)))).))).)))((((((((((((.(((....((((.(((((((((((.((...)).))).))))).)))((....)).((((((((.((((.(((......(((((((((((((((.....................((((.......)))).(((((.((((...((((((...((((((((((.(..(((((((...((((((.((.(((.....))).)).)))))).((((((((.((.(((((((..(((...........)))........)))))))(((((((((((....(((((((.........((((((......((((........))))))))))(((((((((((((.(((....))).))))..((.((((((((((...((....)).((((.....))))...(((....)))....((.((((((..........))))))...))........))))).))))).))..(.((((((((((.(((((((...(((.....((((......(((..(((......)))..)))......))))....))).))))))).)))))))))).)..)))))))))))))))).)))))))))))...))))))).)))..........((.....))........)))))))..)))))).)).)))..)))))))))))))))...)))))).))))))))).................((((..(((...(((.((......)).))).)))..)))).(((........)))(((...((((((...((.((...)).))...)))................)))...))))))))))......(((((((.(..((....))..).)))))))...))))))))(((((((((.((.(((....(((((...((((((......(((((.(.(((......)))))))))...))))))...)))))))).))..)))))))))))))......))).)))))))))..)))..)))))))((((.(((((.((((((.((((.....(((((((((.(.(((.((((........((....((((.((((..((((((((...)).)))))).)))).))))..))..))))))).).))))))))).....)))).)))))).))))))))).(((((((.((((.(......).)))).)))))))(((((((...((((((((.......((((.((((.(((.((((.(((....))))))).))))))).)).))))).))))))))))))...))))))))......))))).............)))))((((.(((((((...(((((.(((...(((((((.......)).)))))..))).)))))))))))).)))).)))))).....(((((((.((((((.((((.....)))))))))))))))))...(((.(((((((((((.......)))).)).))))).)))...((((.(((((....)))))..))))((((.......))))...(((((((((((((((((............))))))))))))))))).))).)))).))))))))))))..((((((...((((......((.....))........))))...))))))(((((..((((((((((((((((((((..(((((((......)))))))...(((..(((.(((((....(((((..........)))))))))).))))))(((((((((((..((....(((((.....)))))....))....(((((.(((..(((((......)))))..))).)))))..((((.....))))......(((((....(((((((((((((...)))))))........((((...(((((.((....)).)))))..))))))))))..)))))....))))).))))))(((.....))))))))..(((((((....)))))))..((((((((.((((((((((....))).)))))))))).......)))))......)))))))))))))))....)))))..((((..((((((...((((((........(((((........))))).))))))..((((((((((((((..((((((((....(((...........))).....))))))))...((((((((.((((((....((((......))))...)))))).))))))))((((((.((((....)))).))))))...(((....)))........)))))))).........(((((....))))).((........))(((((((((((.((((((((((.((.....(((((((..(.((((((...(((((......)))))...)))))).)....)))))))......)).))))).)))))...)))))))))))(((((.((((.(((((...(((((.((((.((((..((.....))..)))).)))))))))....)))))))))))))).....))))))))))))....))))((.((((((((..((((((((((((........)))))............(((..(((((((.....(((((....)))))((((((((((((......((.((((((((((...)))).(((((.....)))))(((((((..((...(((.(((....))).)))..))..))))))))))))).))...(((..(((((((........)))))))....))).)))))).)))))))))))))..))).)))))))..)))...))))).))((((..(((((..(((......)))..)))))...))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((.(((......}}}}))..,,.((((((((((((((((.(((.((((((.......((((((((.((.((((..(((((.,,.((((.(((((((((,....(.((((((((((.{..((..((.(((((((((((......((((.{...,.)))))))..)))))).)).})..))..})))))))))).),(((.....))))))))))))).))))...,||,....,((((((.{(((((((((.((({({(((((((........))}}))))))))))))))(((.(((({{((((........))))))))).)))..........))))).))))))))))).)).)).)).))))).)))(((((((((({{...((((({((.....((((,,.{{.||||,,|||,,.{{{({,,,,,,.},,||||||||{{,,,((((((((((.(((.((((...)))).))).)))({((((((((((.(((.,.,((((.(((((((((((.{(...}}.))).))))).)))||....}}.((((((((.,(((({{,...,,.((((((((({(((((.,.......,,,.......,.((((.......)))).(((({{((((...((((((...((({((((((.(..(((((((...((((((,(({(((...}}))).)}.)))))).(((({{{{.{{.(((((((,.(((,........,.)))........)))))))((((((((({(....{{{{||||||||..,((.{(({.....|{(((,....,,,}}}}}})))))}}||||||((((.(((....))).))))..{{.((((((((({,,.{{....||.((((.....))))...(((....)))....{{.((((((..........)))))).,,)}.......,))))).))))).}}{{(.((((((((((.(((((((...((({{...((((......(((..(((......)))..)))......)))).}},})).))))))).)))))))))).).,}.||||}}|||}}}}}.))))))))))}.,,)}))))),}}).,,.,.....{{.....})........)))))))..))))))})).)))..)))))))))))))))..,)))))).))))))))).....,.........|{(({(,,(((...{((.((...,,.)),}}}.))).,)))).(({,,......))),{{,,.||||||},,||,{{.,,}||}....}),................)))..,|||,,,,)))...,.,(((((((.(..((....))..).)))))))..,))))))))(((((((((.((.(((....(((((...((((((......(({((((.(((......)))))))))...))))))...)))))))).))..))))))))))))}......))).))))))))),.}))..))))))){{{,,{{{((.((((((.(({{.....{((|((({(,(,(((,({((,,,.....,.....,{||}||||,,|||||{((,.,||,||||}|,}|||.}}}|.|||{,}||||||.|,||||||}}|.....))||.})))|),)))}}}}},.{{{||{|,||{|||,,.,}.}.)))).)))))))|||{{(({.,(((,,.,|,|{,....||{.{|||||{|.||||.{{|.,,,)}))}}),))))))}})).,,,)).))))))}}}}},.,,)))))))))}}),)))))}}},.....,,,,,}},,,((((.(((((((...(((((.(((...{((((((.......)).)))))..))).)))))))))))).)))).)))))).....(((((((.((((((.((((.....))))))))))))))))).|.(((.(((((((((((.......)))).)).))))).))),..((((.,((((....)))))..))))((((.......))))...(((((((((((((((((............))))))))))))))))).))).)))).))))))))))))..((((((...((((......((.....))........))))...))))))(((((..(((((((((((((((..{{{,.{((((((......))))))}...(((..(((.(((((....(((({..........)))))))))).))})))(((((((((({.,((.,,,(((((.....))))}...,))..,.(((((.{{{..(((((......)))))..}}}.))))).,((((.....))))......(((((....(((((((((((({...})))))),.......((({.{.(((((.((....)).)))))..)))),)))))..)))))....))))).))))))(((.....))),|,{((,{((((((....)))))))}}}.||.{((.(((((({{((....))}.}))))))))},|..,,})))}),...,.)))))))))))))))....)))))..{{{{..((((((...((((((.....,{,(((((........)))))}))))))..{(((((((((((((..((((((((.,{.{{{.,,,.......))),,,..))))))))...((((((((.((((((..,.((((......))))...)))))).))))))))((((((.((((....)))).))))))...(((....)))........)))))))}.........(((((....))))).((........)){((((((((((.((((({((((.((.....(((((((.{({(({{({...(((((......}))))..,)))))).)}}}})))))))......)).))))}.)))))...))))))))))|(((((.(((,{(((((...(((((.((((.((((.{((.....)},})))).)))))))))....)))))))))))))),....)))))}))))))....}}}}{{.((((((((..(((((({(((((........)))))......,,,,{.({(,,{{({(({.,.||{{|||...,})),,((((((((((((.,....((.((((({{{{,...,}}},{{({{...,,||||,|{{{{{|.,{(,..,{,.{{{....))),}}}..))..}})))},)))))).))..,{((..(((((((.,....,.)))))))..}}},},))))))}}}))))}}}})))..}}),)))))))..)),..}))))).}}{{{{,,{{{{{,{(((,,..||}}...})))),},})))))))}.....
Back