Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_033118.4
Sequence Length
2799 nt
GC Content
0.5970
ACAACUGCCCAGGACUGCUCCUGAGCAGCCGCUGGGAGACAGACGGCAACCAGGUUGCCCCUCUUUGCUCCAGCUAGAAAGACUUGAGUUAGACAAGCAGCAGCACACGCCUCCCUACCUCAUGGCGACAGAAAAUGGAGCAGUUGAGCUGGGAAUUCAGAACCCAUCAACAGACAAGGCACCUAAAGGUCCCACAGGUGAAAGACCCCUGGCUGCAGGGAAAGACCCUGGCCCCCCAGACCCAAAGAAAGCUCCGGAUCCACCCACCCUGAAGAAAGAUGCCAAAGCCCCUGCCUCAGAGAAAGGGGAUGGUACCCUGGCCCAACCCUCAACUAGCAGCCAAGGCCCCAAAGGAGAGGGUGACAGGGGCGGGGGGCCCGCGGAGGGCAGUGCUGGGCCCCCGGCAGCCCUGCCCCAGCAGACUGCGACACCUGAGACCAGCGUCAAGAAGCCCAAGGCUGAGCAGGGAGCCUCAGGCAGCCAGGAUCCUGGAAAGCCCAGGGUGGGCAAGAAGGCAGCAGAGGGCCAAGCAGCAGCCAGGAGGGGCUCACCUGCCUUUCUGCAUAGCCCCAGCUGUCCUGCCAUCAUCUCCAGUUCUGAGAAGCUGCUGGCCAAGAAGCCCCCAAGCGAGGCAUCAGAGCUCACCUUUGAAGGGGUGCCCAUGACCCACAGCCCCACGGAUCCCAGGCCAGCCAAGGCAGAAGAAGGAAAGAACAUCCUGGCAGAGAGCCAGAAGGAAGUGGGAGAGAAAACCCCAGGCCAGGCUGGCCAGGCUAAGAUGCAAGGGGACACCUCGAGGGGGAUUGAGUUCCAGGCUGUUCCCUCAGAGAAAUCCGAGGUGGGGCAGGCCCUCUGUCUCACAGCCAGGGAGGAGGACUGCUUCCAGAUUUUGGAUGAUUGCCCGCCACCUCCGGCCCCCUUCCCUCACCGCAUGGUGGAGCUGAGGACCGGGAAUGUCAGCAGUGAAUUCAGUAUGAACUCCAAGGAGGCGCUCGGAGGUGGCAAGUUUGGGGCAGUCUGUACCUGCAUGGAGAAAGCCACAGGCCUCAAGCUGGCAGCCAAGGUCAUCAAGAAACAGACUCCCAAAGACAAGGAAAUGGUGUUGCUGGAGAUUGAGGUCAUGAACCAGCUGAACCACCGCAAUCUGAUCCAGCUGUAUGCAGCCAUCGAGACUCCGCAUGAGAUCGUCCUGUUCAUGGAGUACAUCGAGGGCGGAGAGCUCUUCGAGAGGAUUGUGGAUGAGGACUACCAUCUGACCGAGGUGGACACCAUGGUGUUUGUCAGGCAGAUCUGUGACGGGAUCCUCUUCAUGCACAAGAUGAGGGUUUUGCACCUGGACCUCAAGCCAGAGAACAUCCUGUGUGUCAACACCACCGGGCAUUUGGUGAAGAUCAUUGACUUUGGCCUGGCACGGAGGUAUAACCCCAACGAGAAGCUGAAGGUGAACUUUGGGACCCCAGAGUUCCUGUCACCUGAGGUGGUGAAUUAUGACCAAAUCUCCGAUAAGACAGACAUGUGGAGUAUGGGGGUGAUCACCUACAUGCUGCUGAGCGGCCUCUCCCCCUUCCUGGGAGAUGAUGACACAGAGACCCUAAACAACGUUCUAUCUGGCAACUGGUACUUUGAUGAAGAGACCUUUGAGGCCGUAUCAGACGAGGCCAAAGACUUUGUCUCCAACCUCAUCGUCAAGGACCAGAGGGCCCGGAUGAACGCUGCCCAGUGUCUCGCCCAUCCCUGGCUCAACAACCUGGCGGAGAAAGCCAAACGCUGUAACCGACGCCUUAAGUCCCAGAUCUUGCUUAAGAAAUACCUCAUGAAGAGGCGCUGGAAGAAAAACUUCAUUGCUGUCAGCGCUGCCAACCGCUUCAAGAAGAUCAGCAGCUCGGGGGCACUGAUGGCUCUGGGGGUCUGAGCCCUGGGCGCAGCUGAAGCCUGGACGCAGCCACACAGUGGCCGGGGCUGAAGCCACACAGCCCAGAAGGCCAGAAAAGGCAGCCAGAUCCCCAGGGCAGCCUCGUUAGGACAAGGCUGUGCCAGGCUGGGAGGCUCGGGGCUCCCCACGCCCCCAUGCAGUGACCGCUUCCCCGAUGUGAGCCGCCUCGGAGUGUGGCCUGGAUCCAUCCUGCUAGCACCUCCCCAGACAGGGCUCCAGCCUGUCGGCCACACCCCAGACUCCAGGCCCCCGUUGAAGCCGCUCCCGGUUCCCUCCCCAGCUCCUCGUCUUUGAACUGCCGCCGCCGUGGUGACCCCUGCUUUGCCCCACUGGGAGAGUCCUUAGCCUGGGCCUCCUCCUAGCUGGAGUGCCAUGGCUGGGGGGUCUCAGCAUGUAGGGCUUCUGUGGUUGUGGAUGGGAGGCUCCUGGUGGGGCAGAAAGGCUGCAACGCUGAUUCCUAAGGCCCAGCUGCCAGGGAAGACAGAGCAGGCUUUGUGAGAGAGGACCUCCAUGCCCCCGCCACCUCCCCACUCCAGCAGAUAAGGCCGAGCCCACACCAUCUGGCCCAGGCUGGCCCCCACCCACCUUCCUUGCGACCACCAACACACAGGAACUCUGUGUGAGAGAGAGGGCGCCCAGCCCAGGCCUGGUGGAGGGGGAGGGGAGAAGCCAAGGGACACAGGAGACCACCCCCGAGCUUGCCUCAGGGCCAAGCCGGCCCAACCCAACCACUCGGGGCCCCCAUCUUGGGGGUCACCCAUGGCCUCAGAUGAUGGGGUCAGCAGGCCCAGGAGAAUUAGGAAGGCCAUGGGGCAGCCUCCAGUCUGCUCUCAGCUUGUGCCUUGUAAAUAAAUGUACAGGUUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1156.2 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1200.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 766.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.(((((....))))).))))..((((((((.(((((((.....(((((((((((((..((((.((((....)).)).)))).)))....(((((((...((((............)))).(((((..((((((((...(((((((.((.(((((...............((.(((....))).)).(((((((....(((((((((((((((.....))))(((((.(..............(((((.......(((((((((........(((((...(((((..((...))..))))).)))))(((((.....((((((..((....((....)).....))..))))))..)))))((.(((((((((((........))).)))))))).)).((.((((....))))...))(((..(((....))).))).....(((..(((((........)))))..)))..((((....))))......)))))))))......)).))).).))))).....))))))))).))...)))))))...))))).))...)))))))...)))).......)))).)))))....)))))))((((((((((((.((.(((((((.((((((.....))))))((((((..((((.........((((..(.(((((.((((((((..(((...................(((((.....))))).......((((.(......))))).))).)))))))).))....))).)..))))....(((..((((((...((((...))))..)))))).)))........((((((((((.((((((((...))))..)))).((((..(((.(((..((((((((....(((((.((((((((((((((((((.........((((.((((((((..(((.......)))..))))...)))).))))......)))).)).)).)))))))))).((((((((((...((((..((..........))..))))))))))))))))))))))))))).....))).))).))))(((((((.((((..(((((((..((((((((..((((((((..(((((....(((((((((((..((.((((.(.....(((.(((((((((((((.((.....)).)))....))))).).)))).)))..).))))....))..))))))))).)).((....((((((.....))))))...)).(((((((.(.((.((((....(((.((((((((((.((........)).)))))))))))))((((........))))........)))).)).))))))))((((((....(((.((.....)).)))...))))))...((.(((...))))).......)))))..((.(((((((((....))))))))))).(((((......))))).)))))))).))))))))....)))).......(.((((((.((((....)))).)))))).).(((((((.((((((.......)))))).((((.....(((((.((...((.(((((.(((((((..(((((.(((((((((.(((........((((...........))))..((((...)))).....))).))))))))))))))...).))))))))))).))...)).)))))...))))...((((((.((...(((.(((...(((....(((((((...((.(((.....((((((.(((.((..........((((.....)))).....((((.....))))...((((((((.(((.((....(((((.....))..))).....)).))).))))))))((((((((((((.((.((((((...(((..(((((.(.....(((((...)))))).)))))..)))......))))))...(((......))).))))))))))))))(((((((.((....)).))))))))).))))))))))))))(((((.......)))))..)))))))...))))))))).))))))))((((.(((((((((((.(((....)))................((((((.......)))))))))))).......)))))))))..........)))))))..((......)))))..)))).)))))))..))))).)))))))))..))))))(((((.(((....))))))))((((((((..(((((((........)))).)))..)))))))).))))).)).))..)))))))).))))((((((.((((((....((((((((((.((((.((((....(((.(((((..(((......))).)))))..))).)))).)))).)).(((.....))).....))))))))))))))...)))).)).....((((...((.....(.(((((.((..(((((((((...((.((((((((.(.((((((..(((((((.....))))))).......((((.....)))).))..)))).).)))))))))).((.((((.(((.....((...))..(((((((.(((.....(((((.....)))))....)))...)))))))((((((...))))))...))).)))).)).......))))))))).)).))))).).....))..))))..)))))))))))).)))))))))))))....((((.(((........)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((.(((((....))))).))))..((((((((.(((((((.....(((((((((({((..((((.((((....}).)).)))).))}...((....))....((((.((((.(((..((((.(((.....(((..{(..((((((((......(({{(..,{.........((.(((....))).)}.{{((|{.....{{||||(((((((((.....))))((((((((.,,.{{..,{....}}..||.,,...,,...{{......}}.(((((...(((((..{{...})..))))).)))))(((((.....((((((..((.,..((....))..,..))..))))))..)))))..)))))))).((((..((((((((((({{...,{(({,..{|||,.,{||||.||(|({,..{((.(,,.,(((((.....(((..(((((........)))))..))).((((((....((...(({{{(((((((((....,((((((.(.((((...{{{(,{{..(((,(({.....))).))),,))))...))))).)))),)}},.((((((((((,,((((((,.,((,((((({......|(({{{..,|{{|||.|(((((.....}))))}.{((((.......}}}}...{(({{..(.{{{{{.((((((((..(((.......,.......,.||(((((.....)))))..,,,.,{(((.{......}))),.))).)))))))).)),...}}}.)..)))).,.}|}}|.}||||..,....,}},|||{||,.,|||,||,...,}.|}}|{((((((({...|)))))))))||}|((({{((.((((((({{(((({{{{.((..,,,,,{||((((((((((((((((((...{((((....))))}.(((({.(,,......,,))},)}|}{{.{{||...)))}.}}.}))).)).)).)))))))))),}}}}}}))))))))|.,.||||..|||,,....||}}|||({|,..{{(({(((({{(((({(,{.........,{{{({.....,..}}...{(((.,,({((({{{{(,.,{{||{,,.}||||,..,}||(((((((((..((.{(((.{...|.(((.(((((((((({,{{(({....,,.,,}}}}}))))).}.)))).))),.}.))))....))..))))))))),||{,,..{{(((,,({.{{{,|||||{{{{|{.(((((((,,(,{((((.(({(((.((((((((((.((........)).))))))))))))),,||}.,}...))),)}}}}}}}},)),}))}),,)))).,|||,|}..}|||},,..}}}))})))}}})))))},..({.(({...}))))..,....}}}|}.,{{,(((((((((....)))))))))||.{||||,.,|,||||||.|}}},))),,}))))|}.,,,,}}}..,.}}})}|||,||,,||)))},)))}..,,}))}}.,})))))))})))}}))))))})))))))))).,...(((((.((...((.(((((.(((((((..(((((.(((((((((.(((.,,,.,,,({,{.....,,{{{{||}}..,|,|,}})))).....))).))))))))))))))...)}))))))))))).))...)).)))))))))).)))))))),..}}.))))))((....(((.....)))....)))))))|}|,.))).))).}|}})),.,,,.....((((.....)))).||,,((((.....))))...)),.}))))))))))..)))).............))))).|||||||.||{,|{((({((((((({{((({,((((((...,((..(((((((.(((((((......(((((.((((((........))))))....)))))....((((.(((.{.....,..))).))))..,........)))))))))))))){|{.{||}}|||||,,.....)))))}}.,},}}}...}}}|},|,|,,{||,||}},,|,((.((((((((.(((....})).,....,.........((((((.,....,))))))))))))))})))).}}.))))))))))..},|}|||.,..,))))}....))))))))))..))).,...))).))))((({(({((((((({,,...{{((.,,,|}((((.(((((((((..(((((((........)))).)))..))))))))).)))).,}|.|,.||||{((.(((((((.((.((((.((((((((((((((({.((((.((((....(((.(((((..(((......))).)))))..))).)))).)))),{(.(((.....))))}))))))|,||.(((((((.(((((.(({....(((,..|||....,,....||{{..||||||||{{,......,,,,,,,,.,........(((((((,...,))))))).,.,.,.})),},},})))..))}))).)))))))))))))).,...||...}},}.)))))).))..,,(((.(((((((....))||))))))))))).)))))))))..))|||||{||...,)))))))}})}))))),,|,......}|||||,.,.)))))..)))...)))).))))...)))))))))))).))))))))))))).,,,(({{(({{.......,))))))}.,..
Back